Tsinghua University

细胞是生命的基本单位，人体由30多万亿个功能各异的细胞组成。尽管它们拥有相同的基因组，却因基因表达的差异，在形态、功能和命运上表现出显著多样性。而基因的表达又受染色质可及性等表观遗传机制直接影响——只有染色质处于开放状态，相关基因才有可能被转录并发挥作用。理解这两者在单个细胞内的相互作用，对于揭示正常生理过程和疾病的复杂机制至关重要。在多种类型的癌症中，肿瘤细胞展现出显著的遗传和表观遗传异质性，而肿瘤微环境中的免疫细胞也因其动态的状态转变和功能多样性，进一步加剧了这种复杂性。然而，现有单细胞多组学技术往往受限于通量、成本、数据质量和复杂组织适用性，难以应用于大规模肿瘤样本分析。2025年4月21日，清华大学生命科学学院/北京生物结构前沿研究中心/清华-北大生命科学联合中心的张强锋副教授课题组，联合北京301医院第一医学中心胸外科冯长江副主任医师，在《细胞·系统》（Cell Systems）杂志在线发表了题为“在同一单个细胞中联合分析染色质可及性与基因表达揭示癌症特异性调控程序”(Joint analysis of chromatin accessibility and gene expression in the same single cells reveals cancer-specific regulatory programs) 的研究论文。该研究成功开发了一项单细胞多组学测序技术Parallel-seq，能够高通量、低成本地在同一个单细胞中同步测量基因表达（scRNA-seq）和染色质可及性（scATAC-seq）。Parallel-seq巧妙结合了组合条形码标记与微液滴测序技术，实现“微液滴过载”策略，显著提升了单次实验的效率和通量。Parallel-seq的优势在于：一次实验可并行分析数十万乃至百万级细胞，支持多样本的多组学联合分析，有效降低批次效应的影响；获得高质量的基因表达与染色质可及性的单细胞联合数据的同时，其单个细胞成本仅为现有技术（如10x Multiome）的约1/30。这些优势使得Parallel-seq 适用于大规模样本的单细胞水平基因表达调控研究。图注：Parallel-seq 结合组合索引与微液滴过载技术，同时测量同一个单细胞中染色质可及性和基因表达在该研究中，团队将Parallel-seq应用于40例人类肺癌临床样本（包括22例肿瘤组织和18例配对癌旁组织），获得了超过20万个高质量单细胞的联合组学图谱。基于这一大规模数据集，研究取得了多项重要成果。首先，研究全面描绘了肺癌微环境中复杂的细胞组成，联合分析基因表达与染色质可及性，识别出包括免疫细胞、基质细胞和上皮细胞在内的8类主要细胞群体，并细分出14种功能各异的T细胞亚型。该分析不同于传统的基于基因表达的细胞分型，由于综合了染色质可及性信息，可以揭示多种在单一组学层面难以区分、但在联合组学特征下可明确识别的细胞功能状态。比如，研究发现了不同状态的T细胞在表观遗传调控下的多样性，为解析肿瘤免疫应答机制提供了新视角。同样，由于综合基因表达与染色质可及性信息，Parallel-seq显著增强了对基因组不稳定性特征的解析能力，识别出多种与肺癌进展密切相关的拷贝数变异事件及侵袭性肿瘤细胞亚克隆。研究还在单细胞分辨率下并行分析了染色体外环状DNA（eccDNA）与基因表达，发现携带eccDNA的肿瘤细胞中上皮-间质转化相关转录因子如SOX4显著上调，提示eccDNA可能在肿瘤演进中发挥关键作用。更重要的是，在同一个单细胞内部获得基因表达与染色质可及性信息，可以帮助构建高分辨率的细胞类型特异性增强子-靶基因互作图谱。研究因此揭示了多种免疫和肿瘤关键基因可能受到特异性增强子的调控，并开发方法识别出多个增强子区域的功能性体细胞突变，其中部分可能通过干扰转录因子结合影响基因表达，提示增强子突变在肿瘤发生与调控失衡中的潜在作用。Parallel-seq为单细胞水平下系统解析基因表达与染色质状态的调控关系提供了高通量、低成本且具扩展性的新工具。在肺癌样本中的应用展示了其在解析细胞类型、功能状态及其调控网络方面的强大能力，同时揭示了肿瘤亚克隆的遗传变异、免疫细胞的表观异质性，以及潜在功能性增强子突变，凸显了该技术在肿瘤异质性研究和癌症调控机制解析中的独特优势。未来，Parallel-seq有望拓展至更多疾病模型和组织类型，并与空间组学、蛋白质组学等技术深度融合，推动多组学整合分析，为精准医学提供更加系统和高分辨率的解决方案。本研究由清华大学生命科学学院/北京生物结构前沿研究中心张强锋副教授和北京301医院第一医学中心胸外科冯长江副主任医师共同通讯，清华大学生命科学学院博士后唐磊、博士后张劲松和2017级博士生邵燕秋（已毕业）为共同第一作者，2015级博士生魏逸凡（已毕业）、博士后李雨哲和博士后田康为论文工作做出了重要贡献。研究获得了国家重点研发计划、国家自然科学基金、北京生物结构前沿研究中心、清华-北大生命科学联合中心等多方资助支持，清华大学膜生物学国家重点实验室和高通量筛选平台药物技术中心提供了技术支持。论文链接：www.cell.com/cell-systems/fulltext/S2405-4712(25)00099-7原文链接：https://life-tsinghua-edu-cn.libproxy1.nus.edu.sg/info/1131/6664.htm本文仅用于学术分享，转载请注明出处。若有侵权，请联系微信：bioonSir 删除或修改！

2025年4月21日，清华大学张颢等和微软研究院团队在Journal of Cheminformatics上发表论文Activity cliff-aware reinforcement learning for de novo drug design。在药物发现领域，全新（de novo）分子设计面临的核心挑战之一是结构-活性关系（SAR）的复杂性，尤其是活性悬崖（activity cliffs）现象——微小的分子结构变化可能导致生物活性的显著差异。传统AI模型往往将活性悬崖化合物视为统计异常值，而未能充分利用其在药物设计中的关键价值。针对这一问题，作者提出了活性悬崖感知强化学习框架（ACARL），首次将活性悬崖现象显式整合到AI驱动的分子生成过程中。实验表明，ACARL在多个靶点蛋白的分子生成任务中显著优于现有方法，为药物发现提供了更精准的设计工具。背景与挑战基于AI的全新药物设计通过生成具有特定生物活性的分子，加速了传统药物开发流程。然而，现有模型在建模SAR时存在以下局限性：活性悬崖的忽视：多数模型（特别是生成模型）无法捕捉和利用活性悬崖现象，导致设计出的分子在关键药理区域表现不足；连续性假设的局限：生成模型（如Transformer）倾向于为结构相似的分子分配相近的生成概率，即使它们是活性悬崖对；评价标准的缺陷：现有分子生成基准（如GuacaMol）缺乏对活性悬崖的模拟，降低了算法的实际应用价值。图1 活性悬崖示例方法创新ACARL通过两项核心技术解决了上述问题：活性悬崖指数（ACI）：定量衡量分子对的SAR不连续性，结合Tanimoto距离和活性差异（如结合亲和力），动态识别活性悬崖化合物；对比强化学习损失函数：在RL训练中优先学习活性悬崖化合物和高评分分子，通过加权损失增强模型对关键SAR区域的关注。具体流程包括：预训练阶段：基于ChEMBL数据库训练Transformer模型，获得初始权重；RL微调阶段：利用对接评分（Quick Vina 2）作为环境反馈，通过对比损失动态调整生成策略，优化高活性分子和活性悬崖对的生成概率。图2 ACARL算法流程实验结果ACARL在三个靶点蛋白（5HT1B、5HT2B、ACM2）的测试中表现卓越：结合亲和力：Top-1和Top-100平均对接评分均优于Reinvent、JT-VAE、GCPN等8种基线方法；多样性：生成分子的内部多样性（IntDiv）与基线相当，表明模型在优化活性的同时保持了结构多样性；多目标设计：结合QED和SA评分，ACARL成功生成兼具高活性和可合成性的候选分子（如图3）。图3 多目标设计出的分子结合示意图意义与展望ACARL首次将SAR领域的活性悬崖知识嵌入AI驱动的分子生成框架，其优势包括：药理相关性：通过显式建模活性悬崖，生成的分子更可能具备实际药物开发潜力；灵活性：支持单目标（如结合亲和力）和多目标（如结合亲和力+QED+SA）优化，适配真实药物设计需求。未来研究方向包括：结合湿实验验证生成分子的活性；探索活性悬崖的机理，进一步提升模型可解释性；设计新框架以显式利用活性悬崖相关的生物分子结构、相互作用信息。参考资料Hu, X., Liu, G., Zhao, Y. et al. Activity cliff-aware reinforcement learning for de novo drug design. J Cheminform 17, 54 (2025). https://doi-org.libproxy1.nus.edu.sg/10.1186/s13321-025-01006-3--------- End ---------感兴趣的读者，可以添加小邦微信加入读者实名讨论微信群。添加时请主动注明姓名-企业-职位/岗位或姓名-学校-职务/研究方向。

导读THECAPITAL聚焦创投圈投融资最新情报。本文4789字，约6.8分钟来源 | 融中财经（ID：thecapital）艾华新材完成数千万元A轮融资，浙创投领投先进材料及胶粘技术研发商艾华新材近日完成数千万元人民币 A 轮融资，本轮融资由浙创投领投，容亿资本和平湖金控跟投，资金将主要用于产品研发与市场拓展。艾华新材成立于2019年，位于浙江嘉兴，专注于先进材料和胶粘技术的研发与生产，核心产品围绕降噪、阻燃、密封、绝缘等先进材料技术，广泛应用于汽车、家电、新能源电池、太阳能、储能及电子领域。艾华新材团队初期从新能源汽车领域起步，逐步拓展至家电、建材、轨道交通等多个行业。艾华新材创始人徐平介绍，“客户对产品的需求不断变化，主要集中在轻量化、自动化解决方案以及降本增效等方面。”因此，艾华新材研发的产品包括阻尼材料、增强材料、堵孔材料、吸音棉等，针对解决降低车辆行驶过程中的噪声和震动等问题，提升驾驶舒适性。例如，其阻尼片和补强片可贴在车门、车顶、底盘等部位，通过分子间的运动将振动转化为热能，实现降噪效果。此外，公司还为家电行业提供环保阻尼材料和高效静音阻燃棉，提高家电产品的静音效果，满足客户对环保和高性能的需求。艾华新材通过自主开发的用于新能源汽车减震降噪的改性丁基橡胶复合阻尼材料及其制备方法，其材料密度较传统产品降低40%，单台车减重达8kg，施工效率提升3倍以上。经验证，该材料在-40℃~150℃全温域环境下损耗因子稳定保持0.35，远超国标0.25的技术门槛。其制品已打入全球14家新能源头部主机厂供应链体系，实现批量供货。团队方面，艾华新材创始团队由在全球500强材料企业任职的行业资深技术与管理专家主导，并有高校教授、研究员参与。科悦医疗完成数千万元Pre-A轮融资，加速推进无创神经调控产品市场化科悦医疗（苏州）有限公司（后简称“科悦医疗”）近期完成数千万元Pre-A轮融资。本轮融资由禾丰厚艾、亿生一期基金领投，四川正和祥基金等跟投。本轮融资资金将主要用于无创神经调控设备的产品开发、临床试验及市场开拓。科悦医疗致力于中枢神经领域的无创神经调控治疗设备、便携式监测设备的研发与制造，聚焦于抑郁焦虑失眠症和认知障碍的精准监测与治疗解决方案，产品体系覆盖生理监测、辅助诊断、治疗干预以及疗效评估。科悦医疗在国内率先研制并推出无创迷走神经刺激系统，创新性地提出了神经刺激-生理评估双功能的一体化智能诊疗方案，通过个体化共振呼吸引导的迷走神经刺激，配合基于睡眠脑电、心电大数据为主的特征建模系统构建的个体化迷走神经刺激参数库，实现了治疗方式的个体化、精准化和数字化，同时让治疗全程变得可评可控，本技术在国内外尚属首创。目前已陆续推出经皮迷走神经低频刺激仪、经颅微电流刺激仪、经颅直流电刺激仪、经颅磁刺激仪，多导睡眠脑电监测设备，睡眠脑电数据自动分析软件等多款产品。接下来，科悦医疗将充分结合市场需求和科学研究，重点围绕生理信号采集技术、无创神经电调控技术的深耕和迭代，持续深入临床研究、完善产品体系、拓展销售渠道、提高人才素质，为医疗机构及广大患者提供更加安全有效的整体解决方案。海尔新能源完成7亿元A轮融资海尔新能源科技有限公司完成7亿元A轮融资，本轮投资方包括国投创益、中国石油昆仑资本、普超资本、星航资本、恒旭资本。海尔新能源专注于数智化分布式智慧清洁能源解决方案，提供光伏、储能系统一站式服务。根据财联社创投通—执中数据，以2025年4月为预测基准时间，后续2年的融资预测概率为48.14%。汇业电力完成3000万元A轮融资 加码智能配网系统研发专注于新一代配网自动化系统研发的汇业电力近日宣布完成3000万元A轮融资。该公司致力于将人工智能与大数据技术融入电网运维领域，通过智能监测解决方案提升故障预测精度与运维效率。据悉，本轮资金将重点投向新一代配网自动化系统研发，并布局深远海风电、柔性直流输电等新兴场景的技术适配。其研发方向与福建省"深远海风电规模化开发"战略高度契合，有望为新能源基础设施建设提供关键技术支撑。汇业电力表示，智能监测系统的优化将有效提升电网在复杂环境下的稳定性，为清洁能源并网提供更可靠的解决方案。半导体显示高端装备企业「福拉特」完成Pre-A轮融资近日，国内半导体显示装备制造领域的领军企业江苏福拉特自动化设备有限公司（以下简称“福拉特”）正式宣布完成数千万元Pre-A轮融资。本轮融资由南创投、新港高投、东方产融联合投资。此轮融资不仅彰显资本市场对福拉特技术实力与战略前景的高度认可，更成为企业突破高端湿法制程装备核心工艺壁垒、加速国产替代商业化落地的关键里程碑。江苏福拉特成立于2011年8月，致力于高端显示、泛半导体湿法工艺制程装备自主创新研发制造。作为国内领先的湿法制程装备一站式供应商，针对半导体及显示装备前沿技术、国家卡脖子技术、国产替代技术进行攻克，技术上已取得多项显著成果。本轮融资将加速福拉特从“国产替代”向“行业引领”的战略升级，重点布局四大方向：1.技术攻坚：聚焦半导体湿法高端制程设备、Micro LED、Micro OLED等下一代显示技术核心设备的研发；2.产能扩张：扩充生产基地，提升高端装备规模化交付能力；3.生态共建：深化与头部显示及半导体厂商的战略合作，推动技术革新；4.产学研融合：联袂南大、东大等顶尖学府共建创新联合体，打通“技术研发-中试-产业化”闭环。鉴智机器人完成数千万美元B轮融资近日，自动驾驶技术研发商鉴智机器人完成数千万美元B轮融资，本轮投资方为微光创投。鉴智机器人以视觉3D理解为核心，通过多传感器特征级前融合，实现对自动驾驶车辆环境的感知和理解，打造端到端数据驱动的自动驾驶解决方案。公司已推出L2/L2+高级辅助驾驶量产化方案。根据财联社创投通—执中数据，以2025年4月为预测基准时间，后续2年的融资预测概率为86.82%。硅基负极设备研发商纽姆特完成超亿元B轮融资，中金资本光速光合等投资近日，硅基负极设备研发商纽姆特完成超亿元B轮融资，由中金资本、光速光合、张家港产投、德同资本、天堂硅谷、国君创投等多家机构联合投资。苏州纽姆特纳米科技有限公司成立于2014年10月，核心团队由北京化工大学和清华大学等知名高等院校的专业人士组成，在石化、锂电池、光伏、新材料等行业头部企业的任职经历，拥有坚实的理论基础、丰富的设计和实践经验。近年来，纽姆特引入了众多头部企业高级管理人才与研发人才，在流化床反应器的研发、设计、制造和安装培训方面，已在国内外精细化工领域取得了领先地位。纽姆特专注于以流化床-化学气相沉积技术（FB-CVD）为核心的材料制造设备的研发与应用，其核心设备目前主要用于硅碳负极材料的表面包覆，可以显著提升锂电池的能量密度和循环性能。纽姆特的核心产品流化床设备，是生产新型硅基负极材料过程中需要使用的最关键设备之一。在技术产品方面，纽姆特推出了包括FB-CVD流化床气相沉积设备、量产型碳纳米管生产线、硫化物固态电解质纳米包覆、FB-SDNC流化床喷雾纳米包覆等一系列创新产品。这些产品覆盖了从实验级到中试级再到量产级的流化床反应器，广泛应用于锂电池硅碳负极、石墨改性、正极材料包覆改性、固态电解质等多个领域。尤其在新型硅碳负极材料的制备上，公司的流化床气相沉积设备为行业发展做出了突出贡献。流化态技术是纽姆特的核心技术之一，通过化学气相沉积法制备具有三维多孔结构的碳骨架复合硅碳材料，实现高效、均匀的粉体材料处理，这种结构设计不仅有效缓解了硅材料在充放电过程中的体积膨胀效应，还显著提升了材料的循环稳定性和倍率性能。科塞尔医疗完成近亿元B+轮融资近日，科塞尔医疗科技（苏州）有限公司（简称：科塞尔医疗）宣布完成近亿元B+轮融资。本轮融资由国内知名投资机构铁投巨石领投，苏高新金控持续追加投资，园雍投资跟投，资金将用于核心产品研发、全球市场推广及产能扩建。据天眼查，科塞尔医疗成立于2013年11月，是一家具有血管介入器械全方位生产和研发能力的平台企业，致力于为临床提供系统解决方案。科塞尔医疗外周领域的创新产品腔静脉滤器成功注册并顺利商业化，是国内首个获准注册的伞形长效滤器，另外数个创新产品即将进入临床试验。冠脉领域的球囊类产品获得中国NMPA、美国FDA、欧盟CE、日本PMDA、韩国KFDA等多国注册证书并进入国际主流市场。公司董事长&总经理&CEO胡清是中国生物医学工程学会第二届生命科学仪器专业委员会委员，苏州高新区2019年科技创新创业领军人才，获得多项荣誉。先后在三星电子、美国杜邦等世界500强公司任管理工作，2002年开始进入医疗器械行业，在维科医疗器械(苏州)有限公司任职10余年，先后担任财务总监、市场总监和常务副总经理，全面管理公司的运营、研发和市场开发。此前公司已经完成4轮融资，背后资方包括达晨财智、巨石创投等。目前公司已形成 “一核三翼” 业务布局。母公司构建外周介入 “一站式” 治疗体系（覆盖静脉 /动脉），子公司海宇新辰深耕心脏电生理领域（提供快速性心律失常治疗全方位解决方案），子公司米新医疗聚焦冠脉介入产品研发及境外技术转化，子公司海望医疗致力于突破医用核心原材料“卡脖子”技术。俺来也完成数千万元Pre-C轮融资 加速向全域数字化生活服务平台战略升级近日，中国高校数字化新零售企业俺来也（上海）网络科技有限公司（以下简称“俺来也”）宣布完成数千万元Pre-C轮融资，本轮投资由魔量资本、同策资本及晨光股份等机构资本和数位知名投资人共同投资。目前首期投资款已经到位，全部投资款项将于近期全部到位。值得关注的是，此次融资后，公司正式启动上市筹备工作，标志着其从校园新零售独角兽向全域数字化生活服务平台的战略升级。本轮融资是俺来也继2021年B+轮融资后再次获得头部产业资本加持。魔量资本创始人胡泽民作为移动互联网领域的资深投资人，曾主导对拼多多、Bilibili等明星项目的早期投资，此次对俺来也的加注，印证了资本市场对校园经济数字化赛道的持续信心。同策资本的战略投资更具产业协同深意。其背后同策集团作为上海最大养老社区运营商，已与俺来也达成深度合作——公司将为同策旗下养老社区提供定制化数字生活服务解决方案，标志着业务场景从高校向社区及社会全渠道延伸，目前已应用覆盖包括养老社区在内的工厂、医院、社区食堂等多个场景。晨光文具作为全球最大的文具制造商之一，此次投资不仅在资本上助力俺来也完成现有高校校园业务的复制推广，加速高校校园生态布局整合，在高校本地生活业务上也具有重大意义。晨光旗下杂物社和晨光生活馆等新零售品牌布局校园，与俺来也共同打造晨光校园生活馆，推进产品升级和文创升级。中国最大的自营海外仓完成数千万美元C轮融资全球一体化供应链综合服务商泛鼎国际集团完成数千万美元C轮融资。本轮融资由嘉御资本领投，神骐资本、明裕创投、金銮证券跟投，顺为资本、普华资本等老股东继续加注，光源资本担任独家财务顾问。融资资金将用于加速新兴市场的本土化运营能力构建，提升企业内部智能化、数字化升级。核心医疗完成超1亿美元D轮融资近日，深圳核心医疗科技股份有限公司（以下简称“核心医疗”）成功完成超1亿美元D轮融资，本轮融资由正心谷资本、社保基金中关村自主创新专项基金（由君联资本担任管理人）、阿美风险投资旗下Prosperity7 Ventures（P7）、基石资本及知名产业投资方联合领投，德联资本及联新资本机构参与投资。核心医疗称，本轮融资的成功是投资方对核心医疗的极大认可，对公司及行业具有深远的意义。一方面，有利于公司突破性原创技术的研发孵化，加速推进具有行业革新意义的产品创新；另一方面，有助于公司深化全球化战略布局，通过提升核心技术竞争力，扩大国际市场影响力，同时持续强化企业在人工心脏领域的全球领导地位，以自主创新实力引领行业技术变革与发展。核心医疗创始人兼CEO余顺周表示：“我们深感荣幸能够获得各方专业投资人的支持与认可，这不仅是对我们过往成绩的肯定，更为我们未来的征程注入了强大动力。此次融资将有力加速核心医疗全管线产品的国际化进程，核心医疗也将继续依托技术创新，为全球心衰患者带来更新、更好的创新医疗产品。”# 线索爆料 # rzcj@thecapital.com.cn融中官方粉丝群在这里，你可以获取丰富的股权投资行业资讯、热点报道；前沿行业报告、重点课题研究、最新业内动态。链接资本，连接市场，联结资源，共同打造创投交流新平台、合作共赢朋友圈。END开白/线上咨询：irongzhong媒体合作：010-84464881商务合作：010-84467811