【第一百一十六期】AI+药物研发领域一周资讯
2024-03-03
临床结果临床1期临床申请
前言AIDD Pro 根据国内外各大网站以及人工智能药物设计主流新闻网站及公众号，从 AIDD会议、AIDD招聘，重大科研进展、行业动态、最新报告发布等角度，分析挖掘了每周人工智能辅助药物设计领域所发生的、对领域技术发展产生重大推动作用的事件，旨在帮助 AIDD领域研究人员和业内人士及时追踪最新科研动态、洞察前沿热点。如果您觉得符合以上要求的内容我们有遗漏或者更好建议，欢迎后台留言。科研进展2024年3月1日【小分子配体发现】J. Med. Chem. | 基于结构的高亲和小分子配体的发现和工具探针的开发研究几丁质酶-3样蛋白1的作用2024年3月1日【SARS-CoV-2】ACS Med. Chem. Lett. | 靶向主要蛋白酶(Mpro)和组织蛋白酶L的双重抑制剂作为潜在抗SARS-CoV-2药物的鉴定2024年3月1日【神经网络】Ind. Eng. Chem. Res. | 基于多元线性回归和反向传播人工神经网络的离子液体电导率预测QSPR模型2024年2月29日【药物发现】J. Org. Chem. | 由二茂锆氢化物介导的立体选择性胺合成加速药物发现计划2024年2月28日【虚拟筛选】J. Chem. Inf. Model. | ESSENCE-Dock：一种基于共识的方法来增强药物发现中的虚拟筛选富集2024年2月28日【生成模型】J. Agric. Food Chem.| 利用人工智能生成模型和基于结构的虚拟筛选发现潜在的新烟碱类杀虫剂具体信息，请滑动下方文字1.【小分子配体发现】几丁质酶-3样-1 (CHI3L1)，也被称为YKL-40，是一种与炎症、纤维化和癌症有关的糖蛋白。本研究利用微尺度热泳(MST)和alphasgreen (AS)研究了CHI3L1与多种寡糖的相互作用。这些研究指导了高通量筛选试验的发展，以评估小分子对CHI3L1与生物素化小分子或硫酸肝素基探针结合的干扰。YKL-40的小分子结合物在我们的壳三醇苷酶抑制剂文库中被MST鉴定，并通过x射线晶体学证实。基于CHI3L1强效命中化合物的共晶结构，设计了用于AS检测的小分子探针19和20。基于结构优化的化合物30和31具有纳米摩尔活性和类药物性质。此外，建立了以生物素化硫酸肝素为探针的正交分光光度法。这两种化合物的亲和力均显示出显著的相关性。这些筛选工具和化合物为研究CHI3L1的作用提供了新的途径。链接网址：https://pubs-acs-org.libproxy1.nus.edu.sg/doi/10.1021/acs.jmedchem.3c02255DOI：https://doi-org.libproxy1.nus.edu.sg/10.1021/acs.jmedchem.3c022552.【SARS-CoV-2】在这项结构-活性关系(SAR)研究中，我们报道了针对SARS-CoV-2主要蛋白酶(Mpro)和人组织蛋白酶L (hCatL)具有抗病毒特性的双重抑制剂的开发。新分子在P2位点的脂肪族氨基酸和P3位点苯基环上的氟位置上有所不同。双抑制剂对SARS-CoV-2 Mpro的Ki值分别为1.61和10.72 μM;对hCatL的Ki值在0.004 ~ 0.701 μM之间。在P2位点侧链的性质和氟原子的位置之间发现了很大的相互依赖性。三种双靶向抑制剂在低微摩尔范围内表现出抗病毒活性，CC50值>100 μM。为了更深入地了解SAR剖面，进行了对接模拟。本文收集的研究结果应考虑到未来开发双重SARS-CoV-2 Mpro/hCatL抑制剂。链接网址：https://pubs-acs-org.libproxy1.nus.edu.sg/doi/10.1021/acsmedchemlett.3c00562DOI：https://doi-org.libproxy1.nus.edu.sg/10.1021/acsmedchemlett.3c005623.【神经网络】离子液体(ILs)的电导率是一种重要的转移性质，已经用各种方法进行了研究，包括实验测量、半经验模型和分子模拟。在这些方法中，定量结构-性质关系(QSPR)模型被广泛应用于各种应用中。然而，构建一个有效的QSPR模型依赖于合适的分子描述符的选择。在这项研究中，建立了线性和非线性QSPR模型来预测il的电导率。这些模型结合了温度、腔体体积的分子描述符(VCOSMO)和特定间隔的电荷密度分布面积(Sσi)，这些描述符是由类导体段活度系数筛选模型(cosmos - sac)得到的。评估的数据集包括254个il和3102个数据点;离子离子被认为是由“纯离子”或“离子对”组成的。本研究建立了三个不同的模型:模型1为结合多元线性回归(MLR)的纯离子模型，模型2为结合多元线性回归的离子对模型，模型3将离子对视为离子对，采用反向传播人工神经网络(BP-ANN)构建。对于整个数据集，模型I和模型II的决定系数(R2)分别为0.9478和0.9642。计算得到的平均绝对相对偏差(AARDs)分别为25.38和21.37%，均方根误差(rmse)分别为0.3291和0.2724。相比之下，模型III的训练集、验证集和测试集的R2分别为0.9939、0.9911和0.9887。AARD值分别为6.96、8.13和8.97%，RMSE值分别为0.1132、0.1214和0.1569。应用域(AD)分析表明，91.1%的数据点位于模型II的应用域内，只有0.16%的数据存在响应异常值。相比之下，93.42%的数据被绑定在模型III的AD内，没有响应异常值。这些发现表明，将il视为“离子对”并将其与BP-ANN相结合的QSPR模型可以高精度地预测不同温度下不同il的电导率。链接网址：https://pubs-acs-org.libproxy1.nus.edu.sg/doi/10.1021/acs.iecr.3c03750DOI：https://doi-org.libproxy1.nus.edu.sg/10.1021/acs.iecr.3c037504.【药物发现】手性胺合成仍然是加速药物发现项目设计周期的一个重大挑战。氢化锆由于其高亲氧性和较低的反应活性，对亚砜基酮胺进行了高度的化学和立体选择性还原。这种锆茂烯介导的还原有助于加速我们的药物发现工作，并适用于药物化学中常用的几种基序。计算研究支持环状半椅过渡态来合理化苯系的高选择性。链接网址：https://pubs-acs-org.libproxy1.nus.edu.sg/doi/10.1021/acs.joc.3c02723DOI：https://doi-org.libproxy1.nus.edu.sg/10.1021/acs.joc.3c027235.【虚拟筛选】药物开发是一项复杂、昂贵且耗时的工作。虽然高通量筛选(HTS)在发现阶段发挥着关键作用，但它也是造成这些挑战的众多因素之一。在某些情况下，虚拟筛选可以补充HTS，可能在药物发现的初始阶段提供更精简的方法。分子对接是一种流行的虚拟筛选技术的一个例子，经常用于此目的;然而，它的效果差别很大。这导致使用共识对接方法，将不同对接方法的结果结合起来，以提高活性化合物的鉴定并减少假阳性的发生。然而，许多这些方法并没有充分利用分子对接的最新进展。作为回应，我们提出了ESSENCE-Dock (Effective Structural Screening ENrichment ConsEnsus Dock)，这是一种新的共识对接工作流程，旨在减少假阳性和增加活性化合物的发现。通过结合新颖的对接算法，我们改进了潜在活性化合物的选择过程。ESSENCE-Dock对用户非常友好，只需要几个简单的命令就可以执行完整的筛选，同时也被设计用于高性能计算(HPC)环境。链接网址：https://pubs-acs-org.libproxy1.nus.edu.sg/doi/10.1021/acs.jcim.3c01982DOI：https://doi-org.libproxy1.nus.edu.sg/10.1021/acs.jcim.3c019826.【生成模型】新支架类杀虫剂的鉴定对农药开发具有重要意义。本研究将基于人工智能的工具和虚拟筛选策略相结合，发现新烟碱类杀虫剂的潜在线索。将递归神经网络与迁移学习相结合，成功构建了深度生成模型。模型评价表明，预训练模型可以准确地掌握类药物分子的SMILES语法，并通过迁移学习产生潜在的新烟碱类化合物。生成的分子通过分层虚拟筛选进行评估，命中进行相似性搜索，并购买最相似的结构用于生物测定。化合物A2和A5在100 mg/L浓度下对克拉蚜的致死率分别为52.5%和50.3%。对接研究表明，这两种化合物与新烟碱类化合物具有相似的结合模式，进一步的分子动力学模拟验证了这一点。链接网址：https://pubs-acs-org.libproxy1.nus.edu.sg/doi/10.1021/acs.jafc.3c06895DOI：https://doi-org.libproxy1.nus.edu.sg/10.1021/acs.jafc.3c06895上下滚动查看更多药企动态2023年3月1日【赛诺菲】国内首个！赛诺菲TNFR1抑制剂获批临床2023年3月1日【辉瑞】治疗青少年湿疹！辉瑞JAK1抑制剂「阿布昔替尼」新适应症在华获批2023年3月1日【科济药业】科济药业BCMA CAR-T产品赛恺泽®国内获批上市2023年2月29日【辉瑞】辉瑞RSV疫苗两季后仍保持强劲效力2023年2月28日【百奥泰】百奥泰keytruda生物类似药将启动III期临床各动态具体信息，请滑动下方文字1.【赛诺菲】3月1日，CDE官网显示，赛诺菲SAR441566临床试验申请获批准，用于治疗中重度斑块型银屑病，以及使用传统合成缓解病情抗风湿药物（cDMARDs）控制不佳或不建议使用这类治疗的中重度类风湿性关节炎（RA）。链接网址请戳我2.【辉瑞】3月1日，国家药监局官网显示，辉瑞的阿布昔替尼获批新适应症，用于治疗对其它系统治疗药物应答不佳或不适宜上述治疗的难治性中度至重度特应性皮炎青少年（12至<18岁）患者。链接网址请戳我3.【科济药业】3月1日，科济药业宣布，国家药品监督管理局已经正式批准赛恺泽®（泽沃基奥仑赛注射液，产品编号：CT053，一种针对BCMA的自体CAR-T候选产品）的新药上市申请，用于治疗复发或难治性多发性骨髓瘤成人患者，既往经过至少3线治疗后进展（至少使用过一种蛋白酶体抑制剂及免疫调节剂）。链接网址请戳我4.【辉瑞】2月29日，辉瑞宣布，RSV疫苗Abrysvo用于60岁及以上老年人群体预防RSV感染导致的下呼吸道疾病（RSV-LRTD）的关键III期RENOIR研究（NCT05035212）取得了积极进展，单次接种疫苗后两个流行季中对RSV A以及RSV B两种亚型都起到了高保护效力。链接网址请戳我5.【百奥泰】2月28日，百奥泰在Clinicaltrials.gov网站上注册了Keytruda生物类似药BAT3306一线治疗非鳞状非小细胞肺癌的三期临床试验。链接网址请戳我上下滚动查看更多会议信息2024年3月21-22日 上海恺默信息咨询有限公司举办SIT 2024第六届小分子药物创新与合作大会2024年3月21-22日 上海恺默信息咨询有限公司举办PDD 2024多肽药物产业发展大会2024年4月18-19日 举办第四届I-RNA小核酸药物深度聚焦峰会2024年6月27-28日 举办上海求实医药咨询有限公司ING 2024第七届免疫及基因治疗论坛各会议具体详情和参会方式，请滑动下方文字SIT 2024第六届小分子药物创新与合作大会主办方： 上海恺默信息咨询有限公司会议时间：2024年3月21日-22日会议地点：上海会议主旨：峰会议题跨越小分子药物研发的热点领域，一览当下化学创新药研发新动向，致力于打破行业的封闭循环，破除行业内卷，助推创新多元发展！一切尽在小分子药物的年度产业大会！链接网址请戳我PDD 2024多肽药物产业发展大会主办方： 上海恺默信息咨询有限公司会议时间：2024年3月21日-22日会议地点：上海会议主旨：共谈多肽减重药物、多肽药物的法规与申报、开发案例与趋势、CMC 各个环节中的难点与挑战。力求为多肽企业致力于多肽药物研究的专家及科研人员提供一个深度的思想碰撞及经验分享平台。链接网址请戳我第四届I-RNA小核酸药物深度聚焦峰会会议时间：2024年4月18日-19日会议地点：苏州会议主旨：破解递送挑战与CMC难点，汇聚最新临床进展与热门研发方向；构建小核酸药物专属交流平台，打造产业闭环，推动国产小核酸药物产业化进程。链接网址请戳我ING 2024第七届免疫及基因治疗论坛主办方：上海求实医药咨询有限公司会议时间：2024年6月27日-28日会议地点：北京会议主旨：聚焦CGT领域开发的核心问题，破除技术壁垒，推动产业不断前进，开启生物医药产业下一个风口！链接网址请戳我上下滚动查看更多版权信息本文内容均由小编收集于公开的各个网络平台，发布的目的仅为了方便大家一站式了解AIDD行业信息，并未对发布源头进行真实性验证。如您发现相关信息有任何版权侵扰或者信息错误，请及时联系AIDD Pro（请添加微信号sixiali_fox59）进行删改处理。原创内容未经授权，禁止转载至其他平台。有问题可发邮件至sixiali@stonewise.cn关注我，更多资讯早知道↓↓↓
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