UBR5

本文为转化医学网原创，转载请注明出处 作者：Sophia 导读： 由于缺乏有效的治疗靶点，三阴性乳腺癌 （TNBC） 是最致命的乳腺癌亚型。 2024年4月3日，复旦大学李大强，邵志敏及 Fang-lin Zhang共同通讯在《Science Advances》上发表题为“SF3A2 promotes progression and cisplatin resistance in triple-negative breast cancer via alteRNAtive splicing of MKRN1”的研究论文， 研究揭示了SF3A2在TNBC进展和顺铂耐药中以前未知的作用，突出了SF3A2作为TNBC患者的潜在治疗靶点。 https://www-science-org.libproxy1.nus.edu.sg/doi/10.1126/sciadv.adj4009 研究背景 01 乳腺癌（BC）是一种高度异质性的疾病，临床上根据雌激素受体（ER）、孕激素受体（PR）和人表皮生长因子受体2（HER2）的表达状态进行分类，以指导治疗决策，从而大大改善BC患者的预后。然而，大约 15% 至 20% 的 BC（称为三阴性乳腺癌 （TNBC））缺乏这些受体的表达，因此不能从内分泌和抗 HER2 治疗中获益，这进一步解释了与其他 BC 亚型相比， TNBC 的侵袭性更强、复发风险更高、预后更差。化疗仍然是TNBC患者全身治疗的主要手段。顺铂是一种DNA损伤剂，是目前最有效的化疗药物之一，广泛用于单独使用或与其他药物联合用于治疗TNBC。然而，相当一部分患者出现化疗耐药性，最终导致治疗失败，这是药物治疗的主要障碍。因此， 确定针对TNBC进展和化疗耐药性的新治疗靶点是当务之急。 研究进展 02 为了确定促进TNBC进展的潜在靶标，我们使用复旦大学上海肿瘤中心（FUSCC）-TNBC定量蛋白质组和RNA测序（RNA-seq）数据集分析了136个剪接因子的表达水平。根据log2FC（倍数变化）>1的筛选标准，与相邻正常组织相比，TNBC标本中有84个剪接因子在蛋白质水平失调，而64个剪接因子在mRNA水平失调（图1A）。其中，48个剪接因子在蛋白质和mRNA水平上均失调（图1，B和C，前30名）。 我们选择SF3A2进行进一步研究，因为它在我们的筛选列表中排名靠前，而且在TNBC中的作用不明确。 SF3A2 在 TNBC 肿瘤中经常过表达，其高表达表明 TNBC 患者预后不良。 在 FUSCC-TNBC 队列中， 与正常乳腺组织相比，TNBC 组织中 SF3A2 的表达水平明显升高（图 1、D 和 E）。 为了进一步验证这些结果，我们随后通过免疫印迹测定法检测了 20 对 TNBC 和正常组织中 SF3A2 的蛋白质水平。正如预期的那样，SF3A2在TNBC组织中的表达水平明显高于正常组织（图1，F和G）。此外，我们还分析了公开的CPTAC（临床蛋白质组学肿瘤分析联盟）和TCGA（癌症基因组图谱）数据集中SF3A2的表达水平。 与 FUSCC-TNBC 队列的结果一致，与正常组织相比，SF3A2 在 BC 组织中明显过表达，在 TNBC 中的表达水平高于其他 BC 亚型。 此外，Kaplan-Meier 分析表明，SF3A2 水平较高的患者在乳腺癌中的总生存期和无远处转移生存期较短。然而，值得注意的是，与所有乳腺癌患者相比，SF3A2 上调预测了 TNBC 患者的疾病预后更差（图 1H）。总的来说， 这些结果表明 SF3A2 在 TNBC 样本中异常上调，其较高的表达预示着 TNBC 患者的预后较差。 研究结果 03 在这项研究中，我们将 SF3A2 确定为 TNBC 中的一种癌蛋白，可作为 TNBC 患者的潜在治疗靶点。 从机制上讲，UBR5 调节 SF3A2 的泛素化和降解。反过来，SF3A2正向调节UBR5的蛋白水平，从而形成调节这两种癌蛋白在TNBC中的表达水平的反馈回路。SF3A2 至少部分通过促进 MKRN1 剪接开关来促进 TNBC 进展。此外，SF3A2 耗竭通过 MKRN1-FADD 通路诱导外源性细胞凋亡，并通过 DNA 损伤触发内源性细胞凋亡，从而增强细胞对顺铂治疗的敏感性（图 7L）。 总之，本研究描述了 SF3A2 在 TNBC 进展和顺铂耐药中以前未被识别的作用，表明SF3A2可能是TNBC的潜在治疗靶点。 参考资料： https://www-cell-com.libproxy1.nus.edu.sg/cancer-cell/abstract/S1535-6108(24)00090-4#%20 注：本文旨在介绍医学研究进展，不能作为治疗方案参考。如需获得健康指导，请至正规医院就诊。 热门·直播/活动 🕓 上海｜06月14日-16日 ▶ 第六届上海国际癌症大会将于6月14-16日在上海举办，学科交叉，共同推进肿瘤研究与诊治多模态！ 🕓 北京｜09月20日-21日 ▶ 第五届单细胞技术应用研讨会暨空间组学前沿研讨会欢迎您的参与！ 点击对应文字 查看详情

关键词EED抑制剂；研究进展；APG-5918；HJM-353多梳家族蛋白（PcG）是一类在进化上高度保守的与生长发育相关的转录抑制因子，最早在果蝇中发现，其作用机制主要是通过修饰组蛋白或改变染色质结构进而引起同源异型基因或发育调控基因的表达沉默。PcG有多个家族成员，其中发挥转录抑制功能的主要有 PRC1和PRC2，两者由不同的催化和调节亚基组成。其中PRC1蛋白复合物具有E3泛素连接酶活性，底物通常为单泛素化的组蛋白H2AK119。PRC2蛋白复合物具有甲基转移酶活性，可以催化组蛋白H3K27的二甲基化和三甲基化修饰反应。PRC1和PRC2的构成和主要亚基示意图作为PcG家族的代表性成员，PRC2是一种通过沉默特定基因表达维持核染色质抑制状态的多亚基复合物，是重要的表观修饰酶，核心亚基包括组蛋白甲基转移酶2(EZH2) 、胚胎外胚层发育蛋白(EED）、zeste抑制子(SUZ12)和视网膜母细胞瘤抑制因子相关蛋白（RbAp46/48），可对组蛋白H3的27位赖氨酸K27进行甲基化修饰，具有转录抑制的作用。研究发现，PRC2的失调与血液系统及实体恶性肿瘤有关，并与癌症的不良预后相关。2022年2月，生命学院戚炜课题组在国际学术期刊Cell Death and Disease上在线发表论文“Induction of senescence-associated secretory phenotype underlies the therapeutic efficacy of PRC2 inhibition in cancer”，该研究揭示了PRC2抑制剂抑制肿瘤生长的分子机理。PRC2抑制剂治疗肿瘤的机理模型图其中，EZH2在多种人类癌症中呈现高表达或者功能获得性突变，且与肿瘤预后存在相关性。EZH2靶点已成为近年表观遗传抗肿瘤领域研究的热门靶点，全球首个EZH2抑制剂Tazemetostat已于2020年被FDA批准用于治疗晚期上皮样肉瘤和滤泡性淋巴瘤。不过，EZH2二次突变引起的获得性耐药问题限制了EZH2抑制剂在临床中的应用。晶体结构研究发现，EED与组蛋白H3第27位赖氨酸（H3K27me3）的结合导致EZH2上刺激响应基序(SRM) 的构象变化，从而提高了其催化效率。这给药物化学工作者启发，可能通过开发靶向EED的小分子化合物调节PRC2 的活性。而且，EED抑制剂有可能通过克服对EZH2抑制剂的耐药，以及同时抑制EZH2和EZH1产生更强的抗肿瘤效果。EDD抑制剂研究进展目前，全球药企已研发出多款EED抑制剂，详见下表。整体来看，在研EED抑制剂大多处于早期临床，多被开发用于治疗血液肿瘤和实体瘤。此外，EED抑制剂还有望通过增加胎儿血红蛋白（HbF）的表达，对多种血红蛋白相关的贫血疾病产生治疗作用。全球部分在研EED抑制剂HJM-353HJM-353是和径医药与上海科技大学合作开发的具有口服活性、新型强效、高选择性EED抑制剂，通过阻断三甲基化的H3K27me3与EED的结合，破坏H3K27me3-EED-EZH2的相互作用，从而实现对PRC2整体活性的抑制。HJM-353具有良好的药代动力学性质，在多种属动物中具有很好的生物利用度，且安全窗口较大。临床前研究表明：HJM-353在多种肿瘤细胞和动物模型中具有很好的抗肿瘤活性，并且对他泽司他（全球首创的EZH2抑制剂）的耐药株同样有效。2022年12月，HJM-353先后在美国和国内获批1期临床，用于治疗晚期血液肿瘤和实体瘤。APG-5918APG-5918是亚盛医药开发的具有口服活性、新型强效、高选择性EED蛋白小分子抑制剂，具有高度结合亲和力。作为一种变构抑制剂，APG-5918能选择性结合EED蛋白，通过调节肿瘤表观遗传学及肿瘤微环境，有望克服肿瘤耐药，实现完全和持久的肿瘤消退。2021年该药相关研究结果荣登荣登药化顶级期刊JMC。2022年6月和11月，APG-5918先后在美国和国内获批临床，用于治疗晚期实体瘤或血液系统恶性肿瘤。FTX-6058FTX-6058是一种口服小分子EED抑制剂，被开发用于治疗镰状细胞病（SCD）和其他血红蛋白病，曾被FDA授予治疗SCD的快速通道认证和孤儿药认证。在SCD患者中开展的1b期多中心开放标签试验的初步数据显示：FTX-6058实现了HbF绝对水平的增加，这与潜在的总体患者获益相关。而且，FTX-6058在SCD患者中普遍耐受性良好，接触时间长达三个月，未报告与药物相关的严重不良事件。遗憾的是，FDA于2023年2月口头通知公司，就FTX-6058用于潜在治疗SCD的试验性新药(IND)申请收到临床试验暂停通知。ZJH-16ZJH-16是一种新型的EED靶向先导化合物，以极高亲和力直接结合到EED的H3K27me3结合口袋，并有效抑制了KARPAS422和Pfeiffer细胞的增殖。在这两个EZH2功能获得性突变的淋巴瘤细胞中，ZJH-16选择性地与EED结合并降低H3K27三甲基化水平。同时，ZJH-16显著抑制了KARPAS422细胞中PRC2的基因沉默功能。而且，ZJH-16具有良好的药代动力学（PK）特征，具有出色的口服生物利用度。更重要的是，ZJH-16口服后在KARPAS422异种移植模型中显示出完全的肿瘤消退，肿瘤生长抑制率接近100%。EED抑制剂的开发并不顺利，除了FTX-6058临床试验暂停，据悉诺华的MAK683也已从其研发管线中砍除。MAK683是EDD抑制剂领域进展进展最快的一款药物，此前已进入2期临床。总结与EZH2靶点相比，EED靶点进展较慢，且在研药物少。除有潜力治疗肿瘤，EED抑制剂还有望通过增加胎儿血红蛋白（HbF）的表达，治疗多种血红蛋白相关的贫血疾病。我国药企也积极布局EED靶点，虽然相关药物目前进展还算顺利，但是也不能太过乐观，毕竟新药研发失败风险相当高。END👇关注药渡数据媒体矩阵

这项研究发现了IFN感应性的丧失在多个动物模型中使得肿瘤对ICB更加敏感。这可以通过两种机制介导，第一是经典MHC-I类分子的上调能够抑制NK细胞，第二是非经典MHC-I类分子Qa-1b的上调可以通过 免疫检查点阻断（ICB）疗法在多种肿瘤中都取得了巨大成功。然而，仍有许多患者对ICB没有响应，不同肿瘤中的免疫逃逸机制也需要进一步探索。 近日，由布罗德研究所（Broad Institute）的Robert T. Manguso和Kathleen B. Yates带领的研究团队，在著名期刊Nature Immunology发表重要研究成果[1]。 为了发现肿瘤逃避免疫治疗的机制，他们在接受ICB治疗的癌症模型中，开展了基因组层面的CRISPR筛选。 他们的发现让他们大吃一惊：在多种肿瘤模型中，肿瘤细胞对干扰素（IFN）感应性的丧失，竟然使得肿瘤对ICB的响应更加敏感。 具体来说，肿瘤的IFN信号通过两种方式发挥免疫抑制的作用：第一，肿瘤IFN感应能够上调经典的第一类主要组织相容性复合体（MHC-I）抑制自然杀伤（NK）细胞；第二，肿瘤IFN感应通过上调非经典的MHC-I类分子Qa-1b抑制CD8+T细胞。 要知道，大量的研究表明IFN-γ在肿瘤的免疫监视中发挥重要作用[2-4]。这一发现可以说颠覆了我们对IFN-γ信号的认知。 论文首页截图 接下来我们就一起来看看这个研究是如何开展的。 研究团队利用代表了5种癌症类型（黑色素瘤、胰腺癌、肺癌、肾癌和结肠癌）的8个小鼠肿瘤模型，进行CRISPR体内筛选，找出ICB治疗后富集或清除的sgRNA，以鉴定与ICB抵抗性或敏感性相关的基因（指该基因缺失时分别与ICB抵抗性或敏感性相关）。 他们发现Nlrc5、Pten、Casp8、Ccar1、Ubr5、Dot1lh、Smg9和Pdcd10的缺失与ICB抵抗性相关，并对Ccar1缺失这一新发现的ICB抵抗机制进行体内实验验证。 在ICB敏感性方面，除了已报道的Ptpn2、Traf2、Ripk1、Serpinb9、Cd47、Atg7外，研究团队还发现了Calr、Rnf31、Vps45、Ilf2、Pnpo、Kcmf1、Fitm2、Morc2a和Thop1的缺失与ICB敏感性相关，并进一步对Calr、Med16和Rnf31缺失介导的ICB敏感机制进行体内实验验证。 CRISPR筛选发现的与ICB抵抗性或敏感性相关的基因 研究团队进一步对清除的sgRNA进行了通路富集分析，令人意外的是，MHC-I类抗原呈递信号通路相关的基因在除Lewis肺癌细胞（LLC）外的所有模型中都被清除，细胞因子响应、II型IFN和先天免疫相关的基因也在多个模型中被清除。这提示这些基因的缺失可以使得肿瘤细胞对ICB更加敏感。 我们都知道，IFN-γ可以上调MHC-I类分子的表达，从而促进细胞毒性CD8+T细胞（CTL）识别肿瘤细胞[4]。还有很多研究表明，IFN感应性的丧失与ICB的抗性相关[2,3,5,6]。在类似的小鼠肿瘤模型中进行体外CRISPR筛选，发现肿瘤细胞IFN和抗原呈递通路的丧失会引起肿瘤细胞对CTL杀伤的抵抗[7]。而本研究发现抗原呈递和IFN通路相关基因的清除竟然与ICB的敏感性相关，这似乎与上述研究结果相矛盾。 为了搞清楚矛盾背后的原因，Manguso团队进一步对比了他们的体内CRISPR筛选结果和前人的体外CRISPR筛选结果，结果发现了一些与IFN（如Jak1、Ifngr1、Ifngr2）和抗原呈递（如Tap1、Tap2、B2m）相关的基因，在体外和体内CRISPR模型中分别发生了富集和清除。 这一发现提示，在体外研究中，这些基因的缺失可能促进了肿瘤细胞对T细胞杀伤的抵抗；而在体内研究中，这些基因的缺失让肿瘤细胞对T细胞更敏感。 体外模型与体内模型中CRISPR筛选得到的sgRNA对比 为了进一步探究IFN诱导肿瘤细胞对ICB抵抗的机制，Manguso团队对比了ICB治疗后的清除的sgRNA与IFN-γ刺激后改变的IFN刺激基因（ISG）。结果显示，抗原呈递相关基因（H2-T23、B2m、Tap1、Tap2、Tapbp和Erap1）在ISG中富集，这些基因同样在ICB治疗后清除的sgRNA中富集，这提示这些基因能够被IFN-γ刺激诱导上调，并与ICB治疗的抵抗性相关。 体外实验也说明，在IFN-γ或IFN-β刺激后，经典MHC-I类分子H-2K、H-2D，非经典MHC-I类分子Qa-1b以及PD-L1的表达会发生上调。这些结果提示IFN诱导的ICB抵抗机制可能是由MHC-I类分子的上调所介导的。 IFN-γ刺激能够诱导多种发挥ICB抵抗性的基因上调 为了验证这一假设，研究团队设计了一种体内竞争性实验，以检测IFN-γ感应基因和MHC-I类抗原呈递途径相关基因的遗传上位性。 他们将对照sgRNA和靶向Ifngr1或Jak1（IFN-γ感应基因）的sgRNA转染的KPC细胞（这些细胞分别是对照sgRNA背景、Tap1敲除背景和B2m敲除背景，Tap1和B2m为MHC-I类抗原呈递途径相关基因）1：1混合，然后将这些细胞分别在NSG鼠，WT鼠和接受ICB治疗的WT鼠体内成瘤，对比不同组中转染对应sgRNA的细胞的富集与清除。 结果显示，在对照sgRNA背景的细胞中，Ifngr1或Jak1敲除的细胞被清除；而在Tap1和B2m敲除背景的细胞中，Ifngr1或Jak1敲除的细胞没有发生显著清除。这提示相比于对照细胞，IFN感应性缺陷的细胞具有依赖于MHC-I类的竞争劣势，即IFN感应性通路发挥功能依赖于MHC-I类分子的表达。 IFN-γ感应基因发挥功能依赖于MHC-I类抗原呈递途径相关基因 在人类基因组中，6p21.3基因座编码MHC-I类分子表达相关的基因，如TAP1、TAP2、TAPBP、PSMB8和PSMB9等[8-10]。TCGA中多种癌种都有超过10%的肿瘤发生了6p21.3缺失，然而6p21.3缺失与绝大多数肿瘤患者的生存无关。 在接受抗PD-1治疗的肾透明细胞癌患者队列中，当肿瘤为6p21.3两倍性时，高ISG特征与患者更差的生存相关。然而在6p21.3缺失的肿瘤中，高ISG特征不再与患者更差的生存相关。这提示肾透明细胞癌中，IFN介导的ICB抵抗作用依赖MHC-I类分子。 肾透明细胞癌中高ISG特征仅在6p21.3两倍性肿瘤中与患者差的预后相关 研究团队为进一步鉴定体内杀伤IFN感应性缺陷肿瘤的免疫细胞，分别在ICB治疗时使用抗体清除CD8+T细胞、NK细胞和CD4+T细胞，结果显示NK细胞和CD4+T细胞的清除影响了对Jak1缺陷肿瘤细胞的杀伤，而清除CD8+T细胞对Jak1缺陷肿瘤细胞的杀伤没有影响。由于NK细胞不表达PD-1，而CD4+T细胞表达PD-1，研究团队推测ICB治疗后，CD4+T细胞辅助NK细胞发挥肿瘤细胞杀伤作用。 为进一步在体外验证NK细胞对IFN感应性缺陷肿瘤的杀伤能力，他们将Jak1缺陷和对照肿瘤细胞，分别与IL-12/18激活的NK细胞共培养，结果显示活化的NK细胞能够杀伤Jak1缺陷肿瘤细胞，而肿瘤细胞中Tap1或H2-K1的缺失可以逆转这一效应。这提示肿瘤IFN感应性可以通过上调经典的MHC-I类分子，在体内和体外抑制NK细胞的毒性。 Manguso团队进一步探究了哪些MHC-I类抗原呈递途径的基因发挥功能依赖于NK细胞，他们对比了NK细胞清除与不清除时，ICB治疗清除的sgRNA。结果显示，尽管Ifngr1、Ifngr2、Stat1、Jak1、Jak2和H2-K1的清除表现出NK细胞依赖性，靶向Tap1、Tap2、H2-D1和H2-T23这几个抗原呈递基因的sgRNA在NK细胞存在与不存在时都会发生清除。这说明部分MHC-I类抗原呈递分子的缺失，所引起的肿瘤细胞杀伤是非NK细胞依赖性的。 在上述基因中，H2-T23引起了Manguso团队的关注。因为H2-T23编码非经典MHC-I类分子Qa-1b（相当于人类中的人类白细胞抗原HLA-E），而Qa-1b能够结合抑制性受体NKG2A/CD94。这些结果提示尽管NK细胞介导了对IFN感应性丧失的细胞的杀伤，但是某些MHC-I类分子（如Qa-1b）的表达可能会抑制其他的效应性细胞群。 某些MHC-I类分子（如Qa-1b）的表达可能会抑制除NK细胞外的效应性细胞 为了探究Qa-1b表达抑制了哪些效应性细胞群，研究团队首先检测了Qa-1b的缺失是否会增强ICB响应。结果显示，Qa-1b的缺失会增强ICB响应，而Qa-1b的过表达能抑制ICB响应。 当在接受ICB治疗的小鼠胰腺导管腺癌（KPC）肿瘤模型中敲除HT-T23后，分别清除NK细胞和CD8+T细胞，结果显示NK细胞清除对于Qa-1b缺陷型肿瘤的ICB响应没有影响，而CD8+T细胞清除抑制了Qa-1b缺陷型肿瘤的ICB响应。这提示Qa-1b主要通过抑制CD8+T细胞发挥作用。 单细胞测序数据也提示，ICB治疗后引起效应、耗竭和增殖的CD8+T细胞亚群扩增。而效应、耗竭和增殖CD8+T细胞亚群高表达NKG2A（Klrc1）和CD94（Klrd1），这提示肿瘤细胞的Qa-1b表达可能通过与CD8+T细胞的NKG2A/CD94抑制性受体结合发挥作用。 ICB治疗时CD8+T细胞发挥杀伤Qa-1b缺陷肿瘤作用 由于IFN能够诱导Qa-1b的表达，Manguso团队假设肿瘤的IFN感应性可以通过Qa-1b抑制CD8+T细胞。然而由于肿瘤IFN感应性丧失可能引起经典的MHC-I类分子下调，导致对CD8+T细胞的抗性，从而掩盖IFN可能介导的抑制作用。为解决这个问题，利用嵌合抗原受体（CAR）T细胞进行杀伤试验，由于CAR-T细胞的识别不依赖于MHC-I类分子，可以避免IFN-γ处理后MHC-I类分子上调带来的影响。 他们首先检测了CD19 CAR-T细胞对Qa-1b缺陷型CD19+KPC细胞的杀伤能力，结果显示CD19 CAR-T显著杀伤Qa-1b缺陷型肿瘤细胞，提示Qa-1b能够抑制CAR-T的杀伤能力。 为探讨Qa-1b上调是否是由IFN介导的CAR-T细胞杀伤抵抗机制，Manguso团队将CD19 CAR-T细胞分别与IFNγ刺激的对照和Jak1（IFN-γ感应基因）敲除CD19+KPC细胞的混合物1:1共培养。结果显示，CAR-T细胞对于这2类细胞的杀伤能力没有显著差异，这表示CAR-T细胞消除了Jak1敲除肿瘤细胞的生存优势。 为了探究IFN诱导的PD-L1上调是否抑制CAR-T的杀伤能力，他们检测了CAR-T联合抗PD-1单抗时两组细胞的存活情况。结果显示当CAR-T联合抗PD-1单抗时，Jak1敲除肿瘤细胞存活增多，这提示PD-L1上调对T细胞杀伤能力发挥抑制作用，联用抗PD-1单抗能够杀伤更多对照组肿瘤。 当Manguso团队使用Qa-1b缺陷型KPC细胞或联用抗NKG2A抗体时，结果显示Jak1敲除肿瘤细胞存活显著增多。这些结果提示CD8+T细胞优先杀死具有完整IFN感应能力的肿瘤细胞，而Qa-1b的上调抑制这种杀伤能力。至于背后的机制，Manguso团队认为这可能是因为IFN能够诱导粘附分子（如ICAM-1）的表达[11]，进而促进CD8+T细胞的杀伤。 在体内实验模型中，Manguso团队发现CAR-T对Jak1缺陷型肿瘤杀伤作用明显，而这种杀伤能力在Qa-1b缺陷的肿瘤中消失。这些结果提示IFN信号可以通过上调Qa-1b来抑制CAR-T细胞毒性。 IFN信号通过上调 Qa-1b来抑制 CAR-T 细胞毒性 最后，Manguso团队探讨了IFN信号对于免疫治疗响应预测的能力。 他们分析了一组接受抗PD-1单抗治疗的黑色素瘤患者队列（6p21.3两倍性），发现ISG的表达与更好的响应相关，这一结果与前述的ccRCC患者队列中的结果相反。 这提示利用IFN特征预测ICB响应需要考虑CD8+T细胞和NK细胞的响应优势，在NK细胞响应占优时，IFN特征与接受抗PD-1治疗差的响应相关；而在CD8+T细胞响应占优时，IFN特征与接受抗PD-1治疗好的响应相关。 高IFN特征在不同肿瘤微环境中与不同的ICB响应相关 Manguso团队还评估了1个接受ICB治疗的202名黑色素瘤患者的队列，分别在基线、治疗后6周和治疗后6个月时间点取样，检测血清中ISG蛋白的水平。 结果显示，在治疗后6周时，响应和无响应患者血清ISG蛋白含量都会增加。而治疗后6个月时，无响应患者血清ISG蛋白含量显著增加。并且，在这2个时间点，血清ISG的变化都与患者更差的无进展生存相关。因此，接受ICB治疗过程中，对于ICB的抵抗可能与IFN和ISG的水平升高有关。 ICB治疗后血清ISG蛋白水平升高与治疗抵抗有关 总的来说，这项研究发现了IFN感应性的丧失在多个动物模型中使得肿瘤对ICB更加敏感。这可以通过两种机制介导，第一是经典MHC-I类分子的上调能够抑制NK细胞，第二是非经典MHC-I类分子Qa-1b的上调可以通过NKG2A/CD94抑制CD8+T细胞。 既往研究往往关注IFN感应性的丧失会引起对ICB的抵抗，这项研究提示了IFN感应性功能的复杂性，IFN介导的MHC-I类分子上调可以发挥促进对CD8+T细胞抗原呈递和抑制NK细胞的双重作用。在高表达NK配体（MICA和MICB）的肿瘤中，由于IFN驱动的MHC-I类分子上调可以抑制NK细胞，高ISG特征与差的响应相关。而在T细胞高度克隆扩增的肿瘤中，由于IFN能够促进对T细胞的抗原呈递，高ISG特征与好的响应相关。因此，ISG特征在肿瘤中的作用可能取决于肿瘤中的免疫效应主要由NK细胞还是CD8+T细胞介导。 除此之外，这项研究中发现非经典MHC-I类分子Qa-1b（HLA-E）可以发挥免疫抑制作用，非经典MHC-I类分子如HLA-F、HLA-G可能发挥的免疫抑制作用也值得进一步探索。