MUC2

03月07日的《热心肠日报》，我们解读了 15 篇文献，关注：肠道真菌，念珠菌素，动物肠道菌群，山羊，猪，蜥蜴，长角血蜱，蚕，蜜蜂，恒河猴，动物模型，强生，MaaT Pharma，辉瑞，CGM产品，蒙牛，妙可蓝多。 该篇日报由R·AI辅助创作生成，人工审核校对。 Nature：菌丝特异性毒素帮念珠菌在肠内安家 Nature——[64.8] ① 白色念珠菌（Ca）可在酵母和菌丝两种形态间转换以适应环境，此前研究认为酵母形态利于定植，菌丝形态增强致病性而不利于定植，这项研究对这一范式提出了不同见解；② 在无菌或菌群耗竭（抗生素处理）的小鼠中，锁定于酵母形态的Ca（ efg1Δ/Δ ）有更强的定植适性，但在细菌丰富的肠道环境中，能在酵母和菌丝形态间转换的野生型Ca则有更强的定植适性；③ 野生型Ca的定植优势部分依赖于菌丝特异性因子，其中，念珠菌素（candidalysin，Ca产生的一种毒力因子，由 ECE1 基因编码）具有抗菌活性，能直接抑制某些细菌的生长和代谢，从而促进Ca的肠道定植；④ 适应性免疫在Ca定植的后期介入，肠道IgA优先选择性地靶向Ca菌丝形态，提示菌丝形态在肠道中受到正负两种选择压力；⑤ 研究者认为，Ca表达的念珠菌素等菌丝特异性因子，可在与细菌的竞争中充当“共生因子”，帮Ca在被细菌定植的肠道环境中站稳脚跟。 【原文信息】 The hyphal-specific toxin candidalysin promotes fungal gut commensalism 2024-03-06 , doi: 10.1038/s41586-024-07142-4 刘宁宁+陈昌斌+王慧等Nature子刊：绘制念珠菌素与人类蛋白靶标的相互作用图谱 Nature Communications——[16.6] ① 上海交通大学刘宁宁、王慧团队联合中科院上海免疫与感染研究所陈昌斌团队揭示了人类真菌病原体白色念珠菌分泌的念珠菌素（Candidalysin），如何通过靶向CCNH以劫持宿主的DNA损伤修复途径，从而促进真菌感染；② 高通量增强型酵母双杂交筛选技术绘制出念珠菌素及其八种Ece1肽段与人类蛋白靶标的相互作用图谱，并发现一系列潜在的相互作用蛋白，其中包括DNA损伤修复过程中CDK激活激酶（CAK）复合体的调节亚基CCNH；③ 念珠菌素直接与CCNH结合，激活CAK复合体，抑制DNA损伤修复途径，导致双链DNA断裂显著增加；④ 在口咽念珠菌病的小鼠模型中，缺失念珠菌素编码基因无法诱导双链DNA断裂，并导致CCNH上调；⑤ 这些发现为深入研究真菌感染致病机制提供了新线索，为抗真菌药物研发提供了新靶点。 【原文信息】 Global fungal-host interactome mapping identifies host targets of candidalysin 2024-02-27 , doi: 10.1038/s41467-024-46141-x 姚军虎+武圣儒等：高淀粉饮食扰乱后肠宿主-微生物稳态 Microbiome——[15.5] ① 西北农林科技大学姚军虎和武圣儒以及加拿大阿尔伯塔大学Leluo Guan与团队研究发现，肠内淀粉过量会触发后肠宿主-微生物稳态中断，导致粘膜受损、结肠吸水能力降低和结肠炎症；② 与低淀粉饮食相比，高淀粉饮食（HES）喂养的山羊结肠病理评分和血清二胺氧化酶活性更高，结肠黏膜黏蛋白-2（MUC2）蛋白表达和粪便评分更低，山羊结肠出现系统性炎症；③ 结肠中的特定细菌和真菌类群以及相关的免疫途径增加，与增强的致病能力、抗原处理和呈递以及辅助性T细胞2型（TH2）介导的细胞因子分泌功能相关；④ HES导致山羊结肠消化物中鹅去氧胆酸和去氧胆酸含量增加，次黄嘌呤含量降低，并促进了TH2介导的炎症相关细胞因子分泌；⑤ 结肠微生物群、微生物功能和代谢组共同解释了宿主表型变异；⑥ 总的来说，HES引起胆汁酸积累，削弱宿主粘膜MUC2生物合成和上皮紧密连接，导致腔内大分子突破物理屏障，同时结肠菌群及其代谢物通过促进抗原呈递和TH2介导的炎症刺激结肠炎症和组织损伤，并抑制结肠吸水能力。 【原文信息】 Multi-omics reveal mechanisms of high enteral starch diet mediated colonic dysbiosis via microbiome-host interactions in young ruminant 2024-02-24 , doi: 10.1186/s40168-024-01760-w 国内团队：利用宏组学揭示猪品种间脂质代谢的调控格局 Microbiome——[15.5] ① 华南农业大学张永亮和习欠云作为共同通讯在Microbiome发表最新研究，通过整合宏组学方法，调查并表征了蓝塘猪和长白猪品种肠道、肝脏和长背肌组织驻留细胞类型以及脂质消化、吸收、转化和沉积的基因特征；② 在长白瘦肉型猪中，识别到特定于品种的脂质吸收和氧化优势，体现在肠道上皮细胞中为能量供应的高密度脂蛋白合成、肝细胞中的胆汁酸形成和分泌以及肠道菌群基因表达中涉及的脂质积累；③ 在蓝塘肥肉型猪中，识别到肠上皮中具有更高的乳糜微粒合成能力，负责高血清三酰甘油水平，肌肉组织中脂质吸收，同时在肌肉纤维脂肪原代子亚群中发现更显著的肌内脂肪细胞生成潜力；④ 这些发现增强了我们对脂质代谢细胞生物学的理解，为改善动物生产和人类疾病开辟了新途径。 【原文信息】 Integrated meta-omics reveals the regulatory landscape involved in lipid metabolism between pig breeds 2024-02-20 , doi: 10.1186/s40168-023-01743-3 国内团队：猪肠道噬菌体是细菌毒力基因的储存库和传播者 Science of the Total Environment——[9.8] ① 吉林大学顾敬敏团队对仔猪肠道噬菌体组及毒力基因进行了研究；② 断奶仔猪肠道噬菌体携带大量致病性基因，其中0.688％的噬菌体contigs编码至少一个毒力基因；③ 毒力基因pblA是最丰富的，各种毒力基因与肠道噬菌体及其编码的移动基因元件（MGE）基因显著相关；④ 一些噬菌体序列中同时存在多个毒力基因和MGE基因，极大增加了噬菌体介导的毒力基因传播到细菌基因组的风险；⑤ 腹泻会导致断奶仔猪肠道内噬菌体和细菌群落的组成和结构变化，显著增加肠道噬菌体编码致病性基因和MGE基因的丰度，可能加剧致病性基因传播风险。 【原文信息】 The pig intestinal phageome is an important reservoir and transfer vector for virulence genes 2024-01-12 , doi: 10.1016/j.scitotenv.2024.170076 国内团队：长期气候变暖下蜥蜴肠道菌群与免疫互作的变化 Microbiome——[15.5] ① 宿主与菌群互作会影响其对气候的适应性，中国科学院动物研究所动物生态与保护生物学重点实验室杜卫国教授及其团队在Microbiome最新发表的文章研究了长期气候变暖对变温动物-沙漠蜥蜴 ( Eremias multiocellata ) 的影响；② 研究显示，短期内（2个月）气候变暖会使蜥蜴肠道菌群多样性降低，但是13个和27个月时，气候变暖条件下的蜥蜴肠道菌群多样性则升高；③ 此外，长期的气候变暖显著提升了蜥蜴血清的抗菌活性、肠道组织免疫反应基因表达以及短链脂肪酸的浓度；④ 粪菌移植实验进一步证明，长期气候变暖（27个月）诱导的菌群多样性增加，特别是拟杆菌的增多，可以通过调节IFN-β的表达，促进蜥蜴的抗菌和免疫反应。 【原文信息】 Gut microbiota modulation enhances the immune capacity of lizards under climate warming 2024-02-22 , doi: 10.1186/s40168-023-01736-2 国内团队：长角血蜱遗传进化和生态景观会塑造病毒组多样性 Microbiome——[15.5] ① 山东大学齐鲁医学院曹务春、赵琳等及团队在Mcirobiome发表最新研究，通过对136组长角血蜱进行宏转录组测序，鉴定出508种RNA病毒，包括48个病毒种，其中22种为首次报道；② 线粒体序列系统发育分析将蜱分为两个遗传类群，每个类群在地理上聚集，并与海拔、降水和归一化植被指数等生态因素显著相关；③ 这两个分支在病毒多样性上表现出显著差异，且共享约五分之一的病毒物种，这些病毒可能已经进化为“多面手”；④ 重症发热伴血小板减少综合征的病原体大别班达病毒仅在第一分支中检测到，而第二分支特有的一半病毒与水生动物相关。 【原文信息】 Virome diversity shaped by genetic evolution and ecological landscape of Haemaphysalis longicornis 2024-02-21 , doi: 10.1186/s40168-024-01753-9 国内团队：桑叶上的“神奇细菌”如何帮助蚕宝宝抵抗真菌感染？ Microbiome——[15.5] ① 中国科学院上海植物生理生态研究所王成树团队揭示了桑叶上的细菌如何帮助蚕抵御真菌感染；② 蚕幼虫在蜕皮和进食白桑叶后，其表皮细菌载量迅速增加，其中鉴定出松鼠葡萄球菌，可完全抑制绿/白僵菌真菌病原体的孢子萌发；③ 松鼠葡萄球菌原本在桑叶上，产生一种分泌型几丁质裂解酶Msp1以破坏真菌细胞壁，而Msp1缺失可显著降低细菌的抗真菌活性；④ 松鼠葡萄球菌预处理蚕幼虫可有效抵御真菌感染，且与野生型细菌相比，Msp1敲除株的保护效果显著降低；⑤ 松鼠葡萄球菌处理饲料不影响蚕的发育，反而可保护人工饮食免受曲霉菌污染。 【原文信息】 From phyllosphere to insect cuticles: silkworms gather antifungal bacteria from mulberry leaves to battle fungal parasite attacks 2024-02-26 , doi: 10.1186/s40168-024-01764-6 肠道菌群有助于蜜蜂觅食强度的变化 ISME Journal——[11] ① 采集3个不相关蜂群的护理蜂和采蜜蜂的肠道样本测序，探究肠道菌群在蜜蜂采蜜行为差异中扮演的角色；② 蜜蜂中的肠道菌群群落结构在巢内护理蜂与外出采蜜蜂间存在显著差异，这些差异与个别微生物丰度变化有关，如星状双歧杆菌和梅利斯孟买乳杆菌等；③ 通过对蜂群物种结构和个体采蜜经验的操纵，发现肠道菌群落组成的差异与任务经验相关；④ 单一微生物接种实验证实星状双歧杆菌和梅利斯孟买乳杆菌等会影响采蜜强度，支持了肠道微生物在社会性昆虫劳动分工中的作用。 【原文信息】 Gut microbiota contribute to variations in honey bee foraging intensity 2024-02-27 , doi: 10.1093/ismejo/wrae030 Nature子刊：恒河猴可以作为诺如病毒感染的理想模型吗？ Nature Microbiology——[28.3] ① 诺如病毒是引起人类急性肠胃炎的主要病原微生物之一，常常在包括医院、餐厅、游轮、学校和托儿所等公共场所广为传播；② Nature Microbiology最新发表的研究采用恒河猴成功建立了人类诺如病毒感染的非人灵长类动物模型，为诺如病毒疫苗和相关疗法的开发提供了新的实验平台；③ 研究证明恒河猴对基因组不同的两种人类诺如病毒均有感染反应；④ 其感染后的病毒排泄时长、病毒进化、特异性免疫应答的诱导、再感染的易感性以及诺如病毒在空肠的优先复制等均与人类感染情况相似；⑤ 研究在感染期间只在小肠观察到轻微的病理特征变化和上皮细胞表面糖基化模式的变化；⑥ 但肠道活检在表达嗜铬素A的上皮细胞中检测到病毒蛋白和RNA，与人类感染情况一致。 【原文信息】 A non-human primate model for human norovirus infection 2024-02-06 , doi: 10.1038/s41564-023-01585-7 强生「古塞奇尤单抗」治疗克罗恩病拟纳入优先审评 ① 3月6日，中国国家药监局药品审评中心（CDE）官网公示，强生旗下古塞奇尤单抗注射液拟纳入优先审评，用于治疗中重度活动性克罗恩病成人患者；② 古塞奇尤单抗是一款白介素（IL）-23抑制剂，已在中国获批治疗银屑病；③ 克罗恩病是一种慢性全身性疾病，表现为胃肠道炎症，给患者带来身体和经济上的负担；④ 在2期临床GALAXI 1研究中，古塞奇尤单抗治疗中重度克罗恩病的患者显示出良好的临床-生物标志物应答和内镜缓解；⑤ 强生公司正在开展两项国际多中心3期临床研究，来评价古塞奇尤单抗治疗中重度活动性克罗恩病的疗效和安全性。 【原文信息】 强生IL-23抑制剂「古塞奇尤单抗」拟纳入优先审评，针对克罗恩病！ 2024-03-06 , 医药观澜 MaaT活菌药MaaT013 PICASSO研究完成患者招募 ① 3月5日，MaaT Pharma公司宣布，管线药物MaaT013 2a期临床试验PICASSO研究完成了患者招募；② PICASSO研究是一项随机、双盲、安慰剂对照试验，旨在评估MaaT013与免疫检查点抑制剂联用治疗转移性黑色素瘤的安全性和有效性问题；③ 管线药物MaaT013是一款含有高丰度和高多样性菌群的活菌灌肠制剂，能够恢复患者肠道菌群紊乱状态，发挥其免疫调节功效；④ PICASSO研究顶线结果预计在2024年最后一季度或2025年第一季度公布，并同期提交至科学期刊。 【原文信息】 March 5, 2024: MaaT Pharma indicates completion of Patient Recruitment for the Phase 2a Investigator-Sponsored Randomized Clinical Trial Evaluating MaaT013 in Combination with Immune Checkpoint Inhibitors in Metastatic Melanoma 2024-03-05 , MaaT Pharma 辉瑞宣布停止建设Seagen的华盛顿州工厂 ① 近日，辉瑞宣布将关闭旗下Seagen公司正在建设的位于华盛顿州埃弗雷特的工厂；② 该工厂占地27万平方英尺，原计划耗资3.5亿美元（约合人民币25.2亿元）；③ 此次停建决定是基于定期评估Seagen生产网络的结果；④ 停建工厂的120名员工将受到影响，辉瑞将尽力将他们安置在Seagen总部；⑤ 辉瑞计划将Seagen的商业产品生产转移到北卡罗来纳州桑福德的工厂，临床生产则在辉瑞网络的其他地点进行。 【原文信息】 辉瑞停止耗资3.5亿美元的Seagen工厂建设 2024-03-05 , 医药魔方 FDA批准首款非处方连续血糖监测仪产品 ① 3月5日，Dexcom Stelo Glucose Biosensor System连续血糖监测仪（CGM）获得FDA批准，这是FDA批准的首款非处方CGM产品；② 该CGM产品面向18岁及以上非胰岛素使用人群，包括使用口服药物治疗糖尿病的人群以及希望更好了解饮食和运动如何影响血糖水平的非糖尿病人群；③ 该CGM产品通过可穿戴传感器每15分钟测量一次血糖水平，并通过手机应用程序显示血糖值和变化趋势，用户可以连续佩戴传感器长达15天；④ FDA表示，该CGM产品可以让更多人在没有医生或健康保险的情况下便捷获取健康信息。 【原文信息】 FDA Clears First Over-the-Counter Continuous Glucose Monitor 2024-03-05 , PR Newswire 蒙牛完成对妙可蓝多增持计划 ① 3月4日，奶酪行业的领先品牌妙可蓝多公布其控股股东内蒙蒙牛增持计划的实施结果；② 结果显示蒙牛通过上海证券交易所累计增持妙可蓝多股份6897259股，占股份总数的1.34%，增持金额约为1.25亿元；③ 此次增持后，蒙牛持有妙可蓝多187569222股股份，持股比例提升至36.51%；④ 根据2023年9月2日披露的《关于控股股东增持公司股份及后续增持计划的公告》，增持实施期限已届满，本次增持计划已完毕。 【原文信息】 蒙牛增持妙可蓝多 2024-03-05 , foodaily 感谢本期日报的审核者：mildbreeze，圆圈儿，RZN，九卿臣，好雨，Richard，lxx，Alex Zhang 点击阅读过去10天的日报： 0306 | 肠道菌群如何代谢胆汁酸？17页高分综述一文读懂 0305 | Cell子刊：肠炎如何影响肠菌DNA"开关"？ 0304 | 《自然·医学》新发现：菌株水平的肠菌特征，为跨癌症免疫治疗提供助力 0303 | 7天不吃饭，人体发生哪些变化？Nature子刊研究带来新知 0302 | 可吞咽设备：诊疗肠道疾病的新利器 0301 | 2月，最值得看的35篇肠道学术文献&产业要闻！ 0229 | 今日Nature：早期大肠癌如何躲过免疫系统？幕后黑手被锁定 0228 | 国内团队Nature子刊：抗性淀粉重塑菌群助减肥 0227 | 魏来/张峰/魏泓等Cell新发现：肠菌"不请自来"，推动遗传性致盲眼病 0226 | 用AI指导大肠癌治疗，大型临床研究再添新证

引言产前地塞米松暴露(PDE)可导致成年后代对各种疾病的易感性增加，但其对肠道菌群组成的影响及其与疾病易感性的关系尚不清楚。2024年2月1日，武汉大学汪晖团队在Cell Reports Medicine (IF 14.3)在线发表题为“Epigenetic programming mediates abnormal gut microbiota and disease susceptibility in offspring with prenatal dexamethasone exposure”的研究论文，该研究发现6个月大的婴儿在产前地塞米松治疗(PDT)中肠道微生物群的性别差异变化持续到2.5岁的女婴胆汁酸代谢改变。PDE雌性后代大鼠肠道菌群定植和组成异常，对胆汁淤积性肝损伤的易感性增加。PDE子代肠道菌群定植异常可能与出生前后CDX2表达降低导致Muc2表达受到抑制有关。结合动物实验和细胞实验，进一步证实了地塞米松通过激活GR/HDAC11信号通路和调节CDX2表观遗传修饰来抑制Muc2的表达。该研究解释了宫内肠道菌群失调的PDT后代的肠道微生物群异常和疾病易感性。肠道菌群建立于寄主童年早期，在此期间共生菌的定植对寄主的发育和长期健康至关重要孕期健康的母体环境是子代肠道菌群发育的重要保证。然而，越来越多的流行病学调查表明，怀孕期间不良的母体环境因素会干扰后代的肠道微生物群，导致他们在成年后易患多种疾病。例如，母亲在怀孕期间使用各种抗生素治疗会增加后代患免疫和代谢疾病的风险，并伴有肠道微生物群紊乱。同时，动物研究证实，孕妇肥胖或妊娠期接触三氯蔗糖可通过调节肠道菌群导致子代对肝脏疾病的易感性。然而，怀孕期间的不利环境因素如何影响后代肠道菌群定植，从而导致肠道菌群组成和功能的改变，目前尚不清楚。产前皮质类固醇治疗是通过促进胎儿肺成熟来降低新生儿呼吸窘迫综合征(RDS)发生率和围产期死亡风险的有效措施。目前世界卫生组织(世卫组织)的建议是注射地塞米松或倍他米松，例如，每12小时注射6毫克地塞米松，共4次剂量，或每24小时注射12毫克倍他米松，共2次剂量(单疗程)，以促进胎儿肺成熟。尽管产前皮质类固醇在保护新生儿呼吸系统方面有短期益处，但其对其他器官的影响尚不清楚。然而，单疗程的产前皮质类固醇治疗与不良的神经认知和/或心理结果、新生儿低血糖和胎儿发育抑制有关，而多疗程的产前皮质类固醇治疗也与低出生体重和心血管疾病风险增加有关。之前的非靶向代谢分析显示，产前地塞米松暴露(PDE)改变了出生前后的血胆汁酸水平，并导致成年后代大鼠的肝损伤肠道菌群在胆汁酸代谢中起重要作用。进入肠道后，肝脏合成的原胆汁酸通过肠道菌群的解偶联、脱氢和去羟基作用进一步代谢生成二级胆汁酸。然而，PDE是否会影响肠道菌群定植和组成?这些肠道菌群的改变是否与PDE成年后代的疾病易感性(例如，胆汁淤积性肝损伤)有关?这些问题都不清楚。模式图（Credit: Cell Reports Medicine）肠道菌群的定植需要足够的粘附位点和适宜的肠道微环境Mucin-2 (Muc2)是肠黏液层的主要成分，主要由杯状细胞分泌下调肠道Muc2表达可改变肠道微环境，从而影响肠道菌群的定植和组成。“宫内编程”是指在妊娠期由于不利环境因素导致的胎儿形态和功能发育的改变，这种改变可以在出生后持续存在，甚至持续一生。表观遗传学是指在不改变DNA序列的情况下基因表达的可遗传变化。研究发现糖皮质激素治疗引起的异常表观遗传修饰可导致多器官功能障碍。因此，研究人员推测PDE通过表观遗传修饰调控子代肠道粘蛋白合成，导致肠道菌群定植和组成异常。该研究揭示了产前地塞米松治疗(PDT)的人类后代和PDE的大鼠后代肠道微生物群组成的变化。然后，通过PDE证实了肠道Muc2表达的宫内编程，并破译了相关的表观遗传机制。最后，证实了PDE诱导的后代肠道微生物群改变使他们容易发生胆汁淤积性肝损伤。该研究确定了肠道菌群定植的影响因素，为探索与肠道菌群异常相关的胎源性疾病的潜在机制奠定了理论和实验基础。原文链接https://doi-org.libproxy1.nus.edu.sg/10.1016/j.xcrm.2024.101409责编|探索君排版|探索君文章来源|“iNature”End往期精选围观一文读透细胞死亡(Cell Death) | 24年Cell重磅综述（长文收藏版）热文Science最新发布：全世界最前沿的125个科学问题热文Nature | 2024年值得关注的七项技术热文Nature | 自身免疫性疾病能被治愈吗？科学家们终于看到了希望热文Nature | 癌症与神经系统的致命舞蹈

02月02日的《热心肠日报》，我们解读了 15 篇文献，关注：肠肺轴，饮食干预，PPI，口腔菌移位，抗菌肽，母婴，心血管，种族，方法学，动物菌群，Novonesis，诺和诺德，中誉宠物，博盛医疗，金匙医学。 该篇日报由R·AI辅助创作生成，人工审核校对。 Cell子刊：肠道菌群对呼吸道病毒感染的影响 Cell Host and Microbe——[30.3] ① 研究肠道菌群组成对呼吸道病毒感染的影响，并发现分节丝状菌（SFB）保护小鼠免受呼吸道病毒感染；② SFB保护小鼠免受流感病毒、呼吸道合胞病毒和新冠病毒感染，这种保护与干扰素和适应性免疫无关，但需要基底驻留的肺泡巨噬细胞（AMs）；③ SFB定植小鼠的AMs基因发生改变，可抵抗病毒诱导的AMs耗尽和炎症信号；④ SFB定植小鼠的AMs通过增强补体产生和吞噬作用直接抵抗病毒入侵；⑤ 将SFB转化的AMs转移至无SFB宿主中，可重现SFB介导的抗病毒保护作用；⑥ 本研究揭示肠道菌群与AMs功能和呼吸病毒感染严重程度之间的复杂相互作用，为未来开发相关干预手段提供了新的思路。 【原文信息】 Intestinal microbiota programming of alveolar macrophages influences severity of respiratory viral infection 2024-01-30 , doi: 10.1016/j.chom.2024.01.002 Nature子刊：饮食干预对人体免疫系统的差异影响 Nature Medicine——[82.9] ① 纳入20名参与者进行2周严格的素食或生酮饮食干预，探讨膳食干预对免疫力和菌群的影响；② 生酮饮食显著影响适应性免疫系统，而素食饮食对先天免疫系统有显著影响；③ 两种饮食显著且不同程度地影响菌群和宿主相关氨基酸代谢，生酮饮食显著下调大多数微生物通路；④ 尽管参与者多样性较大，但数据集之间存在紧密联系，受氨基酸、脂类和免疫系统相关化合物的驱动；⑤ 本研究表明短期饮食干预已足以显著且不同程度地影响宿主免疫系统，对精准营养干预具有重要意义，为个性化饮食方案的制定提供科学依据。 【原文信息】 Differential peripheral immune signatures elicited by vegan versus ketogenic diets in humans 2024-01-30 , doi: 10.1038/s41591-023-02761-2 四川大学华西医院：质子泵抑制剂促进口腔菌群易位，改变肠道菌群 Gut——[24.5] ① 四川大学华西医院杨锦林和肖雪作为共同通讯在Gut上发表最新研究，发现质子泵抑制剂（PPIs）通过破坏胃酸屏障和促进口腔细菌向肠道的易位来改变肠道菌群，漱口水可能有助于减少PPIs使用者肠道菌群变化，降低肠道感染风险；② PPIs通过增加肠道中口腔来源链球菌的丰度来改变肠道菌群，而漱口水可以消除这种改变；③ 施用PPI后未发现肠道内的分类群在属水平上明显减少；④ 咽峡炎链球菌菌不能在低pH下存活，但可以通过PPIs转移到肠道。 【原文信息】 Proton pump inhibitors alter gut microbiota by promoting oral microbiota translocation: a prospective interventional study 2024-01-24 , doi: 10.1136/gutjnl-2023-330883 口腔细菌不太可能在健康人大肠中异位定植 Scientific data——[9.8] ① 16S rRNA基因测序是表征人体微生物群的最常用方法，但对大多数细菌的属以下分类置信度较低，这是由于同一属的不同物种在相同的16S rRNA基因区域的变异水平较低，这项研究使用shotgun宏基因组测序技术分析健康成年人口腔和结肠微生物群，发现口腔和结肠微生物之间的重叠很少；② 分析4个健康成年人队列的500个配对的粪便/口腔样本（4个口腔位点）的数据，发现两个生态位之间的重叠很少；③ 将口腔和粪便样本中的标记基因进行比较，具有物种级别重叠的样本中，只有7个个体的重叠是相同菌株定植；④ 这些发现表明在健康成年人中，口腔细菌在远端肠道中的异位定植是不太可能的。 【原文信息】 Multi-cohort shotgun metagenomic analysis of oral and gut microbiota overlap in healthy adults 2024-01-16 , doi: 10.1038/s41597-024-02916-x 抗菌肽新发现：治疗牙周炎相关脂肪肝病 NPJ Biofilms and Microbiomes——[9.2] ① 本研究发现，抗菌肽乳酸链球菌素（nisin）可以改善牙周炎相关的肠道菌群失调，并调节肝脏的糖脂代谢和炎症；② Nisin促进口腔、小肠和肝脏的有害菌群向健康菌群转变，减轻牙周炎；③ Nisin预防小肠中伴随绒毛结构完整性下降的有害炎症，减轻小肠和肝脏中细菌总量，消除肝脏脂质沉积和丙二醛积累；④ Nisin恢复感染牙周炎后的线粒体失调，改变氧化磷酸化和金属/铁结合相关的基因；⑤ 人体尸检标本表明，牙齿脱落与肝脏疾病严重程度之间有相关性。 【原文信息】 Nisin lantibiotic prevents NAFLD liver steatosis and mitochondrial oxidative stress following periodontal disease by abrogating oral, gut and liver dysbiosis 2024-01-17 , doi: 10.1038/s41522-024-00476-x 国内团队：Cell子刊揭示产前地塞米松暴露对后代肠道菌群和疾病易感性的影响机制 Cell Reports Medicine——[14.3] ① 武汉大学汪晖团队揭示了产前地塞米松暴露（PDE）对后代肠道菌群组成和疾病易感性的影响；② PDE导致后代肠道菌群定植和组成异常，并对胆汁淤积性肝损伤的易感性增加，尤其是雌性后代；③ 产前和产后CDX2表达减少导致Muc2表达抑制，从而介导雌性后代异常肠道菌群定植；④ 机制上，地塞米松通过激活GR/HDAC11信号通路和调节CDX2表观遗传修饰来抑制Muc2表达；⑤ 本研究揭示了PDE对后代肠道菌群和疾病易感性的影响机制，有助于深入理解产前用药对后代健康的潜在影响。 【原文信息】 Epigenetic programming mediates abnormal gut microbiota and disease susceptibility in offspring with prenatal dexamethasone exposure 2024-01-31 , doi: 10.1016/j.xcrm.2024.101398 张群业等：肠道菌群与妊娠并发症的研究现状与未来展望（综述） iMeta——[0] ① 山东大学张群业团队发表综述，探讨肠道菌群与妊娠并发症的研究进展；② 妊娠并发症严重影响母婴健康，迫切需要科学研究和治疗策略以减少其健康和社会经济影响；③ 肠道菌群失调是妊娠并发症的病因和促进因素；④ 肠道菌群衍生的代谢物参与多种与妊娠并发症发病机制密切相关的病理生理途径，包括肠道屏障通透性、炎症反应以及糖脂代谢；⑤ 基于肠道微生物的新兴治疗策略在妊娠并发症中显示出潜力，但缺乏随机对照试验（RCTs）的证据。 【原文信息】 Intestinal flora and pregnancy complications: Current insights and future prospects 2024-02-22 , doi: 10.1002/imt2.167 从种族角度看肠道微生物与心血管健康 Cardiovascular Research——[10.8] ① 这项研究发现某些肠道微生物与心血管疾病存在潜在因果关系，且具有种族特异性效应，其中以克里斯滕森菌科-甲烷短杆菌-瘤胃菌科（CMR）为中心的营养网络，在南亚裔苏里南人中经常缺乏，对心血管疾病风险具有保护作用，并与低甘油三酯水平相关；② 通过机器学习等技术分析肠道菌群组成与心血管疾病之间的因果关系，鉴定的与心血管疾病相关的微生物分类群通常是种族特异的，但在一些种族之间也发现一些一致性；③ 嗜粘蛋白-阿克曼氏菌和瘤胃菌科 UCG-002对非洲裔苏里南人和摩洛哥人的缺血性心脏病的保护作用；④ 血脂、心血管疾病风险和相关微生物克里斯滕森菌科-甲烷短杆菌-瘤胃菌科（CMR）的综合丰度之间存在强烈的负相关，在两个独立队列中也发现了CMR簇，并且与甘油三酯的关联得到了验证；⑤ 研究强调了肠道微生物在心血管健康中的重要作用，为未来个体化医学和精准健康提供了重要的科学依据。 【原文信息】 Networks of gut bacteria relate to cardiovascular disease in a multi-ethnic population: the HELIUS study 2024-01-30 , doi: 10.1093/cvr/cvae018 Nature子刊：如何定义菌株，如何评估菌株数量？ Nature Communications——[16.6] ① 这项研究对如何定义一个菌株以及如何评估构成自然细菌群体的菌株数量等概念进行探究；② 对来自两个太阳盐场的138株随机选择的红色盐细菌进行测序，并将这些基因组与相同样本的短读长-元基因组数据进行对比分析；③ 在这些分离株中基因组聚合平均核苷酸同源性（ANI）值的分布显示双峰分布，进一步分析发现物种内序列空间中存在自然“间隙”，因此利用这个ANI间隙来定义基因组型，而ANI值>99.99%以及共享基因内容>99.0%来定义菌株；④ 138个分离株占据Sal. ruber种群的80%，但估计在一个盐场池塘中总种群由5500到11000个基因组型组成，其中绝大多数在原位是非常稀少的；⑤ 在实验室培养基中最常恢复的分离株通常不是原位中最丰富的基因组型，这表明培养具有偏倚；⑥ 研究对菌株的定义以及对菌株数量评估的方法都对研究微生物多样性提供新的思路。 【原文信息】 Towards estimating the number of strains that make up a natural bacterial population 2024-01-16 , doi: 10.1038/s41467-023-44622-z 热温带千足虫肠道菌群：分类不同，功能相似 Microbiome——[15.5] ① 利用比较宏基因组学和宏转录组学研究热带千足虫（Ep）和温带千足虫（Gc）在相同饮食下的后肠菌群；② Ep菌载量高于Gc，且更多样化；③ 两个物种的菌群显著差异，Ep组装获得282个宏基因组组装基因组（MAGs）且以拟杆菌门为主，Gc获得33个MAGs且以变形菌门为主，其中包括90个新细菌类群（Ep81个，Gc9个）；④ 尽管它们的分类存在差异，但在碳水化合物降解、硫酸盐还原和氮循环等功能上相似；⑤ 某些功能如还原性乙酸发酵和固氮菌仅出现在Ep中；⑥ 两者均丰富表达真菌细胞壁降解酶；⑦ 本研究揭示了千足虫后肠菌群的基因组能力及生态生理学特征。 【原文信息】 Functional similarity, despite taxonomical divergence in the millipede gut microbiota, points to a common trophic strategy 2024-01-29 , doi: 10.1186/s40168-023-01731-7 诺维信和科汉森合并正式完成，Novonesis官宣成立 ① 1月29日，诺维信和科汉森宣布合并正式完成，即Novonesis公司正式成立；② Novonesis致力于成为全球领先的生物解决方案合作伙伴，共同推动更好的业务发展，更健康的生活方式和更可持续的地球环境；③ 合并后的公司拥有全球10,000多名员工，涵盖30多个不同行业领域的专业技能；④ 未来营收报告将分为“食品与健康生物解决方案”和“地球健康生物解决方案”2部分；⑤ 前者包括“食品和饮料”（诺维信的食品和饮料业务以及科汉森的食品菌种和酶业务）和“人类健康”（诺维信的人类健康业务和科汉森的人类健康业务）；⑥ 后者包括“农业、能源和技术工业”（诺维信的生物能源、农业和动物健康/营养、谷物和技术加工业务以及科汉森的动植物健康业务）和“家居护理”（诺维信的家居护理业务）。 【原文信息】 诺维信和科汉森合并正式完成，Novonesis官宣成立 2024-01-31 , Foodaily 诺和诺德减重疗法CagriSema国内获批临床 ① 1月26日，国家药监局药品审批中心官网显示，诺和诺德CagriSema注射液获批临床，拟用于血糖控制不佳的成人2型糖尿病患者；② CagriSema注射液是一款复方制剂，包含两种成分，分别是新一代GLP-1药物司美格鲁肽，以及长效胰淀素类似物卡格列肽；③ 诺和诺德围绕CagriSema在2型糖尿病和减重适应证上开展了多项3期临床试验，CagriSema相比于司美格鲁肽单药，其减重和降糖效果都有显著提升。 【原文信息】 预期减重至少25%！司美格鲁肽复合疗法CagriSema注射液获批国内临床 2024-01-30 , GLP减重宝典 宠物食品生产商「中誉宠物」完成数千万元A轮融资 ① 近日，河南中誉宠物宣布完成数千万元的A轮融资，投资方包括漯河市臻选食品产业基金、广发乾和、郑州高创兴港基金和擎石投资；② 融资主要用于中誉宠物漯河园区二期工程项目和湿粮研发中心的建设，进一步强化其鲜肉烘焙粮生产优势，并新建鲜肉膨化粮产线；③ 2023年全年，中誉宠物营收突破4亿元，国内营收首次超过国外；④ 中誉宠物菏泽湿粮产线预计2024年3月投产，年产能达2万吨。 【原文信息】 独家丨中誉宠物完成数千万元融资：加码鲜肉烘焙粮，新建鲜肉膨化粮产线 2024-01-25 , 宠物家 博盛医疗3D 4K荧光内窥镜系统获批上市 ① 近日，博盛医疗的X1主机及3D 4K荧光超高清电子胸腹腔镜获批，X1内窥镜平台正式获得进入临床的“通行证”；② X1主机采取国内首创的ALL-IN-ONE设计，一机实现多种功能，可用于胃肠外科、甲乳外科、心胸外科和骨科等多个科室；③ 博盛医疗将推动X1内窥镜平台在临床开展大规模试用，不断加强与AI技术的结合，持续推动内窥镜设备发展。 【原文信息】 博盛医疗X1平台全线获证，3D 4K荧光内窥镜系统将正式落地临床 2024-01-30 , 动脉网 金匙医学3款医疗器械获得药监局批准 ① 近期，金匙医学旗下3款医疗器械分别获得天津市药监局批准上市；② 高通量全自动样本制备系统GK21003获得医疗器械二类注册证，该系统用于临床人体来源样本的自动化核酸提取、核酸纯化和文库制备；③ 病原微生物测序数据分析软件Genseq-BSI可分析巨细胞病毒（CMV）、EB病毒和屎肠球菌等9种重要病原微生物信息；④ 全自动核酸纯化仪GensLab Titan内置HEPA系统和紫外消毒装置，可降低核酸气溶胶风险，交叉污染可控制在七十万分之一。 【原文信息】 杏泽资本伙伴企业金匙医学三款医疗器械连获得药监局批准 2024-01-30 , 杏泽资本 感谢本期日报的审核者：圆圈儿，RZN，章台柳，刘永鑫-农科院-宏基因组，617，Richard 点击阅读过去10天的日报： 0201 | 1月，最值得看的40篇肠道健康文献！ 0131 | 今日Cell：于君/沈祖尧团队发现新的促胃癌菌 0130 | 炎症性肠病如何进行营养治疗？胃肠病学顶刊发出最新专家建议 0129 | 国内团队24页综述详解瘤内菌群——肿瘤研究新前沿 0128 | 32分综述详解：饮食如何通过菌群代谢物影响免疫？ 0127 | 今日Cell双发聚焦肠道！揭示肠道免疫和肠肝轴新机制 0126 | 改善心衰，肠菌代谢物提供治疗新思路 0125 | 高糖高油食品如何"绑架"大脑？Cell子刊揭示肠脑机制 0124 | 郝海平等Cell子刊：精神压力如何伤肠道？揭晓肠菌介导的脑-肠轴机制 0123 | 肠道致病菌如何长期感染？高分Cell子刊揭示机制