【第一百一十三期】AI+药物研发领域一周资讯
2024-02-03
蛋白降解靶向嵌合体紧急使用授权
前言AIDD Pro 根据国内外各大网站以及人工智能药物设计主流新闻网站及公众号，从 AIDD会议、AIDD招聘，重大科研进展、行业动态、最新报告发布等角度，分析挖掘了每周人工智能辅助药物设计领域所发生的、对领域技术发展产生重大推动作用的事件，旨在帮助 AIDD领域研究人员和业内人士及时追踪最新科研动态、洞察前沿热点。如果您觉得符合以上要求的内容我们有遗漏或者更好建议，欢迎后台留言。科研进展2024年2月2日【靶向蛋白降解】ACS Chem. Biol. | 利用Cullin E3连接酶接头蛋白SKP1进行靶向蛋白降解2024年2月2日【SARS-CoV-2】ACS Appl. Bio Mater. | 羟基磷灰石-金修饰的丝网印刷碳电极用于选择性SARS-CoV-2抗体免疫传感器2024年2月1日【分子动力学模拟】J. Chem. Inf. Model. | 基于异构多核架构的大规模分子动力学模拟2024年2月1日【FDA药物】J. Chem. Inf. Model. | 从生物和化学数据洞察药物心脏毒性：FDA药物诱导心脏毒性等级的第一个公开分类器2024年1月31日【药物设计】J. Chem. Inf. Model. | 基于结构的溶质载体药物设计中的计算化学：最新进展和未来展望2024年1月31日【靶蛋白相互作用】J. Med. Chem. | 通过微管蛋白秋水仙碱位点优化的靶蛋白相互作用策略PM534具体信息，请滑动下方文字1.【靶向蛋白降解】靶向蛋白降解与蛋白水解靶向嵌合体(PROTACs)是通过靶向泛素化和蛋白酶体介导的降解来消除致病蛋白的一种强大的治疗方式。大多数PROTACs利用Cullin-RING E3泛素连接酶的底物受体，如小脑和VHL。Cullin-RING E3泛素连接酶复合物的核心组分、共享组分和基本组分是否可用于PROTAC应用尚不清楚。在这里，我们发现了一个半胱氨酸反应性共价招募者EN884，其靶向SKP1- cul1 - f -box中含有SCF复合物的SKP1适配蛋白。我们进一步表明，该招募物可用于PROTAC应用，以SKP1和蛋白酶体依赖的方式降解新底物蛋白，如BRD4和雄激素受体。我们的研究表明，Cullin-RING E3泛素连接酶复合物中的核心和必需的适配器蛋白可以用于靶向蛋白质降解应用，共价化学蛋白质组学策略可以针对这些靶标发现。链接网址：https://pubs-acs-org.libproxy1.nus.edu.sg/doi/10.1021/acschembio.3c00642DOI：https://doi-org.libproxy1.nus.edu.sg/10.1021/acschembio.3c006422.【SARS-CoV-2】严重急性呼吸综合征冠状病毒2型(SARS-CoV-2)或冠状病毒病2019 (COVID-19)仍在全球传播;因此，需要快速和准确的检测方法，以保持这种传染病的传播。电化学免疫传感器是快速检测SARS-CoV-2病毒的另一种方法。在此，我们报告了一种丝网印刷碳电极免疫传感器的开发，该传感器使用羟基磷灰石-金纳米复合材料(SPCE/HA-Au)直接喷涂固定受体结合域(RBD)钉，以增加电导率和表面电极面积。采用Box-Behnken法对HA-Au复合材料的合成进行了优化，并通过紫外-可见分光光度法、TEM-EDX和XRD分析对合成的HA-Au复合材料进行了表征。在[Fe(CN)6]4 - /3 -溶液氧化还原体系中，采用差分脉冲伏安法和电化学阻抗谱法研究了RBD Spike与免疫球蛋白G (IgG)抗体的特异性相互作用。IgG的检出限为0.0561 pg mL-1，免疫传感器的选择性和稳定性为103-122%，受储存条件的影响，稳定至第7周。此外，使用人血清的真实样品对免疫传感器进行了测试，其中使用化学发光微粒免疫测定(CMIA)方法证实了结果，并显示出令人满意的结果。因此，所研制的电化学免疫传感器能够快速准确地检测出SARS-CoV-2抗体。链接网址：https://pubs-acs-org.libproxy1.nus.edu.sg/doi/10.1021/acsabm.3c00953DOI：https://doi-org.libproxy1.nus.edu.sg/10.1021/acsabm.3c009533.【分子动力学模拟】随着分子动力学(MD)模拟应用的不断发展，对加速大规模模拟系统和处理大量模拟任务的需求正在稳步增加。提出了一种基于双威异构多核处理器的大规模MD仿真并行加速方法。该方法集任务调度、仿真计算和数据存储于一体，有效地解决了大规模仿真和大量仿真任务的相关问题。任务调度策略可以灵活处理各种规模的任务，实现多个任务并行执行。在仿真计算中，我们将GROMACS移植到Sunway架构中，并通过异构处理器加速了短程力的计算。我们的方法在执行单个模拟任务时实现了大约10倍的加速和90%的可扩展性。在处理大量仿真任务时，我们的方法实现了所有任务的并行执行，具有90%的可扩展性。利用我们的方法，我们在5小时内对3000多种不同的concontoxin结构分别进行了50 ns的模拟。此外，我们评估了200多种蛋白质配体复合物，模拟效率明显超过中小型GPU集群。链接网址：https://pubs-acs-org.libproxy1.nus.edu.sg/doi/10.1021/acs.jcim.3c01254DOI：https://doi-org.libproxy1.nus.edu.sg/10.1021/acs.jcim.3c012544.【FDA药物】药物引起的心脏毒性(DICT)是药物开发中的一个主要问题，占上市后停药的10-14%。在这项研究中，我们利用美国FDA最近发布的DICTrank数据集，探索了化学和生物数据预测心脏毒性的能力。我们发现，这些数据，包括蛋白质靶点，特别是与离子通道(如hERG)、物理化学性质(如电拓扑状态)和血浆峰浓度相关的数据，对DICT具有很强的预测能力。具有环加氧酶抑制等作用机制的化合物可以区分最受关注和不受关注的DICT。内质网应激的细胞绘画特征从无毒化合物中识别出最受关注的心脏毒性。基于物理化学性质的模型提供了相当高的预测准确性(AUCPR = 0.93)。随着未来组学数据的可用性，使用生物学数据有望提高可预测性和更深入的机制洞察，为更安全的药物开发铺平道路。本研究的所有模型均可在https://broad.io/DICTrank_Predictor上获得。链接网址：https://pubs-acs-org.libproxy1.nus.edu.sg/doi/10.1021/acs.jcim.3c01834DOI：https://doi-org.libproxy1.nus.edu.sg/10.1021/acs.jcim.3c018345.【药物设计】溶质载体转运蛋白(SLCs)是一类重要的跨膜蛋白，参与将各种溶质离子和小分子运输到细胞内。人体内大约有450种SLCs，其中超过四分之一的SLCs正在成为多种复杂疾病(如抑郁症、癌症和糖尿病)的有吸引力的治疗靶点。然而，只有44种独特的转运蛋白(约9.8%的SLC超家族)具有3D结构和特定的结合位点。为了设计针对不同SLCs的创新和有效的药物，需要克服许多障碍。然而，计算化学，包括基于物理的分子建模和基于机器学习和深度学习的人工智能(AI)，为经典的药物发现方法提供了一种替代和补充的方法。在这里，我们从三个主要方面全面概述了基于结构的SLCs药物设计计算技术的最新进展和存在的挑战:(i)表征蛋白质在运输功能过程中的多种构象，(ii)识别可药物位点，特别是底物和药物结合转运体上的隐变构位点，以及(iii)发现针对结合位点的各种小分子或合成蛋白质结合物。这项工作有望为深入理解SLC超家族的结构和功能提供指导，从而在包括人工智能在内的最先进的计算化学技术的帮助下，促进新型转运体调节剂的合理设计。链接网址：https://pubs-acs-org.libproxy1.nus.edu.sg/doi/10.1021/acs.jcim.3c01736DOI：https://doi-org.libproxy1.nus.edu.sg/10.1021/acs.jcim.3c017366.【靶蛋白相互作用】靶向微管是抗肿瘤化疗中最有效的广谱药物策略，目前的研究重点是减少其主要缺点:神经毒性和耐药。PM534是通过对天然分子PM742的结构-活性-关系研究而得到的一种新型合成化合物，PM742是从石栖目海绵中分离出来的，Theonellidae, Discodermia属(du Bocage 1869)。PM534靶向小管蛋白的整个秋水仙碱结合域，覆盖药效团模型的5个中心中的4个。其纳米摩尔亲和力和高保留时间调节了惊人的高抗肿瘤活性，有效地覆盖了细胞中的两种抗性机制(解毒泵和微管蛋白βIII同型过表达)。此外，PM534对人非小细胞肺癌小鼠异种移植模型的肿瘤生长具有显著的抑制作用。我们的研究结果显示，PM534是一种处于临床前评估阶段的高效新化合物，目前正在进行首次人体I期临床试验。链接网址：https://pubs-acs-org.libproxy1.nus.edu.sg/doi/10.1021/acs.jmedchem.3c01775DOI：https://doi-org.libproxy1.nus.edu.sg/10.1021/acs.jmedchem.3c01775上下滚动查看更多药企动态2023年2月3日【GSK】GSK带状疱疹疫苗新适应症在华申报上市，2023年收入约43亿美元2023年2月2日【创响生物】创响生物获得和黄医药2款自免新药权益2023年2月2日【艾伯维】艾伯维2023年财报：修美乐144亿美元，自免新产品增长强劲2023年2月1日【百吉生物】针对肝癌！百吉生物TIL疗法获FDA快速通道资格2023年2月1日【君实生物】君实生物特瑞普利单抗上市许可申请获新加坡卫生科学局受理2023年1月31日【Teva】仿制药巨头Teva将出售原料药业务2023年1月31日【柯君医药】柯君医药宣布完成亿元B轮融资，加快推进全球临床开发各动态具体信息，请滑动下方文字1.【GSK】2月3日，CDE网站显示，GSK重组带状疱疹疫苗Shingrix新适应症在华申报上市。Shingrix是继Zostavax之后FDA批准的第2款带状疱疹疫苗。该款疫苗最早于2017年10月获FDA批准上市，用于50岁及以上成人带状疱疹的预防；2021年7月，新适应症获FDA批准，用于预防18岁及以上因已知疾病或治疗引起的免疫缺陷或免疫抑制而患带状疱疹风险增加的人群。链接网址请戳我2.【创响生物】2月2日，和黄医药宣布创响生物根据2021年1月11日所宣布的战略合作条款，已行使与和黄医药发现的两款候选药物IMG-007和IMG-004授权许可相关的选择权。行使选择权并于和黄医药收到创响生物约7.5%的普通股股份（完全稀释）后，创响生物将取得在全球进一步开发、生产和商业化上述两款候选药物的独家权益。链接网址请戳我3.【艾伯维】2月2日，艾伯维公布了2023年业绩，全年净收入543.18亿美元，较往年有所下滑（-6.4%）。研发投入为76.75亿美元，同比增长17.9%。艾伯维主要聚焦于5大疾病领域，包括免疫、肿瘤、神经科学、美容以及眼科。其中，免疫学是艾伯维当仁不让的核心业务，共计营收261.36亿美元（-9.6%），占据总收入半壁江山（+48.12%）；其次为神经科学领域，贡献了77.17亿美元收入（+18.2%），这也是艾伯维本年度唯一实现正增长的业务版块；肿瘤、美容、眼科则分别实现了59.15（-10.1%）、52.94（-0.8%）、24.15（-10.6%）亿美元营收。链接网址请戳我4.【百吉生物】2月1日，百吉生物宣布该公司创新TIL疗法BST02注射液被美国FDA授予快速通道资格，用于治疗所有类型的肝癌（包括肝细胞癌和胆管癌）。针对该适应症，BST02已于2023年10月在美国获批临床。链接网址请戳我5.【君实生物】2月1日，君实生物宣布，其自主研发的抗PD-1单抗药物特瑞普利单抗PD-1单抗药物特瑞普利单抗联合顺铂/吉西他滨作为转移性或复发性局部晚期鼻咽癌成人患者的一线治疗，以及作为单药治疗既往含铂治疗过程中或治疗后疾病进展的复发性、不可切除或转移性鼻咽癌的成人患者的2项适应症上市许可申请已于近日获得新加坡卫生科学局（HSA）受理。链接网址请戳我6.【Teva】1月31日，Teva宣布，计划剥离其活性药物成分（API）业务，即TAPI部门。TAPI是全球小分子原料药行业的领导者，拥有约4300名员工。Teva表示，剥离TAPI主要是为了提高当前和未来的业绩收入，重新分配资源以促进增长和创新，更好为患者服务。同时，剥离后的原料药公司也能最大限度地发挥其增长潜力，继续领跑价值850亿美元的全球原料药市场。链接网址请戳我7.【柯君医药】1月31日,创新型药物研发的柯君医药近日宣布顺利完成亿元B轮融资。此轮融资由泰珑投资旗下泰鲲基金领投，其他主要投资方包括骊宸投资、泰煜投资等，原有投资方宏海创健、汉康资本等也持续加持。链接网址请戳我上下滚动查看更多会议信息2024年2月28-29日 举办AntibodyChina 第七届抗体药物深度聚焦峰会2024年3月21-22日 上海恺默信息咨询有限公司举办SIT 2024第六届小分子药物创新与合作大会2024年3月21-22日 上海恺默信息咨询有限公司举办PDD 2024多肽药物产业发展大会2024年4月18-19日 举办第四届I-RNA小核酸药物深度聚焦峰会2024年6月27-28日 举办上海求实医药咨询有限公司ING 2024第七届免疫及基因治疗论坛各会议具体详情和参会方式，请滑动下方文字AntibodyChina 第七届抗体药物深度聚焦峰会会议时间：2024年2月28-29日会议地点：上海会议主旨：峰会议题跨越抗体药物研发的最前沿，追踪最新的临床进展，致力于打破行业的封闭循环，破除行业内卷，助推创新多元发展！一切尽在抗体药物的年度产业大会！链接网址请戳我SIT 2024第六届小分子药物创新与合作大会主办方： 上海恺默信息咨询有限公司会议时间：2024年3月21日-22日会议地点：上海会议主旨：峰会议题跨越小分子药物研发的热点领域，一览当下化学创新药研发新动向，致力于打破行业的封闭循环，破除行业内卷，助推创新多元发展！一切尽在小分子药物的年度产业大会！链接网址请戳我PDD 2024多肽药物产业发展大会主办方： 上海恺默信息咨询有限公司会议时间：2024年3月21日-22日会议地点：上海会议主旨：共谈多肽减重药物、多肽药物的法规与申报、开发案例与趋势、CMC 各个环节中的难点与挑战。力求为多肽企业致力于多肽药物研究的专家及科研人员提供一个深度的思想碰撞及经验分享平台。链接网址请戳我第四届I-RNA小核酸药物深度聚焦峰会会议时间：2024年4月18日-19日会议地点：苏州会议主旨：破解递送挑战与CMC难点，汇聚最新临床进展与热门研发方向；构建小核酸药物专属交流平台，打造产业闭环，推动国产小核酸药物产业化进程。链接网址请戳我ING 2024第七届免疫及基因治疗论坛主办方：上海求实医药咨询有限公司会议时间：2024年6月27日-28日会议地点：北京会议主旨：聚焦CGT领域开发的核心问题，破除技术壁垒，推动产业不断前进，开启生物医药产业下一个风口！链接网址请戳我上下滚动查看更多版权信息本文内容均由小编收集于公开的各个网络平台，发布的目的仅为了方便大家一站式了解AIDD行业信息，并未对发布源头进行真实性验证。如您发现相关信息有任何版权侵扰或者信息错误，请及时联系AIDD Pro（请添加微信号sixiali_fox59）进行删改处理。原创内容未经授权，禁止转载至其他平台。有问题可发邮件至sixiali@stonewise.cn关注我，更多资讯早知道↓↓↓
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