数据洪流呼啸而来!拥抱高通量测序的日内交付时代!

2024-03-01
环球视野,深度视角广告位招租点击这里下一个出现在这里!各位亲爱的股东,大家早上好中午好晚上好!2024年2月28日,国产测序仪新锐赛陆医疗发布了第二款测序仪Salus EVO。Salus EVO定位中高通量,目前推出1500M/3000M reads两款芯片,2X150测序模式下测序时间压缩至24小时。看起来相当能打,作为NGS测序仪吃瓜一线的我们,当然要做下解读。那么,我们主要从以下3个维度来解析下这款产品。第一,产品性能参数拆解;第二,目标客户与应用场景;第三,未来竞争格局可能的变化;本文用到的数据、图片均得到授权,请放心食用。另外,我们也第一时间拿到了赛陆的产品手册,大家可以扫码下载。链接:https://pan.baidu.com/s/1c6uSFHnSFknNyM3ixVTapA提取码:xyjy性能参数拆解Salus EVO是赛陆的第二款正式商用产品,经过Salus Pro的打磨,对于产品设计、生产、质控都应该有了不小的提升。我这么说是有原因的,先看外观。Salus EVO的整体设计布局与此前的Salus Pro相比有了很大的提升,不知道大家从这个外观可以看出什么来,我们至少可以知道3点。1,Salus EVO是双Flow Cell设计;2,Salus EVO的Flow Cell是4条Lane设计;3,Salus EVO自带机载服务器(很像1U规格);而这3个点,都是为Salus EVO的产品性能指标而设计过的。为什么这么说?首先,我们来看看它的芯片设计。Salus EVO 目前公开的芯片规格有1500M和3000M两种,触碰到了高通量测序仪的门槛。我们稍微做个对比,大家可能看的更清楚一点。上表均以最高测序芯片规格为例,其中MGI DNBSEQ-T7升级过,数据产出量以官网为准。可以看到,从测序数据产出上来看Salus EVO是相对较小的。但是,它与NovaSeq 6000相比测序所用时间明显减少,基本上是DNBSEQ-T7的水平。需要注意的是,DNBSEQ-T7还要考虑到环化等操作的时间,因此我们可以推断在使用1500M芯片的时候Salus EVO能够达到日内交付的水平!其次,我们来看下Salus EVO的“三围”。可以看到Salus EVO是对比产品中最轻量级的,这给测序仪空间的规划带来了很大的便利。上楼很方便,排位置很方便,必须点赞。还要点赞的是赛陆赵陆洋总的“恶趣味”...用自己的体重来进行重量对比...就...很棒...我没拿到赵总授权...就不给大家欣赏了...大家可以自己找他要...第三,我们看下Salus EVO的测序质量。基本上Q30我们就不怎么用看了,这是大家的入门门槛,当然Salus EVO表现是很不错的。我们关注下Duplication情况,相对于对标平台,Salus EVO的Duplication几乎是碾压性的胜出。这一点,我们之前在DNBSEQ平台上见识过。这次,Salus又让我们有了新的惊喜。至于怎么做到的,我还没有查到更为详细的资料。低Duplication能够极大的节约测序数据量的开支,这一点值得点赞。另外,在二级分析中SNP precision略逊色而Indel precision较好,算是各有千秋了。最后,我们再来关心下Salus EVO的一些小细节。芯片/试剂盒的自动识别记录很好的满足了对测序溯源的需要,这算是一个好用的小细节。另外,依然支持双芯片的独立运行,我们称之为“双工”工作模式。也就是说,两张测序芯片不必同时运行,可以随时在A芯片工作时,插入B芯片进行测序,非常灵活。说到灵活,我们就要来盘一盘Salus EVO的目标客户和应用场景了。目标客户与场景我们思考一个问题,大型高通量测序仪是谁在用?用在什么场景?在国内,大型高通量测序仪主要的应用端在集中式测序中心。典型的客户包括明码/序祯达、解码、诺禾致源,“聚天下之样本而测之”。极为密集的样本和通量需求,“喂饱”了大型高通量测序仪,从而能够得到低廉的测序价格。但是,这里同样存在2个弊端。1,样本的聚合,需要物流时间,除非你就在这些测序中心家门口,当我没说。2,大量来自不同客户的样本往往因为index的重复问题,造成了测序时间不一定能够完全保证。你以为这就完了么?由于大量样本的聚合,还存在着潜在的不可控因素。这些,大家都能多多少少有体会。那么,Salus EVO的目标客户和目标使用场景就呼之欲出了。以肿瘤NGS检测应用场景为例,通过采用1500M和3000M芯片的组合搭配,用1台测序仪就能够支撑8-48个大panel的交付需求。当然,不是所有的样本都是大Panel对吧?如果是1G左右的小Panel,1张1500M芯片就能解决450个样本的测序需求。考虑到高低搭配,一个中到大型第三方肿瘤检测实验室或中大型三甲医院实验室刚好符合其应用场景。而这,恰恰是目前国内应用的中坚力量。而且,这货是24小时内下机,还支持双工工作模式。基本上可以做到,“人歇马不歇”,试剂不断数据不断。真正的数据洪流呼啸而来!同样的,中大型科服公司也是目标群体之一。什么单细胞、空间转录组,既减少了凑样,又不用等测序仪的排期。实现“即来即测”的交付模式,已经可以从期待变为现实。这就带来了咱们最后一个话题,未来的竞争格局会变成什么样?竞争格局演变一、Salus EVO的引入,可能加速分布式测序格局的到来。集中式测序当然有着很高的需求支撑,但是,分布式测序对于业务支撑的韧性更强。在保留集中式测序的同时,引入本地中高通量测序仪可以规避潜在的业务中断风险。二、日内交付曙光乍现。由mNGS引入的日内交付模式,带来了行业快速的发展,将mNGS应用场景推到了极致。而由于Salus EVO带来的强大灵活性+急速数据交付能力,将带来空间生物学、单细胞测序、肿瘤基因检测的交付速度演进。从基础学术研究到临床应用,将能够打破速度、灵活性、成本的禁锢(题外话,据说Salus EVO价格很香)。可能引领一波“军备竞赛”。三、目前的EVO并不是终点。测序两大关键技术光学系统和生化系统,赛陆都花了不少力气。如果,能够在芯片密度、光学成像速度和生化反应速度上再提高一步,那么将会带来更为强大的测序系统。最后,看下赛陆的野心吧。这里还有个小彩蛋,很可能在不久的将来赛陆还有一款面向低通量的小型测序仪。我们推测是面向临床端快速交付场景下的测序仪,比如说tNGS。为什么说不久的将来,请看下图。各位还记得否,赛陆2020年10月成立,Salus Pro 2022年9月发布的,而现在才2024年2月...照这个速度下去...2024年都能期待一下了...最后最后我们总结一下:Salus EVO测序仪试图兼顾测序通量、灵活性与交付时间(当然还有价格),目前情况下可能是中大测序样本需求方的最优解之一。Salus EVO填补了中高通量测序需求本地化、分布式测序的需求,能够增强业务的韧性和可靠性。同时,灵活与高速带来了交付时间的提升,可能带来应用场景的变革,进而可能引发“军备竞赛”。这里不得不插一嘴,在单细胞测序时,我们真的需要PE150么?并不。Salus EVO带来的PE50+100 “非对称式”双端测序完全单细胞测序的需求,并且能够大大节约测序时间和测序试剂。可以预见Salus EVO将带来更快的交付速度,更合理的数据使用,更灵活的搭配方式,更有强的业务韧性!数据洪流呼啸而来,而我们即将全面拥抱高通量测序的日内交付时代!END啊对对对对,扫描这货能联系到我近期文章:成真!十亿美元NGS检测实验室诞生!空间生物学惊天逆转!我们正见证历史!Waters中国区2023Q4销售下滑近40%!全年营收增长25%,股票暴跌12.8%!Guardant Health:喵喵喵?勘误:Illumina(因美纳)中国区换帅!Illumina(因美纳)中国区换帅!相关资料:1、发布会ppt2、公司宣传材料
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