更新于：2024-11-01

YTHDC1

更新于：2024-11-01

基本信息

别名

KIAA1966、Splicing factor YT521、YT521

+ [4]

简介

Regulator of alternative splicing that specifically recognizes and binds N6-methyladenosine (m6A)-containing RNAs (PubMed:25242552, PubMed:26318451, PubMed:26876937, PubMed:28984244). M6A is a modification present at internal sites of mRNAs and some non-coding RNAs and plays a role in the efficiency of mRNA splicing, processing and stability (PubMed:25242552, PubMed:26318451). Acts as a key regulator of exon-inclusion or exon-skipping during alternative splicing via interaction with mRNA splicing factors SRSF3 and SRSF10 (PubMed:26876937). Specifically binds m6A-containing mRNAs and promotes recruitment of SRSF3 to its mRNA-binding elements adjacent to m6A sites, leading to exon-inclusion during alternative splicing (PubMed:26876937). In contrast, interaction with SRSF3 prevents interaction with SRSF10, a splicing factor that promotes exon skipping: this prevents SRSF10 from binding to its mRNA-binding sites close to m6A-containing regions, leading to inhibit exon skipping during alternative splicing (PubMed:26876937). May also regulate alternative splice site selection (PubMed:20167602). Also involved in nuclear export of m6A-containing mRNAs via interaction with SRSF3: interaction with SRSF3 facilitates m6A-containing mRNA-binding to both SRSF3 and NXF1, promoting mRNA nuclear export (PubMed:28984244). Involved in S-adenosyl-L-methionine homeostasis by regulating expression of MAT2A transcripts, probably by binding m6A-containing MAT2A mRNAs (By similarity). Also recognizes and binds m6A on other RNA molecules (PubMed:27602518). Involved in random X inactivation mediated by Xist RNA: recognizes and binds m6A-containing Xist and promotes transcription repression activity of Xist (PubMed:27602518). Also recognizes and binds m6A-containing single-stranded DNA (PubMed:32663306). Involved in germline development: required for spermatogonial development in males and oocyte growth and maturation in females, probably via its role in alternative splicing (By similarity).

关联

项与 YTHDC1 相关的药物

YTHDC1 inhibitors(University of Zurich)

靶点

YTHDC1

作用机制

YTHDC1 inhibitors

在研机构

University of Zurich

原研机构

University of Zurich

在研适应症

急性髓性白血病

非在研适应症-

最高研发阶段药物发现

首次获批国家/地区-

首次获批日期1800-01-20

100 项与 YTHDC1 相关的临床结果

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100 项与 YTHDC1 相关的转化医学

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0 项与 YTHDC1 相关的专利（医药）

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405

项与 YTHDC1 相关的文献（医药）

2024-12-31·Epigenetics

Biogenesis of circRBM33 mediated by N6-methyladenosine and its function in abdominal aortic aneurysm

Article

作者: Weng, Xiang ; Qiu, Jiacong ; Xu, Yingqi ; Wang, Shizhi

This study aimed to explore whether m6A modification affects the biogenesis of circRBM33, which is involved in the progression of abdominal aortic aneurysm (AAA). For in vitro experiments, vascular smooth muscle cells (VSMCs) were treated with Ang II. MeRIP‒PCR was used to assess m6A modification of circRBM33. Gene expression was measured using RT‒qPCR and Western blotting. For in vivo experiments, a mouse model of AAA was established via Ang II infusion. HE, Sirius Red and TUNEL staining was performed to evaluate pathological changes and cell apoptosis in aortic vessels. The results showed that the m6A level of circRBM33 was abnormally increased in Ang II-induced VSMCs. In addition, METTL3 positively regulated circRBM33 expression. YTHDC1 deficiency decreased circRBM33 expression but had no effect on RBM33 mRNA expression. Notably, neither METTL3 nor YTHDC1 influenced the stability of circRBM33 or RBM33 mRNA. The interaction between circRBM33 and METTL3/YTHDC1 was verified by RIP analysis. Moreover, the Ang II-induced increase in circRBM33 expression was reversed by cycloleucine (an inhibitor of m6A methylation). Importantly, the m6A modification and expression of circRBM33 in the circRBM33-m6A-mut2-expressing VSMCs were not altered by METTL3 silencing. Mechanistically, METTL3/YTHDC1 modulates the biogenesis of circRBM33 in an m6A-dependent manner. In addition, circRBM33 knockdown alleviated AAA by reducing ECM degradation in the Ang II-infused mice. In conclusion, this study demonstrated that METTL3/YTHDC1-mediated m6A modification modulates the biogenesis of circRBM33 from exons of the RBM33 gene. Moreover, knockdown of circRBM33 alleviated AAA by reducing ECM degradation, which may provide a novel therapeutic strategy for treating AAA.

2024-12-01·Cellular and Molecular Life Sciences

Epitranscriptomic regulation of lipid oxidation and liver fibrosis via ENPP1 mRNA m6A modification

Article

作者: Jia, Lin ; Hu, Wei ; Tao, Hui ; Yang, Jing-Jing ; Dong, Qi-Qi ; Sun, Feng ; Lu, Chao ; Yang, Yang ; Wang, Juan

BACKGROUNDDysregulated lipid oxidation occurs in several pathological processes characterized by cell proliferation and migration. Nonetheless, the molecular mechanism of lipid oxidation is not well appreciated in liver fibrosis, which is accompanied by enhanced fibroblast proliferation and migration.METHODSWe investigated the causes and consequences of lipid oxidation in liver fibrosis using cultured cells, animal models, and clinical samples.RESULTSIncreased ecto-nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase (ENPP1) expression caused increased lipid oxidation, resulting in the proliferation and migration of hepatic stellate cells (HSCs) that lead to liver fibrosis, whereas fibroblast-specific ENPP1 knockout reversing these results. Elevated ENPP1 and N⁶-methyladenosine (m⁶A) levels were associated with high expression of Wilms tumor 1 associated protein (WTAP). Mechanistically, WTAP-mediated m⁶A methylation of the 3'UTR of ENPP1 mRNA and induces its translation dependent of YTH domain family proteins 1 (YTHDF1). Additionally, ENPP1 could interact with hypoxia inducible lipid droplet associated (HILPDA) directly; overexpression of ENPP1 further recruits HILPDA-mediated lipid oxidation, thereby promotes HSCs proliferation and migration, while inhibition of ENPP1 expression produced the opposite effect. Clinically, increased expression of WTAP, YTHDF1, ENPP1, and HILPDA, and increased m⁶A mRNA content, enhanced lipid oxidation, and increased collagen deposition in human liver fibrosis tissues.CONCLUSIONSWe describe a novel mechanism in which WTAP catalyzes m⁶A methylation of ENPP1 in a YTHDF1-dependent manner to enhance lipid oxidation, promoting HSCs proliferation and migration and liver fibrosis.

2024-12-01·Molecular Biology Reports

Transcriptome-wide profiling identifies colon cancer-associated m6A transcripts and potential RNA methyl modifiers

Article

作者: Kodous, Ahmad S ; Ramasamy, Deepa ; Balaiah, Meenakumari ; Maharajan, Hema Raja Pushpam ; Thippannah, Megha ; Rao, Arunagiri Kuha Deva Magendhra ; Mani, Samson ; Mehta, Anurag ; Herceg, Zdenko ; Seshadri, Ramakrishnan Ayloor

BACKGROUNDN6-methyladenosine (m6A) is a prevalent and crucial RNA methylation modification that plays a significant role in various biological and pathological processes. The dysregulation of m6A has been linked to the initiation, progression, and metastasis of several cancer types, including colon cancer. The transcriptome of colon cancer indeed provides insight into dysregulated coding and non-coding RNAs, but it does not reveal the mechanisms, such as m6A modifications, that determine post-transcriptional and pre-translational regulations. This study using MeRIP sequencing aims to explain the distribution of m6A modification across altered gene expression and its association with colon cancer.METHODS AND RESULTSThe levels of m6A in different colon cancer cell lines were quantified and correlated with the expression of m6A modifiers such as writers, readers, and erasers. Our results showed that global m6A levels in colon cancer were associated with METTL14, YTHDF2, and YTHDC1. We performed Epi-transcriptome profiling of m6A in colon cancer cell lines using Methylated RNA Immunoprecipitation (MeRIP) sequencing. The differential methylation analysis revealed 7312 m6A regions among the colon cancer cell lines. Our findings indicated that the m6A RNA methylation modifications were mainly distributed in the last exonic and 3' untranslated regions. We also discovered that non-coding RNAs such as miRNA, lncRNA, and circRNA carry m6A marks. Gene set enrichment and motif analysis suggested a strong association of m6A with post-transcriptional events, particularly splicing control. Overall, our study sheds light on the potential role of m6A in colon cancer and highlights the importance of further investigation in this area.CONCLUSIONThis study reports m6A enrichment in the last exonic regions and 3' UTRs of mRNA transcripts in colon cancer. METTL14, YTHDF2, and YTHDC1 were the most significant modifiers in colon cancer cells. The functions of m6A-modified genes were found to be RNA methylation and RNA capping. Overall, the study illustrates the transcriptome-wide distribution of m6A and its eminent role in mRNA splicing and translation control of colon cancer.

项与 YTHDC1 相关的新闻（医药）

2024-06-24

·生物探索

Molecular Cancer | 揭示RNA甲基化如何影响肿瘤免疫：从机制到治疗（综述）

引言 RNA甲基化是一种常见的转录后修饰，在研究领域中引起了广泛关注。它通过调节RNA剪接、翻译、运输和稳定性，对多种生物功能进行调控。值得注意的是，研究表明，RNA甲基化对肿瘤免疫具有显著影响。主要的RNA甲基化类型包括N6-甲基腺嘌呤(m6A)、5-甲基胞嘧啶(m5C)、N1-甲基腺嘌呤(m1A)、N7-甲基鸟嘌呤(m7G)和3-甲基胞嘧啶(m3C)。RNA甲基化参与了肿瘤微环境(TME)的调控。通过影响RNA翻译和稳定性，RNA甲基化通过“写入者”、“擦除者”和“读取者”调节免疫细胞和免疫因子的失调。因此，RNA甲基化在调节肿瘤免疫和介导多种生物行为（包括增殖、侵袭、转移等）中起着关键作用。 6月20日Molecular Cancer发表的综述“The role of RNA methylation in tumor immunity and its potential in immunotherapy”，讨论了几种RNA甲基化的机制和功能，全面概述了它们在肿瘤微环境和免疫细胞中的生物作用和基本机制。通过探讨这些RNA修饰如何介导肿瘤免疫逃逸，还分析了它们在免疫治疗中的潜在应用，为RNA甲基化新靶点的识别和提高癌症免疫治疗效果提供新的见解和策略。 RNA修饰通过对RNA碱基和核糖的化学变化，显著影响基因表达。到目前为止，研究人员已经在各种RNA类别（包括原核生物和真核生物）中鉴定出了超过170种化学修饰。其中，RNA甲基化占所有RNA修饰的60%以上，在转录后基因调控中起着重要作用。主要的RNA甲基化形式包括N1-甲基腺嘌呤(m1A)、N6-甲基腺嘌呤(m6A)、5-甲基胞嘧啶(m5C)、N7-甲基鸟嘌呤(m7G)和3-甲基胞嘧啶(m3C)，这表明它在塑造基因调控的复杂景观中具有广泛存在和重要意义。RNA甲基化由三类蛋白质介导：“写入者”催化甲基基团的添加；“读取者”识别这些修饰；“擦除者”去除这些修饰，每种蛋白质通过独特的机制发挥作用。这些蛋白质调节多种RNA类型和信号通路，包括mRNA、tRNA、长链非编码RNA(lncRNA)、小RNA(sRNA)等。作为一个动态且可逆的过程，RNA甲基化调节着关键的生物过程，如剪接、翻译、运输和RNA稳定性。大量研究表明，RNA甲基化在多种癌症的发生和进展中起着至关重要的作用，包括乳腺癌、肺癌、结直肠癌(CRC)、肝细胞癌(HCC)、胃癌(GC)、食道癌(EC)、前列腺癌(PCa)、膀胱癌、卵巢癌、急性髓性白血病(AML)、胰腺癌等，凸显了它在恶性肿瘤中的关键作用。近年来，许多研究强调了RNA甲基化与各种免疫过程之间的密切关联，特别是在肿瘤免疫背景下。此外，调控蛋白的异常表达与致癌活动和增强的转移特性有关。RNA甲基化还在维持肿瘤微环境(TME)的稳态和代谢重编程中起着关键作用，影响免疫细胞的功能。TME由包括免疫细胞、基质细胞、细胞外基质、血管和其他可溶性因子在内的复杂多细胞基质组成。RNA甲基化通过影响癌基因和转移能力，破坏TME的和谐，损害免疫细胞功能，从而促进肿瘤免疫逃逸。例如，m6A写入者METTL3已知维持高水平的糖酵解，并在HCC中诱导代谢重编程。这种酶还影响巨噬细胞极化、树突状细胞的活化、效应T细胞的分化和增殖以及免疫检查点的表达。这些相互作用展示了RNA甲基化如何将TME和免疫细胞与肿瘤免疫逃逸的机制联系起来。目前，研究人员正在探索可能抑制METTL3和其他RNA甲基化调节因子的潜在抑制剂，希望这些化合物能用于免疫治疗。 RNA甲基化是一种常见的转录后修饰(post-transcriptional modification)，在基因表达调控中扮演着关键角色。近年来，研究人员发现，RNA甲基化不仅在正常生理过程中重要，而且在肿瘤的发生和发展中也起到关键作用。尤其是它在调控肿瘤免疫和免疫逃逸方面的功能，引起了广泛关注。 RNA甲基化的类型与机制目前已知的RNA甲基化类型超过170种，其中最主要的包括N6-甲基腺嘌呤(m6A)、5-甲基胞嘧啶(m5C)、N1-甲基腺嘌呤(m1A)、N7-甲基鸟嘌呤(m7G)和3-甲基胞嘧啶(m3C)。这些修饰通过特定的蛋白质进行调控：写入者(Writers)：如METTL3和METTL14等，催化甲基基团的添加。擦除者(Erasers)：如FTO和ALKBH5等，去除甲基基团。读取者(Readors)：如YTHDF1和IGF2BP1等，识别并结合甲基化修饰，调控RNA的功能。其中，m6A是最常见的RNA甲基化形式，广泛存在于mRNA、rRNA、tRNA、长链非编码RNA(lncRNA)和小RNA(sRNA)中。m6A甲基化调控着RNA的剪接、翻译、稳定性和运输等关键生物过程。 RNA甲基化的机制以及RNA甲基化如何调控RNA的命运和生物功能（Credit: Molecular Cancer） RNA甲基化的写入者(Writers)：m6A：METTL3和METTL14；m5C：NSUN2；m1A： TRMT10A；m7G：METTL1。 RNA甲基化的擦除者(Erasers)：m6A：FTO和ALKBH5。 RNA甲基化的读取者(Readors)：IGF2BP1/2/3、YTHDF1/2/3、YTHDC1/2/3、YBX1、ALYREF、CBC、eIF4E等蛋白质可以识别并结合RNA上的甲基化修饰。 RNA甲基化对RNA命运的调控：RNA甲基化可以调控mRNA的剪接、导出、稳定性、降解和翻译等生物功能。关键蛋白：METTL3 (methyltransferase-like 3)，FTO (obesity-associated protein)，ALKBH5 (AlkB homolog 5)，TET1/2/3 (ten-eleven translocation proteins 1/2/3)，ALKBH1 (α-ketoglutarate-dependent dioxygenase ABH1) RNA甲基化在肿瘤中的作用大量研究表明，RNA甲基化在多种癌症的发生和进展中起着至关重要的作用。例如，m6A写入者METTL3在肝细胞癌(HCC)中维持高水平的糖酵解，并诱导代谢重编程。这种酶还影响巨噬细胞的极化、树突状细胞的活化、效应T细胞的分化和增殖以及免疫检查点的表达。 METTL3在HCC中的作用：研究表明，METTL3通过上调葡萄糖转运蛋白(GLUT1)的表达，促进糖酵解进程，从而为肿瘤细胞的增殖提供必要的能量条件。此外，METTL3还通过调控HIF-1α的表达，促进缺氧条件下肿瘤细胞的存活和增殖。 NSUN2在食道癌中的作用：NSUN2通过稳定GRB2的表达，增强癌细胞的增殖和迁移能力。另有研究表明，NSUN2能够通过调控CDKN1A的表达，抑制脂肪生成，表明NSUN2在肿瘤代谢重编程中也起到重要作用。肿瘤微环境(TME)的组成以及RNA甲基化如何通过缺氧、代谢重编程和酸性环境来促进肿瘤免疫逃逸（Credit: Molecular Cancer）肿瘤微环境的组成：肿瘤微环境包括免疫细胞、基质细胞、细胞外基质、血管和其他可溶性因子。 RNA甲基化在肿瘤免疫逃逸中的作用：缺氧诱导因子(HIF)通过m6A、m5C、m1A和m7G RNA甲基化来调控免疫抑制性TME的形成，并促进肿瘤免疫逃逸。RNA甲基化调控生物代谢，包括葡萄糖代谢、脂质代谢和氨基酸代谢，导致免疫细胞功能障碍和酸性环境的形成，从而促进肿瘤发生、血管生成和肿瘤细胞增殖。这些变化进一步加重组织缺氧，促进肿瘤进展。代谢重编程与肿瘤进展：葡萄糖代谢：通过m6A、m5C、m1A和m7G RNA甲基化调控葡萄糖代谢途径，促进肿瘤细胞的糖酵解；脂质代谢：RNA甲基化调控脂质代谢，影响脂肪酸的合成、降解和储存，促进肿瘤细胞的膜结构和能量生成；氨基酸代谢：RNA甲基化调控非必需氨基酸(NEAAs)和必需氨基酸(EAAs)的代谢，影响肿瘤细胞的生长和免疫逃逸。相互作用与协同作用：缺氧、代谢重编程和酸性环境相互作用，共同促进肿瘤免疫逃逸；缺氧环境激活HIF，进一步调控RNA甲基化，促进肿瘤进展；代谢重编程导致酸性环境的形成，影响免疫细胞功能，加剧肿瘤免疫逃逸。 RNA甲基化与肿瘤免疫 RNA甲基化在肿瘤免疫调控中发挥着重要作用。它通过影响肿瘤微环境(TME)中的免疫细胞和免疫因子的失调，调节肿瘤免疫逃逸机制。主要机制包括：调控免疫细胞功能：RNA甲基化通过调控免疫细胞如巨噬细胞、树突状细胞(DCs)、髓源性抑制细胞(MDSCs)和调节性T细胞(Tregs)的功能，影响肿瘤免疫逃逸。例如，m6A写入者METTL3促进巨噬细胞的M1极化，增强其抗肿瘤能力，而FTO则通过抑制NF-κB信号通路，抑制M1和M2巨噬细胞的极化。调控TME稳态：RNA甲基化通过调控糖酵解、脂肪代谢和氨基酸代谢，影响TME的代谢重编程，进而影响肿瘤免疫。例如，METTL3通过上调GLUT1的表达，促进糖酵解进程，为肿瘤细胞的增殖提供条件。调控免疫检查点：RNA甲基化通过调控免疫检查点如PD-1/PD-L1的表达，影响肿瘤免疫逃逸。研究表明，m6A读取者YTHDF1在DCs中上调MHC-II的表达，增强抗原呈递能力，从而增强免疫反应。 RNA甲基化如何参与肿瘤微环境(TME)的代谢重编程，包括葡萄糖代谢、脂质代谢和氨基酸代谢（Credit: Molecular Cancer） RNA甲基化在代谢重编程中的作用：RNA甲基化调控与糖酵解相关基因（如GLUT1、Gys2、HDGF）和信号通路（如PI3K-AKT、mTORC1、MAPK、Wnt-β catenin、Hedgehog、NF-κB、IL-6/JAK2/STAT3、cGAS/STING）的表达，通过这些调节因子（如METTL1、METTL3、METTL14、NOP2、NSUN2、FTO、ALKBH3、IGF2BP3、YTHDC1）增强Warburg效应。葡萄糖代谢：m6A、m5C和m7G甲基化通过调控糖酵解相关基因和信号通路，促进葡萄糖代谢。例如，METTL3通过上调GLUT1的表达，增强糖酵解进程。脂质代谢：m6A和m5C甲基化加速脂质积累。具体而言，m6A和m5C甲基化调控脂质代谢相关基因（如ACLY和SCD1）的表达，促进脂肪酸的合成和储存。氨基酸代谢：m6A、m5C和m7G甲基化调控谷氨酰胺、精氨酸、蛋氨酸和赖氨酸的代谢。例如，BCAT1（支链氨基酸转氨酶1）在AML中通过重编程BCAA代谢促进癌症发生。代谢重编程的影响：这些甲基化修饰影响肿瘤细胞的免疫原性、增殖、免疫逃逸以及肿瘤进展。例如，m6A读取者IGF2BP3通过稳定PRMT1 mRNA，调控蛋白精氨酸甲基转移酶1（PRMT1）的表达，从而影响肿瘤细胞的功能。 YTHDF1在DCs中的作用：通过敲除YTHDF1基因，研究人员发现DCs中的MHC-II表达显著增加，IL-12的分泌也有所增强，从而提升了适应性免疫反应。 METTL3在MDSCs中的作用：研究发现，敲除METTL3基因能够显著减少MDSCs的积累，从而增强CD8+ T细胞的活化和增殖。 FTO在肿瘤中的作用：FTO抑制剂能够通过抑制肿瘤细胞的糖酵解进程，逆转CD8+ T细胞的活化和效应状态。结合FTO抑制剂和抗PD-L1治疗，有望显著提高抗肿瘤免疫反应。 RNA甲基化如何在肿瘤微环境(TME)中调控免疫细胞的生物功能，包括免疫细胞的分化、发育、浸润、活化、增殖和凋亡（Credit: Molecular Cancer）免疫细胞的分化和发育：RNA甲基化在免疫细胞的分化和发育中起重要作用。例如，m6A和m5C甲基化调控CD8+ T细胞的浸润和活化，并介导其功能障碍。肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的极化：RNA甲基化促进肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)向M1型或M2型巨噬细胞的极化；TAMs的M1型巨噬细胞具有抗肿瘤作用，而M2型巨噬细胞则具有促肿瘤作用。树突状细胞(DCs)、髓源性抑制细胞(MDSCs)和调节性T细胞(Tregs)的增殖和浸润：RNA甲基化调控树突状细胞(DCs)、髓源性抑制细胞(MDSCs)和调节性T细胞(Tregs)的增殖和浸润。例如，m6A甲基化通过调控DCs的抗原呈递能力，影响免疫反应。 T细胞的分化和发育：RNA甲基化在T细胞的分化和发育中起重要作用。m1A和m7G甲基化参与CD4+ T细胞和CD8+ T细胞的活化、浸润和增殖，但这些过程中m1A和m7G的具体调控机制尚需进一步研究。 RNA甲基化在肿瘤免疫反应和逃逸中的作用：RNA甲基化通过影响免疫细胞的分化、发育、浸润、活化、增殖和凋亡，调控肿瘤免疫反应和逃逸。例如，m6A和m5C甲基化通过抑制CD8+ T细胞的浸润和活化，介导其功能障碍，从而促进肿瘤免疫逃逸。 RNA甲基化在免疫治疗中的潜力随着对RNA甲基化在肿瘤免疫调控中作用的深入研究，研究人员开始探索其在免疫治疗中的应用潜力。通过靶向RNA甲基化调控蛋白，有望开发出新的免疫治疗策略，提高癌症治疗的效果。靶向METTL3：研究发现，抑制METTL3的表达能够显著减少MDSCs的积累，从而增强CD8+ T细胞的活化和增殖。靶向METTL3的抑制剂有望成为一种新的免疫治疗手段。靶向FTO：FTO作为一种去甲基酶，其抑制剂已被证明能够通过抑制肿瘤细胞的糖酵解进程，逆转CD8+ T细胞的活化和效应状态。结合FTO抑制剂和抗PD-L1治疗，有望显著提高抗肿瘤免疫反应。靶向YTHDF1：抑制YTHDF1的表达能够增强树突状细胞的抗原呈递能力，从而增强免疫反应。研究表明，YTHDF1抑制剂有望提高癌症患者对免疫治疗的响应率。 RNA甲基化如何通过其调控因子调节免疫检查点的表达，并且在急性髓性白血病(AML)中，几种小分子抑制剂联合免疫检查点阻断疗法的应用（Credit: Molecular Cancer）共抑制性受体-配体复合物：包括PD-1/PD-L1、CTLA-4/CD80、VISTA等。这些复合物通过与肿瘤细胞上的相应配体结合，向T细胞传递负性信号，从而抑制T细胞的抗肿瘤反应。共刺激性受体-配体复合物：包括CD40/CD40L、ICOS/ICOSL等。这些复合物通过与肿瘤细胞上的相应配体结合，向T细胞传递正性信号，从而增强T细胞的抗肿瘤反应。 RNA甲基化调控免疫检查点的机制：m6A和m5C甲基化通过调控免疫检查点的表达、翻译和稳定性，影响其对免疫治疗的敏感性。例如，免疫检查点PD-1、CTLA-4、ICOS、VISTA和CD40L通过与肿瘤细胞上的相应配体结合，触发T细胞反应的负性或正性信号。 RNA甲基化的调控因子：参与调控免疫检查点的RNA甲基化调控因子包括METTL3、ALKBH5、FTO和METTL16等。这些调控因子通过调节m6A和m5C甲基化，影响免疫检查点的功能。小分子抑制剂的应用：针对METTL3和FTO的几种小分子抑制剂，包括STM2457、Alk-04、FB23-2和Dac51等，可以抑制m6A甲基化过程，并应用于AML的治疗。这些小分子抑制剂联合免疫检查点阻断疗法，有望提高AML患者的治疗效果。 RNA甲基化在肿瘤免疫中的作用及其在免疫治疗中的潜力正逐渐被揭示。通过靶向RNA甲基化调控蛋白，有望开发出新的免疫治疗策略，提高癌症治疗的效果。未来的研究需要进一步探索RNA甲基化在肿瘤免疫中的具体机制，并开发更多的RNA甲基化调控剂，以期在临床上取得突破。参考文献 Li Y, Jin H, Li Q, Shi L, Mao Y, Zhao L. The role of RNA methylation in tumor immunity and its potential in immunotherapy. Mol Cancer. 2024 Jun 20;23(1):130. doi: 10.1186/s12943-024-02041-8. PMID: 38902779; PMCID: PMC11188252. https://molecular-cancer-biomedcentral-com.libproxy1.nus.edu.sg/articles/10.1186/s12943-024-02041-8 责编|探索君排版|探索君转载请注明来源于【生物探索】 End 往期精选围观一文读透细胞死亡(Cell Death) | 24年Cell重磅综述（长文收藏版）热文 Cell | 是什么决定了细胞的大小？热文 Nature | 2024年值得关注的七项技术热文 Nature | 自身免疫性疾病能被治愈吗？科学家们终于看到了希望热文 CRISPR技术进化史 | 24年Cell 综述

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PocketFlow：一个数据和知识驱动的基于结构的分子生成模型

今天给大家讲一篇2024年2月在nature machine intelligence上发表的基于深度学习方法设计药物分子的文章的文章。作者提出了一个在给定蛋白质结合口袋条件下、纳入化学知识约束的分子生成框架PocketFlow，并通过消融实验表明了化学知识在生成分子的有效性和类药性方面起到的关键作用。通过设计与表观遗传调控相关的两个新的靶蛋白（HAT1和YTHDC1）抑制剂的实验表明活性化合物与靶蛋白的结合模式与分子对接预测的结果非常接近。因此，该方法的提出有助于提高药物设计的准确性，以发挥其特异性的治疗效果。分子生成模型的研究背景目前基于配体的分子生成模型（DGMs）首先利用神经网络从大量已知活性化合物中学习这些结构信息的概率分布，然后通过对学习到的分布进行采样来生成新的分子结构。此外，基于结构的方法则会将目标受体的结构信息作为特征引入模型中，这将有助于提高药物设计的准确性。特别是当某些蛋白质只有极少数或没有已知的配体分子，对于这些情况，基于结构的方法可以在蛋白质结合口袋内生成新的配体分子，这将能够克服基于配体的方法的缺点。不过现有基于结构的方法仍存在一定的问题，其一是现有的数据绝大多数由实验测定过的蛋白质-配体复合物组成，数量不足以训练生成模型。其二是目前基于结构的的方法仍然是一种数据驱动的方法，因此还存在着缺乏鲁棒性和可解释性等问题。此外，大多数分子生成模型在训练和生成过程中都没有考虑化学键信息，即输出为一组没有连通性的离散原子，然后将其组装起来形成分子，这种策略可能导致合成较困难，且类药性差。虽然所生成的分子已经在理论上得到了验证，但它们的生物活性和结合模式尚未经过湿实验的验证。设计流程2.1 PocketFlow设计流程PocketFlow是一种自回归生成流模型，可以逐步生成蛋白质口袋内的小分子。在给定的三维口袋的条件下，该方法建立了一个从正态分布到原子类型和共价键分布的可逆映射。在生成过程的每一步，模型从正态分布中采样以生成一个新的原子，同时生成相应的坐标和共价键。首先将结合位点和分子片段作为语境信息输入至模型（图1a），并利用上下文编码器模块对其进行编码以提取特征（图1b），然后利用一个焦点网络从当前环境选择一个焦点原子作为生成新原子的参考点（图1c）。在生成的每一步都将原子类型、坐标、共价键作为下一代步骤的输入，如果新生成的子结构不满足化学知识约束则重新采样（图1g)。如果满足以下任何一个条件，将停止采样。其一是没有原子可以预测为焦点原子，其二是生成的原子数量达到预定义的最大值，其三是采样步达到预定义的最大值。图1模型设计流程实验结果3.1化学结构合理性评估作者从键长、键角和环结构几个方面评估了生成分子的化学结构的合理性，并分析了九种常见的共价键。如图（2a-2i）所示，由PocketFlow生成的分子的键长分布更接近于CrossDocked2020、及三个基线生成的分子。尽管Pocket2Mol生成特定共价键类型的分子能力更好，但PocketFlow生成分子结构的合理性整体仍优于Pocket2Mol。同样，由PocketFlow生成的分子的键角分布比由三个基线生成的分子的键角分布更接近于CrossDocked2020数据集。此外，在环结构中，五元环、六元环及融合环在类药物分子中最常见，而环如三、四元、七元、更大的环则有合成可及性差、毒性高、代谢不稳定等特点，如图（2j-2o）所示，可以发现PocketFlow生成的分子生成不常见、稳定性差的环结构的分子比例较低。图2 评估生成分子的几何性质3.2 小分子构象合理性评估为了评估生成的分子的结合位点和结合亲和度/配体效率（LE），作者利用PocketFlow生成10000个分子，并随机选择了1000个分子来进行统计分析。如图3所示，其中目标蛋白及其活性口袋为白色，绿点表示分子中的重原子。可以发现由PocketFlow生成的分子主要位于蛋白质口袋内，而由GraphBP生成的分子则分散地分布在蛋白质口袋周围，大量分子位于口袋外部。由Pocket2Mol生成的分子也主要位于口袋内部，但Pocket2Mol的原子分布比其他三种模型更稀疏，特别是2ah9，这可能是由于Pocket2Mol生成的分子多样性较低，不同分子之间的原子坐标非常接近，导致空间中有许多原子重叠在一起。图3 不同生成模型生成分子的原子位置分布3.3 YTHDC1抑制剂设计YTHDC1是一种特异性识别n6-甲基腺苷（m6 A）RNA修饰的表观遗传调控蛋白。研究表明，YTHDC1的失调与许多病理状态相关，尤其是急性髓系白血病。因此，YTHDC1被视为治疗急性髓系白血病的潜在靶点，而针对YTHDC1的小分子抑制剂可能成为潜在的疾病干预药物。作者利用PocketFlow对YTH结构域蛋白1（YTHDC1）设计小分子抑制剂。首先选择PDB ID为4r3i作为晶体结构，并选择YTHDC1的底物结合位点作为活性口袋来生成1000个分子，筛选条件为分子量为250到400之间、类药性大于0.9、可合成性小于3，再对筛选后的235个分子进行分子对接，并根据预测的LE值进行排序，选择排名最高的五个化合物。图4e展示了Y3的IC50为32.6 μM，通过DSF和等温滴定量热法进一步测得Y3解离常数（KD）值为108μM，图4f显示了由PocketFlow生成的结合模式与由分子对接预测的结合模式相互叠加，表明其结合模式非常相似。图4 PocketFlow设计出的YTHDC1小分子抑制剂结论本文提出了一个基于结构的分子生成模型，PocketFlow。它利用等变图神经网络用于建模蛋白质-配体复合物的几何结构。为了捕捉蛋白质和配体之间的相互作用信息，还引入了三角自注意机制以增强模型学习合理化学结构的能力。此外，由PocketFlow生成的分子在可合成性、键长分布、键角分布和环结构等方面更接近真实的类药物分子（CrossDocked2020）。此外，与基准模型相比，PocketFlow能够生成具有更好的结合位点（在口袋内）和更高的配体效能的分子。未来可以通过引入强化学习来提升生成分子的结合亲和力，并将生成分子的药代动力学性质和毒性纳入优化指标。参考文献Moret, M. et al. Leveraging molecular structure and bioactivity with chemical language models for de novo drug design. Nat. Commun. 14, 114 (2023).版权信息本文系AIDD Pro接受的外部投稿，文中所述观点仅代表作者本人观点，不代表AIDD Pro平台，如您发现发布内容有任何版权侵扰或者其他信息错误解读，请及时联系AIDD Pro (请添加微信号sixiali_fox59)进行删改处理。本文为原创内容，未经授权禁止转载，授权后转载亦需注明出处。有问题可发邮件至sixiali@stonewise.cn关注我，更多资讯早知道↓↓↓

2024-02-27

·今日头条

魏来/张峰/魏泓Cell新发现：肠菌"不请自来"，推动遗传性致盲眼病

02月27日的《热心肠日报》，我们解读了 15 篇文献，关注：细菌移位，肠眼轴，高尿酸血症，鼻咽癌，心衰，肠癌，IBD，药物研发，临床试验，先生再明，Celltrion，博济医药，诺泰奥萨诺，富国基金，百菲乳业。该篇日报由R·AI辅助创作生成，人工审核校对。魏来/张峰/魏泓等Cell：Crb1突变相关致盲疾病，或与肠菌移位有关 Cell——[64.5] ① CRB1基因突变与可致盲的视网膜退化疾病有关，中山大学中山眼科中心魏来、张峰和中山大学附属第一医院魏泓与团队发表研究，发现Crb1突变相关视网膜退化与肠菌移位有关；② 小鼠中，Crb1在视网膜色素上皮和结肠上皮细胞的顶侧连接复合物中均有丰富表达；③ Crb1 Rd8突变小鼠中，视网膜和肠道的上皮屏障受损，伴随着病变视网膜中多种病灶内细菌的存在；④ Rd8小鼠眼部和结肠屏障功能缺陷导致肠菌移位到视网膜，导致继发性视网膜病变，无菌条件、广谱抗生素处理或在肠道中重新引入功能性Crb1表达，都能在不逆转视网膜屏障缺陷的情况下挽救Rd8突变相关的视网膜退化；⑤ 这些发现为Crb1相关视网膜退化提供了新的病理机制，表明抗微生物药物或是潜在治疗手段。【原文信息】 CRB1-associated retinal degeneration is dependent on bacterial translocation from the gut 2024-02-26 , doi: 10.1016/j.cell.2024.01.040 国内团队Cell子刊：肠菌缓解高尿酸血症的新机制 Cell Host and Microbe——[30.3] ① 中山大学柳雁团队揭示了肠道菌群与高尿酸血症进展相关的机制；② 高尿酸血症患者中另枝菌属Alistipes indistinctus（Ai）的丰度和中心性降低；③ 机制上，Ai来源的马尿酸通过增强过氧化物酶体增殖物激活受体γ（PPARγ）与ATP结合盒亚家族G成员2（ABCG2）启动子的结合，从而促进肠道尿酸排泄；④ 同时，马尿酸还通过PDZK1依赖的方式促进ABCG2定位到毛刷状边缘膜，从而加速肠道尿酸排泄；⑤ 本研究表明肠道微生物Ai及其产生的马尿酸通过PPARγ-ABCG2轴促进尿酸排泄，有助于缓解高尿酸血症。【原文信息】 Alistipes indistinctus-derived hippuric acid promotes intestinal urate excretion to alleviate hyperuricemia 2024-02-26 , doi: 10.1016/j.chom.2024.02.001 中山大学Nature子刊：口腔微生物移位或促进鼻咽癌？ Nature Communications——[16.6] ① 中山大学肿瘤防治中心贾卫华团队发表研究，在鼻咽癌和对照组中收集配对的鼻咽-口腔样本，识别到13种微生物从口腔异常转移到鼻咽部，并在鼻咽癌患者中富集；② 其中，具核梭杆菌和中间普雷沃菌通过培养组学和克隆菌株鉴定得到验证；③ 鼻咽生物检验宏转录组证实这些微生物存在于肿瘤内，会影响局部微环境和细胞因子反应；④ 这些微生物还与鼻咽内的Epstein-Barr病毒负荷显著相关，呈现出增加的剂量-反应关系；⑤ 本研究确定了口腔微生物会迁移到鼻咽处，进而渗透到肿瘤中，影响微环境并与EB病毒感染相关。【原文信息】 Microbes translocation from oral cavity to nasopharyngeal carcinoma in patients 2024-02-22 , doi: 10.1038/s41467-024-45518-2 心力衰竭引发肠道菌群失调促进小鼠结肠肿瘤形成 Cardiovascular Research——[10.8] ① 本研究揭示了心力衰竭（HF）引起的肠道菌群失调对小鼠结肠肿瘤形成的影响，为HF与癌症风险增加之间的联系提供了机制性解释；② 心肌梗死（MI）诱导的HF导致小鼠微生物生态失调，其特征是α-多样性降低和属水平上的微生物改变，其中一些与CRC有关；③ 将MI处理的小鼠粪菌移植给氧化偶氮甲烷／葡聚糖硫酸钠诱导的结肠癌小鼠，小鼠的内窥镜疾病评分更高，肿瘤数量增加；④ 移植MI小鼠粪便后，结肠癌小鼠的细胞因子相关机制增强，DNA代谢过程和凋亡机制降低；⑤ 综上，MI诱导的HF可能通过改变小鼠肠道微生物组成来促进结肠肿瘤的发展，可能解释了为什么心衰患者有更高的癌症发病率。【原文信息】 Heart failure-induced microbial dysbiosis contributes to colonic tumour formation in mice 2024-02-24 , doi: 10.1093/cvr/cvae038 IBD的组织学炎症及临床活动期与女性生育力降低相关 Gastroenterology——[29.4] ① 在一项瑞典队列研究中发现，女性IBD患者的组织学炎症及临床活动期与生育力下降相关；② 在21,046名女性IBD患者中，有或无组织学炎症的时期，每100人-年的活产数分别为6.35和7.09，对应10年组织学炎症期间每14名女性IBD患者中少1名后代；③ 无论是溃疡性结肠炎还是克罗恩病，组织学炎症均降低了女性的生育率；④ 在24,995名女性IBD患者中，临床活动期与生育力下降相关，对应10年临床活动期间每6名女性中少1名后代；⑤ 即便在临床缓解期的女性IBD患者中，组织学炎症也与生育力下降相关。【原文信息】 Histological remission in inflammatory bowel disease and female fertility: A nationwide study 2024-02-06 , doi: 10.1053/j.gastro.2024.01.018 国内团队：成功开发新型释放H2S的纳米制剂或可治疗IBD Advanced Science——[15.1] ① 温州医科大学蔡晓军、沈新坤团队联合安徽医科大学王咸文团队通过静电吸附二烯基三硫醚载荷的肽树状聚合物纳米凝胶（DPs）到蒙脱石（MMT）表面而制成一种新型的H2S释放蒙脱石纳米制剂（DPs@MMT）；② 该制剂通过特异性结合受损黏膜，促进其在IBD部位激活的免疫细胞中积累内化，进而释放H2S，发挥多重治疗效果；③ 该制剂通过消除ROS、抑制炎症、修复黏膜屏障和清除病原体，从而缓解结肠炎，；④ 该制剂通过激活Nrf2/HO-1、PI3K-AKT等通路，抑制p38/ERK MAPK、p65 NF-κB等通路，实现免疫调节和黏膜屏障修复；⑤ 该制剂通过消除病原体、增加益生菌，重塑肠道菌群；⑥ 该研究为IBD治疗提供了新思路。【原文信息】 H2 S-Releasing Versatile Montmorillonite Nanoformulation Trilogically Renovates the Gut Microenvironment for Inflammatory Bowel Disease Modulation 2024-02-02 , doi: 10.1002/advs.202308092 国内团队：发现新型药物COL或可治疗IBD Autophagy——[13.3] ① 澳门大学路嘉宏团队联合香港中文大学叶德全团队发现了一种新化合物鸽胺（COL），通过激活LC3相关吞噬作用（LAP）并增强胞吞作用，从而减轻结肠炎；② COL通过直接结合并偏向性激活甲酰肽受体2（FPR2），促进胞吞作用并缓解结肠炎；③ COL诱导RAC1与PIK3C3/VPS34-RUBCN/RUBICON复合体的相互作用，刺激LC3相关的胞吞作用；④ 本研究为理解LAP在调节炎症性肠病（IBD）中的潜在作用提供了新的解释，揭示了G蛋白偶联受体（GPCRs）与LAP之间的关系，并突出了RAC1在调节PIK3C3/VPS34-RUBCN复合体中LAP的作用。【原文信息】 Enhancement of LC3-associated efferocytosis for the alleviation of intestinal inflammation 2024-02-04 , doi: 10.1080/15548627.2024.2311548 靶向m6A甲基化lncRNA或可治疗肠炎 Advanced Science——[15.1] ① 本研究发现与肠道炎症相关的lncRNA LOC339803调节肠炎反应中的作用；② 等位基因特异性m6 A甲基化影响YTHDC1介导的蛋白结合亲和力；③ LOC339803与YTHDC1的相互作用决定LOC339803的染色质定位，诱导NF-κB介导的促炎细胞因子的表达，从而促进肠炎发展；④ 人类肠道活检样本证实以上发现；⑤ 靶向LOC339803在体外和体内均可缓解肠炎；⑥ 本研究突出甲基化LOC339803 lncRNA介导肠炎的重要性，并将该lncRNA作为治疗炎症性肠道疾病的潜在新治疗靶点。【原文信息】 m6 A Methylated Long Noncoding RNA LOC339803 Regulates Intestinal Inflammatory Response 2024-01-25 , doi: 10.1002/advs.202307928 Lancet子刊：低剂量环磷酰胺清髓的干细胞移植治疗克罗恩病的副作用太大 Lancet Gastroenterology & Hepatology——[35.7] ① 本研究探讨了采用减弱强度的免疫消除方案（低剂量环磷酰胺）进行自体造血干细胞移植（HSCT）对难治性克罗恩病（CD）患者的安全性和有效性，发现尽管该方法能减少内镜下疾病活动，但由于严重的不良事件，认为该方案不适合未来临床使用；② 23名CD患者随机分配：13名（57%）分配到干预组，10名（77%）参与者接受HSCT，9名（69%）达到了48周的随访，10名（43%）分配到对照组，9名（90%）达到了48周的随访；③ 干预组中6名（46%）患者报告9起疑似意外严重不良反应，包括3名参与者因已证实的血栓性微血管病而导致肾衰竭，以及1例因肺静脉闭塞性疾病而死亡，试验被中止；④ 48周时，干预组7名参与者中有3名（43%）报告没有进行手术或死亡的内镜溃疡消失，而对照组中6名参与者中无此报告；⑤ 干预组中的严重不良事件更为频繁，干预组中的第二名患者在48周后因呼吸和肾功能衰竭而死亡。【原文信息】 Safety and efficacy of autologous haematopoietic stem-cell transplantation with low-dose cyclophosphamide mobilisation and reduced intensity conditioning versus standard of care in refractory Crohn's disease (ASTIClite): an open-label, multicentre, randomised controlled trial 2024-02-07 , doi: 10.1016/S2468-1253(23)00460-0 乌司奴单抗治疗IBD的长期安全性 Journal of Crohn's and Colitis——[8] ① 汇总5年的克罗恩病患者和4年的溃疡性结肠炎患者的数据，证实了乌司奴单抗在IBD治疗中的长期安全性；② 在4826患者-年的随访中，2575名患者接受了乌司奴单抗治疗；③ 关键安全事件（包括重大不良心血管事件、恶性肿瘤）的发生率在乌司奴单抗组与安慰剂组之间相似；④ 机会性感染（包括结核）和恶性肿瘤的报告较少，在未接受生物制剂治疗及生物制剂治疗失败的IBD患者中，乌司奴单抗组的关键安全事件发生率均不高于安慰剂组；⑤ 未报告任何淋巴瘤或可逆性后部脑病综合征（PRES）的病例；⑥ 这些数据进一步支持了乌司奴单抗在获批适应症中的良好安全性。【原文信息】 Safety of Ustekinumab in Inflammatory Bowel Disease: Pooled Safety Analysis Through 5 Years in Crohn's Disease and 4 Years in Ulcerative Colitis 2024-02-04 , doi: 10.1093/ecco-jcc/jjae013 抗肿瘤创新药公司「先声再明」获9.7亿元融资 ① 2月24日，先声药业集团旗下抗肿瘤创新药公司先声再明宣布完成9.7亿元融资，投后估值达84.7亿元；② 本轮融资由国投招商（先进制造）领投，中深新创投资、杏泽资本以及中和资本跟投；③ 根据双方签订的增资协议，投资者将获得先声再明合共约11.45%的经扩大已发行股本；④ 先声再明研发策略聚焦肺癌、胃肠道肿瘤、妇科肿瘤等核心领域，研发管线包括蛋白工程、T cell engager、NK cell engager、AI辅助分子设计等；⑤ 近五年，先声药业研发投入超过50亿元，创新药收入占比从2019年的33%提升至2023年上半年的71%。【原文信息】先声再明融资9.7亿元，投后估值84.7亿元 2024-02-26 , 医药笔记 Celltrion公布CT-P13治疗IBD两年期新数据 ① 2月23日，韩国Celltrion公司公布管线药物CT-P13治疗炎症性肠病（IBD）的两年期积极研究结果；② CT-P13是世界上首个皮下注射形式的英夫利昔单抗仿制药，研究证实了其治疗中重度活动性克罗恩病（CD）和溃疡性结肠炎（UC）的疗效和安全性；③ 在LIBERTY-CD研究中，85.6%的患者完成了第102周的扩展治疗，临床缓解、内镜缓解等指标在第102周得以维持；④ 在LIBERTY-UC研究中，87%的患者在完成扩展治疗，临床缓解、内镜-组织学黏膜改善等疗效得到维持。【原文信息】 Celltrion presents new two-year data for subcutaneous infliximab (CT-P13 SC) in inflammatory bowel disease (IBD) at the 19th ECCO Congress 2024-02-23 , BioSpace 「博济医药」与「诺泰澳赛诺」达成临床研究服务合作 ① 2月19日，博济医药与江苏诺泰澳赛诺生物制药签订了总额达人民币1.08亿元的《技术服务（委托）合同》；② 合同约定，博济医药将为诺泰生物提供“司美格鲁肽注射液”临床研究服务，研究司美格鲁肽治疗2型糖尿病、肥胖患者的临床疗效和安全性；③ 司美格鲁肽是全球第七个获批的GLP-1受体激动剂，被认为是历史上最好的减肥、降糖药物之一；④ 通过此次合作，博济医药将进一步增强其在内分泌及代谢性疾病领域的研发能力。【原文信息】签订过亿合同！博济医药为司美格鲁肽提供临床研究服务 2024-02-26 , GLP减重宝典富国基金530万欧元资助研究金葡菌感染 ① 近日，来自布里斯托大学和APC微生物组研究所等的科研人员获得富国基金530万欧元（约合人民币4141万元）的资助，用于研究金黄色葡萄球菌引起的血液感染；② 金黄色葡萄球菌是引起的严重血液感染的首要因素之一，尤其是耐甲氧西林金黄色葡萄球菌；③ 资助项目旨在探究金黄色葡萄球菌与宿主相互作用的详细机制，阐明金黄色葡萄球菌对人体组织和免疫系统如何造成损伤；④ 资助项目有助于开发区分患者风险等级的生物标志物和新的治疗方法。【原文信息】 University Of Bristol Receives €5.3 Million Grant To Combat Fatal Bloodstream Infections 2024-02-24 , india education diary 百菲乳业冲刺新三板 ① 近日，广西百菲乳业股份有限公司申请在全国中小企业股份转让系统挂牌并公开转让；② 百菲乳业主营乳制品，以水牛奶和荷斯坦牛奶为主要原料，2021年至2023年前8月净利润分别为1.31亿元、1.15亿元和1.51亿元；③ 百菲乳业通过提升核心产品灭菌乳、调制乳的毛利率和降低生鲜乳采购价格，实现了净利润的稳定增长；④ 新三板挂牌前，百菲乳业业绩表现平平，后借助水牛奶的市场热度和电商平台推广，其实现业绩飞跃，产品销售区域从广西拓展到全国。【原文信息】 “水牛奶第二股”要来了？净利润破亿，百菲乳业冲刺新三板 2024-02-26 , FoodTalks 感谢本期日报的审核者：mildbreeze，圆圈儿，九卿臣，RZN，aluba，章台柳，lxx，Richard 点击阅读过去10天的日报： 0226 | 用AI指导大肠癌治疗，大型临床研究再添新证 0225 | 65分综述详解：超加工食品和食品添加剂如何影响肠道健康？ 0224 | 陈思凡等Cell子刊新发现：促血栓的新型肠菌代谢物 0223 | 膳食纤维怎样影响代谢健康？18页综述一文讲透 0222 | 65分综述详解跨越菌群-肠-脑轴的"通讯之门" 0221 | Cell子刊新发现：肠菌藏身"安全屋"躲避抗生素 0220 | 秦环龙/许谦/李宁Cell子刊：深入探究菌群移植中的供-受体微生物对话 0219 | 如何用菌对抗大肠癌？《自然·综述》发出最新观点 0218 | Cell重磅：某些无糖食品为何让人肠胃不适？菌群给出答案 0209 | 《自然·综述》详解：自身免疫病中，肠道为何关键？

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