【第一百二十八期】AI+药物研发领域一周资讯
临床结果临床研究
前言AIDD Pro 根据国内外各大网站以及人工智能药物设计主流新闻网站及公众号，从 AIDD会议、AIDD招聘，重大科研进展、行业动态、最新报告发布等角度，分析挖掘了每周人工智能辅助药物设计领域所发生的、对领域技术发展产生重大推动作用的事件，旨在帮助 AIDD领域研究人员和业内人士及时追踪最新科研动态、洞察前沿热点。如果您觉得符合以上要求的内容我们有遗漏或者更好建议，欢迎后台留言。科研进展2024年5月25日【神经网络】J. Chem. Theory Comput. | 量子-经典神经网络迁移学习在药物毒性预测中的应用2024年5月24日【药物发现】ACS Omega | 自动化机器人检测界面：通过物理化学性质分析自动化促进药物发现中的机器学习2024年5月23日【分子性质预测】ACS Omega | 基于注意的FP-GNNs元学习用于短时间分子性质预测2024年5月23日【酶抑制剂】ACS Med. Chem. Lett. | 肝素酶抑制剂的设计原则:体外和计算机联合研究2024年5月22日【蛋白质组学】J. Am. Chem. Soc. | 活细胞中信号代谢产物果糖-1,6-二磷酸相互作用蛋白的化学蛋白质组学分析2024年5月22日【SARS-CoV-2】ACS Sens. | 利用单分子电导测量鉴定SARS-CoV-2变体具体信息，请滑动下方文字1.【神经网络】毒性是一个障碍，阻止了大量药物被用于潜在的拯救生命的应用。深度学习为寻找理想的候选药物提供了一个有希望的解决方案;然而，浩瀚的化学空间与底层相结合O (n3)矩阵乘法意味着这些工作很快就会变得需要计算。为了解决这个问题，我们提出了一个混合量子-经典神经网络，用于预测药物毒性，利用量子电路设计，通过显式计算矩阵乘积的复杂性来模拟经典神经行为O (n2)． 利用Hadamard测试进行有效的内积估计，而不是传统的交换测试，我们将量子比特的数量减少了一半，并且消除了量子相位估计的需要。直接计算矩阵积量子力学允许可学习的权重从量子转移到经典设备进行进一步训练。我们将我们的框架应用于Tox21数据集，并表明它达到了与模型完全经典相当的预测精度O (n3)模拟。此外，我们证明，模型继续学习，没有中断，一旦转移到一个完全的古典建筑。我们相信，将降低复杂性的量子优势与无噪声计算的经典优势相结合，将为更具可扩展性的机器学习模型铺平道路。链接网址：https://pubs-acs-org.libproxy1.nus.edu.sg/doi/10.1021/acs.jctc.4c00432DOI：https://doi-org.libproxy1.nus.edu.sg/10.1021/acs.jctc.4c004322.【药物发现】测量分子的物理化学性质是药物开发过程中一个反复而又不可或缺的过程。克服最大限度提高分析通量挑战的策略依赖于使用基于实验数据训练的计算机机器学习(ML)预测模型。因此，这些硅模型的性能取决于所利用的实验数据的质量。为了提高数据质量，我们设计并实施了一个自动化机器人系统来准备和运行物理化学性质分析(自动化机器人分析接口，ARIA)，样品吞吐量增加了6到10倍。通过这一过程，我们克服了主要挑战，并获得了与半自动分析制备相比一致的可重复分析数据。链接网址：https://pubs-acs-org.libproxy1.nus.edu.sg/doi/10.1021/acsomega.4c02003DOI：https://doi-org.libproxy1.nus.edu.sg/10.1021/acsomega.4c020033.【分子性质预测】分子性质预测在药物发现中具有重要意义，能够鉴定具有良好类药物性质的生物活性化合物。然而，由于药物发现中标记数据的稀缺性而引起的低数据问题，对准确预测构成了实质性障碍。为了解决这一挑战，我们引入了一种新的结构，AttFPGNN-MAML，用于少量分子性质预测。所提出的方法采用混合特征表示来丰富分子表示并模拟特定于任务的分子间关系。通过利用ProtoMAML，一种元学习策略，我们的模型被训练并适应新的任务。对两个少量数据集(MoleculeNet和FS-Mol)的评估表明，我们的方法在四分之三的任务和各种支持集大小上都具有优越的性能。这些结果令人信服地验证了我们的方法在少量分子性质预测领域的有效性。源代码可在https://github.com/sanomics-lab/AttFPGNN-MAML上公开获得。链接网址：https://pubs-acs-org.libproxy1.nus.edu.sg/doi/10.1021/acsomega.4c02147DOI：https://doi-org.libproxy1.nus.edu.sg/10.1021/acsomega.4c021474.【酶抑制剂】肝素酶(HPSE)是一种从硫酸肝素蛋白聚糖(HSPGs)中切割硫酸肝素(HS)侧链的酶。HPSE的过表达与多种类型的癌症、炎症和免疫紊乱有关，使其成为一个非常有希望的治疗靶点。先前开发的已进入临床试验的HPSE抑制剂是多糖衍生化合物或其模拟物;然而，这些分子往往存在生物利用度差、通过靶向其他糖结合蛋白产生副作用以及异质性等问题。很少有小分子抑制剂进展到临床前或临床阶段，在HPSE药物发现方面留下了空白。本研究利用超灵敏的HPSE探针，通过高通量筛选(high-throughput screening, HTS)，发现了一种抑制HPSE活性的新型小分子。计算工具被用来阐明抑制的机制。将命中化合物的基本结构特征总结为构效关系(SAR)理论，为HPSE小分子抑制剂的未来设计提供了见解。链接网址：https://pubs-acs-org.libproxy1.nus.edu.sg/doi/10.1021/acsmedchemlett.3c00268DOI：https://doi-org.libproxy1.nus.edu.sg/10.1021/acsmedchemlett.3c002685.【蛋白质组学】果糖-1,6-二磷酸(FBP)是糖酵解途径中的一种细胞内源性糖代谢物，最近被报道作为一种信号分子，通过参与重要蛋白质来调节各种细胞事件。尽管在鉴定特异性fbp -蛋白相互作用方面取得了巨大进展，但对fbp -蛋白相互作用蛋白及其调控机制的全面鉴定仍未得到充分探索。在这里，我们描述了一种简明的合成方法，用于可扩展制备光亲和FBP探针，该探针能够直接在活细胞中基于光亲和标记(PAL)对FBP -蛋白质相互作用进行定量化学蛋白质组学分析。使用这样的协议，我们捕获了已知的FBP目标，包括PKM2和MDH2。此外，在未知的FBP相互作用蛋白中，我们发现了线粒体代谢酶醛脱氢酶2 (ALDH2)， FBP对其表现出抑制活性，导致细胞ROS上调并伴有线粒体断裂。我们的发现揭示了一种由FBP-ALDH2-ROS轴介导的葡萄糖信号传导新模式。链接网址：https://pubs-acs-org.libproxy1.nus.edu.sg/doi/10.1021/jacs.4c01335DOI：https://doi-org.libproxy1.nus.edu.sg/10.1021/jacs.4c013356.【SARS-CoV-2】全球COVID-19大流行凸显了快速、可靠和有效检测生物制剂的必要性，以及在新的SARS-CoV-2变体出现时跟踪遗传物质变化的必要性。在这里，我们证明基于rna的单分子电导实验可用于鉴定SARS-CoV-2的特定变体。为此，我们(i)为特定变体选择感兴趣的目标序列，(ii)利用单分子断结测量来获得每个序列及其潜在突变的电导直方图，以及(iii)使用XGBoost机器学习分类器快速识别具有有限数量电导迹的溶液中目标分子的存在。该方法利用能够结合特异性靶标的互补DNA探针，对长度小于20个碱基对的RNA靶标序列进行高特异性和高灵敏度检测。我们使用这种方法直接检测了关注B.1.1.7 (Alpha)、B.1.351 (Beta)、B.1.617.2 (Delta)和B.1.1.529 (Omicron)的SARS-CoV-2变体，并进一步证明了特定序列的传导对核苷酸错配敏感，从而扩大了系统的识别能力。因此，我们的实验方法检测特定的SARS-CoV-2变体，并在新变体出现时识别它们的出现。链接网址：https://pubs-acs-org.libproxy1.nus.edu.sg/doi/10.1021/acssensors.3c02734DOI：https://doi-org.libproxy1.nus.edu.sg/10.1021/acssensors.3c02734上下滚动查看更多药企动态2024年5月24日【礼来】90亿美元！礼来投资扩大替尔泊肽产能2024年5月24日【复宏汉霖】复宏汉霖「地舒单抗」生物类似药在欧盟申报上市2024年5月23日【武田】约12亿美元！达歌生物与武田达成合作，开发分子胶药物2024年5月23日【阿斯利康】超6亿美元！阿斯利康引进诺纳生物临床前单抗项目2024年5月22日【默克】6亿美元！默克收购Mirus Bio，提高病毒载体生产能力2024年5月22日【渤健】18亿美元！渤健收购HI-Bio获得CD38单抗，天境生物拥有中国权益各动态具体信息，请滑动下方文字1.【礼来】5月24日，礼来宣布其在印第安纳州黎巴嫩生产基地的投资增加了一倍多，新投资额达53亿美元，使公司在该生产基地的总投资从37亿美元增至90亿美元。此次扩建将提高礼来生产替尔泊肽即Zepbound注射液和Mounjaro注射液活性药物成分（API）的能力，从而使更多患有肥胖症和2型糖尿病等慢性疾病患者从中获益。链接网址请戳我2.【复宏汉霖】5月24日，复宏汉霖宣布其自主研发的地舒单抗生物类似药HLX14的两项上市许可申请（MAAs）获欧洲药品管理局（EMA）受理。链接网址请戳我3.【武田】5月23日消息，达歌生物宣布与武田（Takeda）达成多靶点合作研发及独家许可协议，以发现和开发用于肿瘤学、神经科学和炎症领域多个靶点的新型分子胶降解剂。根据协议，达歌生物将利用其GlueXplorer平台，针对武田选定的特定疾病靶点发现、验证和优化分子胶降解剂。在达到一定进展阶段后，这些项目将移交给武田进行进一步开发和商业化。达歌生物将获得首付款和潜在里程碑共计最高可达12亿美元。同时，武田也会对达歌生物进行股权投资。链接网址请戳我4.【阿斯利康】5月23日，和铂医药全资子公司诺纳生物宣布，与阿斯利康达成合作协议，将一款临床前阶段肿瘤靶向治疗单抗新药授权给阿斯利康。链接网址请戳我5.【默克】5月22日，德国默克宣布已经与Mirus Bio签署最终协议，将以6亿美元收购Mirus Bio。Mirus Bio专门从事TransIT-VirusGEN等转染试剂的开发和商业化，总部位于美国。据悉，转染试剂在基于病毒载体的基因疗法生产中至关重要。链接网址请戳我6.【渤健】5月22日，Biogen宣布收购Human Immunology Biosciences（HI-Bio™）。根据协议，渤健将支付11.5亿美元预付款和高达6.5亿美元的潜在里程碑款项。链接网址请戳我上下滚动查看更多会议信息2024年6月20-21日 智药邦举办2024人工智能与生物医药生态大会2024年6月27-28日 上海求实医药咨询有限公司举办ING 2024第七届免疫及基因治疗论坛2024年8月29-30日 上海求实医药咨询有限公司举办ICNS 2024 第四届中枢神经系统药物深度聚焦论坛各会议具体详情和参会方式，请滑动下方文字2024人工智能与生物医药生态大会主办方：智药邦会议时间：2024年6月20日-21日会议地点：上海会议主旨：充分介绍和讨论AI赋能生物医药领域的前沿进展、重要案例、关键问题和各方思考，加强交流与合作，加速生物制药相关技术和产业的发展。链接网址请戳我ING 2024第七届免疫及基因治疗论坛主办方：上海求实医药咨询有限公司会议时间：2024年6月27日-28日会议地点：北京会议主旨：聚焦CGT领域开发的核心问题，破除技术壁垒，推动产业不断前进，开启生物医药产业下一个风口！链接网址请戳我ICNS 2024 第四届中枢神经系统药物深度聚焦论坛主办方：上海求实医药咨询有限公司会议时间：2024年8月29日-30日会议地点：南京会议主旨：深化基础研究，提升药物开发成功率，突破技术瓶颈，并探索新疗法的前沿进展。链接网址请戳我上下滚动查看更多版权信息本文内容均由小编收集于公开的各个网络平台，发布的目的仅为了方便大家一站式了解AIDD行业信息，并未对发布源头进行真实性验证。如您发现相关信息有任何版权侵扰或者信息错误，请及时联系AIDD Pro（请添加微信号sixiali_fox59）进行删改处理。原创内容未经授权，禁止转载至其他平台。有问题可发邮件至sixiali@stonewise.cn关注我，更多资讯早知道↓↓↓
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