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如何用菌对抗
大肠癌
?《自然·综述》发出最新观点
2024-02-19
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今日头条
微生物疗法
02月19日的《热心肠日报》,我们解读了 15 篇文献,关注:活菌疗法,工程菌,瘤内菌群,
早发性大肠癌
,肠道真菌,标志物,肠道息肉,机器学习,
Evogene
,Verb Biotics,
Perelel Health
,
易慕峰
,珂睿科技,Heura Foods。 该篇日报由R·AI辅助创作生成,人工审核校对。 Nature Reviews:活菌疗法——
癌症
检测与治疗的新希望(观点) Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology——[65.1] ① 本文探讨了活细菌疗法(LBTs)在
结直肠癌
检测和治疗中的应用,展示了通过工程微生物进行疾病治疗和检测的前景;② LBTs主要包括粪菌移植(
FMT
)、天然细菌工程和合成回路工程,细菌具有靶向和在实体
肿瘤
内增殖的能力,并能控制释放荷载的能力使其成为持续释放免疫调节剂、细胞毒蛋白和原药转化酶等治疗药物的理想载体;③
FMT
是一种将健康供体的粪便收集并引入患病接受者的胃肠系统的方法,用于治疗对抗生素无反应的
难治性难辨梭菌感染
;④ 天然细菌工程应用于天然和非天然菌株,使用微生物学和合成生物学作为工具;⑤ 合成回路工程使用群体感应,即使用小分子或寡肽来调节细菌群体行为;⑥ LBTs具有有益地重塑肠道微环境的天然特性,同时具有合成工程生产治疗剂和
肿瘤
检测的能力,也适用于非
结直肠癌
等其他
癌症
。 【原文信息】 Live bacterial therapeutics for detection and treatment of colorectal cancer 2024-02-14 , doi: 10.1038/s41575-024-00901-8
癌症
新视角:瘤内微生物如何影响
肿瘤
的发生发展?(综述) Trends in Microbiology——[15.9] ① 随着测序技术的迭代,大量研究发现存在
肿瘤
内微生物,表明其在
肿瘤
内发挥重要功能,该综述回顾该领域的最新发现,揭示了瘤内微生物如何影响
肿瘤
发生和发展,表明
肿瘤
内微生物群可作为多种
癌症
的生物标志物;②
肿瘤
内的微生物具有异质性和特异性,且不同
肿瘤
具有不同的微生物种类,如
食管癌
以富有链球菌和普氏菌为特征,
结直肠癌
中具有高丰度梭杆菌属;③ 瘤内微生物可通过诱导DNA损伤和断裂、改变宿主基因的表观修饰、影响信号通路、修饰药物代谢、调控免疫、协助
肿瘤
远端转移等多种机制影响
肿瘤
进展;④
肿瘤
内微生物群的丰度较低,因此对其功能进行研究具有挑战,但目前通过先进技术如16S rRNA-seq、原位杂交、培养组学等结合单细胞测序和体内外实验,能够深入探究瘤内微生物的功能机制;⑤ 总之,瘤内微生物是
肿瘤
研究中不可缺少的部分,深入探究宿主-
肿瘤
-微生物之间的相互作用及其分子机制能够为
肿瘤
研究带来新的治疗手段。 【原文信息】 Broadening oncological boundaries: the intratumoral microbiota 2024-02-02 , doi: 10.1016/j.tim.2024.01.007 Cell子刊:瘤内细菌与T细胞的空间耦合性 Cell Reports Medicine——[14.3] ① 本研究揭示了
实体瘤
中的微生物分布在空间上是不均匀的,并且与T细胞相关,微生物-T细胞的相互作用塑造了
实体瘤
的
肿瘤
微环境和生物学;② 使用空间分析技术分析人
实体瘤
样本,发现细菌和免疫细胞的异质性在空间上是关联的,且
胰腺癌
小鼠模型重现了人类样本中观察到的免疫-微生物空间耦合的现象;③ 使用T细胞来定义
肿瘤
内部区域,T细胞丰富和T细胞贫乏区域显示出与免疫活跃和静止表型相关的独特细菌群落,但与肠道菌群无关;④ 在T细胞贫乏的
肿瘤
中去除
肿瘤
内细菌能减缓
肿瘤
生长,并在T细胞富集的
肿瘤
中改变髓样和B细胞的表型和存在,但不影响T细胞浸润;⑤ T细胞的消耗则破坏了
肿瘤
的免疫状态,并减少了
肿瘤
内细菌。 【原文信息】 Multimodal immune phenotyping reveals microbial-T cell interactions that
shape
pancreatic cancer 2024-01-25 , doi: 10.1016/j.xcrm.2024.101397
早发性大肠癌
的瘤内菌群特征 EBioMedicine——[11.1] ① 纳入136名
早发性结直肠癌(yoCRC)
患者和140名
普发性结直肠癌(aoCRC)
患者的组织样本,分析其
肿瘤
菌群;② 相比aoCRC患者,yoCRC患者的
肿瘤
菌群具有更高的α多样性和不同的β多样性,且与左侧、直肠和IV期
肿瘤
更为相关;③ yoCRC肿瘤中富含Akk菌和拟杆菌,而aoCRC肿瘤中芽孢杆菌、葡萄球菌等多种微生物的相对丰度更高;④ Akk菌与yoCRC肿瘤中其他菌群呈负相关,梭杆菌和Akk菌的丰度与yoCRC患者的总生存率相关;⑤ yoCRC和aoCRC
肿瘤
中具有与
肿瘤
位置、侧面、分期和
肥胖
相关的不同菌群特征;⑥ 本研究揭示
肿瘤
菌群在
CRC
发病机制中的作用,为未来的预防、诊断和治疗提供了潜在靶点。 【原文信息】 Distinct intratumoral microbiome of young-onset and average-onset colorectal cancer 2024-02-01 , doi: 10.1016/j.ebiom.2024.104980
肠道真菌群失调
与
黑色素瘤
及抗
PD-1
治疗反应相关 Cancer Immunology Research——[10.1] ① 研究肠道真菌组在
黑色素瘤
进展中的作用;② 与健康对照相比,
黑色素瘤
患者的肠道真菌群结构显著差异,白色念珠菌、都柏林念珠菌和粗糙脉孢菌丰度较高,而酿酒酵母和汉逊德巴利酵母丰度较低;③ 抗
PD-1
治疗期间,马拉色菌和白色念珠菌的相对丰度增加;④ 较高水平的奇异酵母菌与抗
PD-1
治疗的阳性反应相关,而较高水平的四孢菌则与缺乏临床益处相关;⑤ 高水平的马拉色菌和白色念珠菌、血清LDH升高及
超重
与
黑色素瘤
进展的风险增加和抗
PD-1
治疗反应较差有关;⑥ 本研究揭示了与
黑色素瘤
相关的肠道真菌群失调,发现真菌菌群组成和特定真菌种类的变化与
黑色素瘤
的进展和对抗
PD-1
治疗的反应有关。 【原文信息】 Gut mycobiota dysbiosis is associated with melanoma and response to
anti-PD-1
therapy 2024-02-05 , doi: 10.1158/2326-6066.CIR-23-0592 Nature子刊:ctDNA或能指导
转移性大肠癌
的治疗选择 Nature Medicine——[82.9] ① 纳入700多名
RAS野生型转移性结直肠癌(mCRC)
RAS
野生型转移性结直肠癌(mCRC)患者,对其基线血浆样本中的
循环肿瘤
DNA(ctDNA)进行探索性生物标志物分析,发现ctDNA基因改变可作为评估抗表皮生长因子(
EGFR)
治疗效果的生物标志物;② 在没有ctDNA基因改变的患者中,与
bevacizumab
联合改良FOLFOX6方案相比,
panitumumab
联合改良FOLFOX6方案能显著延长总生存期(40.7对34.4个月);③ 然而,对于ctDNA中含有任何基因改变的患者,无论
肿瘤
位于何侧,
panitumumab
的治疗效果相似甚至较差(19.2对22.2个月);④ 本研究表明通过ctDNA的负向超选择或可指导mCRC患者的最佳治疗选择。 【原文信息】 Baseline ctDNA gene alterations as a biomarker of survival after
panitumumab
and chemotherapy in metastatic colorectal cancer 2024-02-12 , doi: 10.1038/s41591-023-02791-w 国内团队Nature子刊:
大肠癌
诊断和治疗反应的多样化生物标志物 Nature Communications——[16.6] ①
复旦大学
丁琛团队联合陈志宇团队通过对147名接受
西妥昔单抗
治疗的
结直肠癌(CRC)
患者和90名健康对照(
HCs
)的641个血浆样本进行纵向深度蛋白质组学分析,揭示了用于诊断和评估
西妥昔单抗
治疗反应的生物标志物的多样性;② 筛选出
COL12A1
、
THBS2
、
S100A8
和
S100A9
作为区分
CRC
患者和
HCs
的潜在蛋白质;③ 确定
RRAS2
、
MMP8
、
FBLN1
、
RPTOR
和
IMPDH2
为初始反应预测的潜在生物标志物;④ 纵向设置中确定两个具有不同波动的簇,通过构建高精度模型来预测长期反应,并在独立队列中得到验证;⑤ 该研究揭示在
西妥昔单抗
治疗的首次和多次疗程中,用于
肿瘤
诊断、初始反应和长期反应预测的不同生物标志物的异质性,或可有助于
CRC
监测和干预策略。 【原文信息】 Longitudinal plasma proteome profiling reveals the diversity of biomarkers for diagnosis and
cetuximab
therapy response of colorectal cancer 2024-02-01 , doi: 10.1038/s41467-024-44911-1
结直肠息肉
:该不该割?(综述) Gastroenterology——[29.4] ① 本综述总结了
结肠息肉
的自然史、生物学和疾病结局,特别关注可能不与未来
结直肠癌
风险相关的某些类别的息肉,并提供见解,以指导研究优先事项和潜在的管理策略;② 根据大小和组织学鉴定的高危息肉的个体受益于密集随访;③ 许多个体患有无进展组织学特征的小息肉,对随访的益处尚不确定且存在争议;④ 随着筛查率的增加、美国最近扩大筛查对象到年轻人以及技术进步等,对随访的需求将进一步增加;⑤ 未来,应该采用精准医学的原则进行
肠息肉
的监测,包括以个体为中心,结合流行病学、生物学和基因组学来建立个性化的风险评估。 【原文信息】 Colon Polyp Surveillance - Separating the Wheat from the Chaff 2024-01-13 , doi: 10.1053/j.gastro.2023.11.305 标准化培训可降低内镜黏膜切除后大型结肠息肉的复发率 Gut——[24.5] ① 一项荷兰的多中心研究表明,在社区医院进行标准化内镜粘膜切除(EMR)培训,可显著降低大型
无蒂结直肠息肉(LNPCP)
的复发率;② 30家医院的59名内镜医师随机分为两组,干预组接受EMR培训;③ 纳入1412例LNPCP,699例为干预组患者;④ 干预组患者的复发率为13%,显著低于对照组患者的25%,主要是20-40mm的LNPCP的复发减少;⑤ 干预组患者的复发更多为单发性(92% vs. 76%);⑥ 研究结果强调了内镜医师培训对于降低LNPCP复发率的重要性,尤其是在社区医院的临床实践中。 【原文信息】 Standardised training for endoscopic mucosal resection of large non-pedunculated colorectal polyps to reduce recurrence (*STAR-LNPCP study): a multicentre cluster randomised trial 2024-01-12 , doi: 10.1136/gutjnl-2023-330020 光谱分析结合神经网络实现实时
肠癌
组织边缘辨识 International Journal of Surgery——[15.3] ①
结直肠癌
术后出现阳性切缘与患者复发率和生存期较差相关,因此亟待区分术后
肿瘤
组织和正常组织;② 该研究基于扩散反射光谱(DRS)和卷积神经网络(CNN)结合机器学习建立了实时
结直肠癌
肿瘤和非
肿瘤
组织区分模型;③ 共纳入7692个结直肠组织(包含
肿瘤
组织和非
肿瘤
组织)的平均光谱,该模型诊断准确率达90.8%,曲线下面积为96.8%;④ 基于CNN的分类器在区分
肿瘤
和非
肿瘤
结直肠组织方面表现最佳,并可提供实时屏幕分类的渐变色图反馈。 【原文信息】 Real-time classification of tumour and non-tumour tissue in colorectal cancer using diffuse reflectance spectroscopy and neural networks to aid margin assessment 2024-01-22 , doi: 10.1097/JS9.0000000000001102
Evogene
和Verb Biotics宣布达成合作,开发新型益生菌 ① 2月6日,计算生物学公司
Evogene
与微生物组科学公司Verb Biotics宣布达成合作协议;② 该协议旨在共同开发新型益生菌菌株,生产高度可持续的代谢产物,以改善人类健康与活力;③ 此次合作将通过
Evogene
的MicroBoost AI技术引擎和Verb Biotics的微生物组专业知识,来识别和增强未知的微生物遗传途径,以支持新型代谢物的生产;④ 协议的相关财务条款尚未披露。 【原文信息】 Evogene and Verb Biotics Enter Collaboration Agreement to Advance Probiotic Innovation 2024-02-06 , Evogene 维生素生产商
Perelel Health
完成600万美元A轮融资 ① 2月1日,全球领先的产前和产后维生素生产商
Perelel Health
宣布获得600万美元(约合人民币4315.74万元)的A轮融资;② 此轮融资由联合利华风险投资公司(Unilever Ventures)、
Willow Growth
和Selva Ventures联合投资;③ 资金将主要用于扩大团队和支持产品的临床研究;④
Perelel Health
已累计筹集1210万美元(约合人民币8703.41万元)资金;⑤
Perelel Health
因注重产品功效和安全性而备受欢迎,自成立以来年增长率翻倍,并接近盈利。 【原文信息】 Unilever Ventures leads $6 million series A investment in Perelel Health
vitamin
company 2024-02-01 , Glossy
易慕峰
靶向
EpCAM
的CAR-T细胞治疗产品
IMC001
获批临床 ① 近日,
易慕峰
宣布其靶向
EpCAM
的自体CAR-T细胞产品
IMC001注射液
的临床试验申请获得中国国家药品监督管理局药品审评中心(CDE)的默示许可;②
IMC001
拟用于治疗
EpCAM表达阳性的晚期消化系统肿瘤
EpCAM
表达阳性的晚期消化系统肿瘤,包括但不限于
晚期胃癌
和
食管胃结合部腺癌
;③
IMC001
是
易慕峰
开发的一款靶向上皮细胞黏附
分子(EpCAM)
的自体CAR-T产品;④ 靶向
EpCAM
的CAR-T产品可以同时靶向原发灶、
CTC
、转移灶;⑤ 在针对
晚期胃癌
的临床试验中,
IMC001
显示出良好的安全性和初步疗效,有望为
晚期消化系统肿瘤
提供一种新的治疗选择。 【原文信息】
易慕峰
靶向
EpCAM
的CAR-T细胞治疗产品获批临床 2024-02-12 , 医药观澜 分析仪器制造商「珂睿科技」完成数千万人民币A2轮融资 ① 近日,高端液相色谱供应商珂睿科技完成数千万人民币A2轮融资;② 本轮融资由博行资本出资;③ 资金将主要用于研发投入与商业转化;④ 珂睿科技在2023年实现销售收入和订单合同同比增长近100%;⑤ 珂睿科技通过差异化市场策略实现逆势增长,预计2024年业绩将延续高速增长并有望实现整体盈利。 【原文信息】 珂睿科技完成数千万人民币A2轮融资,投资方为博行资本 2024-02-16 , 动脉网 植物基食品科技公司Heura Foods完成4000万欧元B轮融资 ① 2月6日,植物基食品科技公司Heura Foods宣布完成4000万欧元(约合人民币3.1亿元)B轮融资;② 本轮融资由植物基制造商
Upfield
、Unovis Asset Management以及著名的食品科技基金、欧洲循环生物经济基金(ECBF VC)和New Tree Impact共同投资;③ 本轮融资旨在加强其在欧洲的业务,进一步发展植物性产品,并利用新技术提高产量;④ 据报道,Heura Foods开发了一种无需人工添加剂的植物性肉类纹理化新方法;⑤ 该方法能够为消费者带来更具营养价值的产品,目前正在申请相关的专利。 【原文信息】 植物基食品科技公司Heura Foods完成4000万欧元B轮融资 2024-02-06 , Foodaily 感谢本期日报的审核者:RZN,MD,章台柳,圆圈儿,注册营养师陈彬林,aluba,Johnson,lxx,Alex Zhang,617 点击阅读过去10天的日报: 0218 |
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重磅:某些无糖食品为何让人肠胃不适?菌群给出答案 0209 | 《自然·综述》详解:
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机构
Evogene Ltd.
Perelel, Inc.
苏州易慕峰生物科技有限公司
[+4]
适应症
结直肠癌
肠肿瘤
癌症
[+20]
靶点
MTFMT
PD-1
RAS superfamily
[+11]
药物
Remetinostat
Sym-021
贝伐珠单抗
[+4]
标准版
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16800
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