浙江大学蛋白质组学专题研习班（第7期）招生简章

2023-11-17

引进/卖出

2023年12月18-22日（18日为报到日，22日起上课）

各高校及相关科研单位：

蛋白质组学研究是生命科学的新兴前沿领域，是生命科学进入后基因组时代的标志之一。蛋白质组学不仅是基因组研究逻辑上的延续，也是基因组生物学意义上的拓展与深化，是系统生物学研究重要的组成部分。蛋白质组的研究不仅能为生命活动规律提供物质基础，也能为众多种疾病机理的阐明及攻克提供理论根据和解决途径。

近年来，随着蛋白质组学、生物信息学与质谱分析技术的快速发展，诞生了一系列与蛋白质相关的数据库资源及生物信息学分析工具，在研究蛋白质的鉴定、结构分析与模拟、蛋白与核酸相互作用、与蛋白-蛋白相互作用、分子对接，乃至分子相互作用网络等各个层面为科学研究提供助力。

为进一步帮助广大科研工作者快速掌握提升蛋白质组学原理、实验设计以及后期数据分析技能，浙江大学历经20年的“基因组科学研习班”品牌项目原班人马联合浙江大学多位长期从事蛋白质组学研究的老师及景杰生物资深生信专家倾情推出“蛋白质组学专题研习班”，通过理论授课与上机实践相结合的方式，每人一台PC机，紧随大屏幕演示“跟我学”操作。

培训内容：蛋白质组学背景介绍、质谱分析基础、蛋白组学实验基础与思路、蛋白质组学数据处理、MaxQuant蛋白质组学数据处理（上机实践）、蛋白组组学生物信息学分析、蛋白质组学数据分析及可视化（上机实践）、蛋白质组学功能数据的挖掘（上机实践）、蛋白质组学研究案例说明等。

培训时间：2023年12月18-22日（18日为报到日，22日起上课）。

培训对象：从事生命科学、农学、医学等领域科研工作者和高校教师及研究生。

培训地点：杭州浙江大学

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来源: 生物谷

注册方式：

① 培训费：4200元/人（包含注册费、资料费、上机实践费）。

培训期间食宿自理，会务组可帮助预定。

②缴费方式（指定账号）

账户名称：浙江大学

账户号（开户行）：19042201040000014（农行杭州市浙大支行紫金港分理处）

汇款用途处写明：姓名+上机号（由会务组在回执确认函中提供）

③会务组联系方式：

沈志成 0571-88206783（固） 13958194424（移）

填写报名表并于报到前发送至genetrain@zju.edu.cn，上机实践主办方配备电脑。如有其它要求，请在备注中说明。

④非汇款学员可现场刷卡（含公务卡）或现金交纳

证书发放：

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来源: 生物谷

浙江大学第7期蛋白质组学专题研习班课程安排

日期

时间

内容安排

12月18日（2023年）

全天

杭州浙江大学紫（详见报到通知）

19日

（周二）

08:30~11:30

蛋白质组学背景介绍

系统生物学与蛋白组学发展史

蛋白组的复杂性与动态变化特征

蛋白组学研究展望

14:00~17:00

质谱分析基础

质谱技术发展与常见质谱类型简介

质谱数据采集与谱图解析

多肽的质谱定性定量分析

20日

（周三）

08:30~11:30

蛋白组学实验基础与思路

常见比较蛋白组学流程与设计思路

常见样本处理流程

特殊样本的处理流程

标记与非标记策略

多肽的分级与分离

其他样本前处理策略

14:00~17:00

MaxQuant蛋白质组学数据处理（上机实践）

MaxQuant软件及数据处理流程介绍

LFQ、iBAQ、谱图计数法非标定量

SILAC标记定量

TMT标记定量

结果查看与导出

Persues统计处理与可视化

21日

（周四）

08:30~11:30

蛋白质组学功能数据的挖掘（上机实践）

R语言基础

GO与KEGG通路分析

基于String数据库的蛋白互作分析

基于Cytoscape的互相作用可视化

14:00~17:00

蛋白质组学数据分析及可视化（上机实践）

GSEA功能富集分析

磷酸化激酶预测分析

泛素化E3连接酶预测分析

药物靶预测分析

蛋白三维结构与口袋预测

22日

（周五）

08:30~11:30

蛋白组组学生物信息学分析

蛋白质功能注释

蛋白质组学标准分析

蛋白质组学临床应用

蛋白修饰组学分析

多组学联合分析

14:00~17:00

蛋白质组学研究案例说明

从科学问题到研究闭环

临床大样本与分子分型-以大队列研究为例

翻译后修饰与肿瘤代谢-以新型酰化修饰为例

蛋白质组未来应用展望

本课表仅供参考，课程顺序以报到当天发放课表为准。

培训班主要师资简介

钟伯雄教授博士生导师

浙江大学动物科学学院教授，开展了家蚕丝腺蛋白质组、以及与野蚕后部丝腺的比较蛋白质组学研究，发现蚕茧优质高产主要是核糖体蛋白代谢通路提高；（2）开展了蛋白翻译后修饰研究，明确了与蚕茧优质高产相关的蛋白质磷酸化特征；（3）建立了高效转基因方法，采用TALEN技术在家蚕胚胎时期成功获得基因定点插入研究结果、采用CRISPR-Cas9技术成功突变家蚕重要功能基因，获得稳定遗传突变品种（4）开展了micRNA研究工作，揭示了家蚕丝腺micRNA表达特征。（5）开展了家蚕生物反应器研究，获得了机械性能优良的家蚕蜘蛛复合丝新材料。在JPR、BMC Genomics、IBMB、遗传学报、蚕业科学等国内外杂志发表相关论文160多篇。

郭成副研究员硕士生导师。

以第一作者/通讯作者在Analytical Chemistry, Analytica Chimica Acta等期刊上发表SCI论文28篇，以合作作者身份在Nature，JACS等期刊上发表SCI论文多篇。ACS等出版社十余种SCI期刊审稿人。承担国家自然科学基金面上项目、青年基金、浙江省自然科学基金等科研项目多项，作为科研骨干参与国家自然科学基金杰出青年基金、重点项目等。

赵祖相岚博士

哈尔滨医科大学生物信息学硕士，博士毕业于澳门大学生物医学专业，研究方向为乳腺癌单细胞测序分析，蛋白因子调控与激素作用机制。具有多年组学分析经验，擅长课题方案设计、生物信息学分析思路规划。目前主要从事临床肿瘤大样本蛋白基因组、翻译后修饰调控、多种修饰crosstalk等方向的研究。在多组学联合分析、蛋白基因组建库、生信算法整合、分析流程搭建、数据挖掘与机制探索等方面具有丰富的理论基础与实践经验。数据分析与方法学论文主要发表在Cell reports, EMBO reports, BMC bioinformatics, Nuclear Acid Research, Oncogene等杂志。

孙强强博士

博士毕业于武汉大学，博士期间从事感染免疫、抗感染治疗机制研究。在蛋白组学、空间组学、多组学及蛋白质翻译后修饰等领域有丰富的研究及项目经验。阐明了迄今为止发现的第一个同时调节病原体乳酸代谢及免疫逃逸的转录因子，并解释了代谢途径调节模式如何根据不同宿主生态位演变，对预防和治疗感染提供了重要的理论和医疗意义，并为新型药物开发提供了潜在的靶点。目前，学术论文在Nature Communications, eLife, Antimicrobial Agents and Chemotherapy, Molecular Microbiology等发表。

张佳辉高级工程师

福建医科大学获得生物信息学硕士学位。主要课题利用基因表达相对稳定的秩序关系寻找消化道肿瘤早期诊断、预后相关的biomarker。累计参与大型分析项目30余个，学术论文共同作者15余篇。从事多组学相关的生信工作近5年，具有大量多组学数据分析经验，涉及多癌型、单一癌型不同亚型、多器官、不同生理发育阶段等。对数据挖掘及作图可视化有丰富实战经验，合作文章产出累计影响因子达80+。

赵二杰高级工程师

毕业于哈尔滨医科大学基础七年制，主攻生物信息学方向，擅长大样本多组学数据分析和R语言开发。主导生信算法模块的研发与落地，完成搭建多个新型修饰类算法模块与分析流程，涉及分析内容包含机器学习识别临床生物标志物、蛋白基因组整合分子分型分析、新型修饰数据挖掘、调控酶关联分析等方向。具有丰富的临床多组学大队列项目分析经验与修饰组学研发经历，申报修饰类分析专利多项。

金鑫高级工程师

硕士毕业于东北林业大学细胞生物学专业，从事植物蛋白质组学方向研究，主要内容为植物逆境胁迫的蛋白质组学与生理学分析，揭示植物抗逆的分子机制。主要从事样品制备相关工作，负责样品制备流程的搭建，制备方法的开发与优化，样品制备自动化体系的建立等内容。对各类样本的制备路线及技术流程具有非常丰富的经验，曾对多种不同类型样本进行方法开发和流程优化等工作。