更新于：2024-05-01

PTPRE

protein tyrosine phosphatase receptor type E

更新于：2024-05-01

基本信息

别名

protein tyrosine phosphatase receptor type E、Protein-tyrosine phosphatase epsilon、PTPE

+ [3]

简介

Isoform 1 plays a critical role in signaling transduction pathways and phosphoprotein network topology in red blood cells. May play a role in osteoclast formation and function (By similarity). Isoform 2 acts as a negative regulator of insulin receptor (IR) signaling in skeletal muscle. Regulates insulin-induced tyrosine phosphorylation of insulin receptor (IR) and insulin receptor substrate 1 (IRS-1), phosphorylation of protein kinase B and glycogen synthase kinase-3 and insulin induced stimulation of glucose uptake (By similarity). Isoform 1 and isoform 2 act as a negative regulator of FceRI-mediated signal transduction leading to cytokine production and degranulation, most likely by acting at the level of SYK to affect downstream events such as phosphorylation of SLP76 and LAT and mobilization of Ca(2+).

关联

100 项与 PTPRE 相关的临床结果

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100 项与 PTPRE 相关的转化医学

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项与 PTPRE 相关的文献（医药）

2024-01-03·Clinical epigenetics

TET2-mediated ECM1 hypomethylation promotes the neovascularization in active proliferative diabetic retinopathy.

Article

作者: Chunyang Cai ; Chufeng Gu ; Shuai He ; Chunren Meng ; Dongwei Lai ; Jingfa Zhang ; Qinghua Qiu

BACKGROUND:

Studies have shown that tet methylcytosine dioxygenase 2 (TET2) is highly expressed in diabetic retinopathy (DR), which reduces the DNA methylation of downstream gene promoters and activates the transcription. Abnormally expressed TET2 and downstream genes in a high-glucose environment are associated with retinal capillary leakage and neovascularization. Here, we investigated the downstream genes of TET2 and its potential association with neovascularization in proliferative diabetic retinopathy (PDR).

METHODS:

GSE60436, GSE57362, and GSE158333 datasets were analyzed to identify TET2-related hypomethylated and upregulated genes in PDR. Gene expression and promoter methylation of these genes under high glucose treatment were verified. Moreover, TET2 knockdown was used to assess its impact on tube formation and migration in human retinal microvascular endothelial cells (HRMECs), as well as its influence on downstream genes.

RESULTS:

Our analysis identified three key genes (PARVB, PTPRE, ECM1) that were closely associated with TET2 regulation. High glucose-treated HRMECs exhibited increased expression of TET2 and ECM1 while decreasing the promoter methylation level of ECM1. Subsequently, TET2 knockdown led to decreased migration ability and tube formation function of HRMECs. We further found a decreased expression of PARVB, PTPRE, and ECM1, accompanied by an increase in the promoter methylation of ECM1.

CONCLUSIONS:

Our findings indicate the involvement of dysregulated TET2 expression in neovascularization by regulating the promoter methylation and transcription of downstream genes (notably ECM1), eventually leading to PDR. The TET2-induced hypomethylation of downstream gene promoters represents a potential therapeutic target and offers a novel perspective on the mechanism underlying neovascularization in PDR.

2023-10-31·Translational psychiatry

eQTL colocalization analysis highlights novel susceptibility genes in Autism Spectrum Disorders (ASD).

Article

作者: S Dominguez-Alonso ; A Carracedo ; C Rodriguez-Fontenla

Autism Spectrum Disorders (ASD) are a group of neurodevelopmental disorders (NDDs) characterized by difficulties in social interaction and communication, repetitive behavior, and restricted interests. ASD has proven to have a strong genetic component. However, defining causal genes is still one of the main challenges in GWAS, since the vast majority (>90%) of detected signals lie within the non-coding genome. Expression quantitative trait locus (eQTL) colocalization analysis determines whether a specific variant is responsible for both a local eQTL and GWAS association and has helped leverage data and rendering gene discovery for a wide array of diseases. Here we further mine the largest ASD GWAS performed to date (18,381 cases and 27,969 controls) altogether with GWAS summary statistics from the main PGC studies (Schizophrenia, MD (Major Depression) and ADHD (Attention Deficit/Hyperactivity Disorder)), by using eQTpLot, a newly developed tool that illustrates the colocalization of GWAS and eQTL signals in a locus, and the enrichment of and correlation between the candidate gene eQTLs and trait-significant variants. This analysis points up 8 genes with a significant eQTL colocalization signal in ASD (CRHR1, KANSL1, MANBA, MAPT, MMP12, NKX2-2, PTPRE and WNT3) and one gene (SRPK2) with a marginally significant colocalization signal (r = 0.69, p < 1 × 10^-6), and specifically highlights the potentially causal role of MAPT (r = 0.76, p < 1 × 10^-6), NKX2-2 (r = 0.71, p-value = 2.26^-02) and PTPRE (r = 0.97, p-value = 2.63^-04) when restricting the analysis to brain tissue.

2023-03-30·The Journal of infectious diseases

Characterization of "off-target" immune modulation induced by live attenuated yellow fever vaccine.

Article

作者: J Xiang ; Q Chang ; J H McLinden ; N Bhattarai ; J L Welch ; T M Kaufman ; J T Stapleton

BACKGROUND:

Live attenuated (LA) vaccines alter immune functions and are associated with beneficial outcomes. We previously demonstrated that yellow fever virus vaccine (LA-YF-Vax) dampens T cell receptor (TCR) signaling in vitro via an RNA-based mechanism. We examined subjects before and after LA-YF-Vax to assess TCR-mediated functions in vivo.

METHODS:

Sera and peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) were obtained before and after LA-YF-Vax (+/-additional vaccines) or quadrivalent influenza vaccine (QIV). TCR-mediated activation was determined by IL-2 release or phosphorylation of the lymphocyte-specific-Src-kinase. TCR-regulating phosphatase (PTPRE) expression was also measured.

RESULTS:

Compared to pre-vaccination, LA-YF-Vax recipient PBMCs demonstrated transient reduction in IL-2 release following TCR-stimulation and PTPRE levels, unlike QIV control subjects. YFV was detected in (8/14) following LA-YF-Vax. Following incubation of healthy donor PBMCs in serum-derived extracellular vesicles (EVs) prepared from LA-YF-Vax recipients, TCR signaling and PTPRE levels were reduced post-vaccination, even in subjects without detectable YFV RNA.

CONCLUSIONS:

LA-YF-Vax reduces TCR functions and PTPRE levels following vaccination. EVs from serum recapitulated this effect in healthy cells. This likely contributes to the reduced immunogenicity for heterologous vaccines following LA-YF-Vax administration. Identification of specific immune mechanisms related to vaccines should contribute to understanding of the "off target", beneficial effects of live vaccines.

项与 PTPRE 相关的新闻（医药）

2024-04-05

·今日头条

高分Cell子刊：中国农大团队详解后生元

本期话题：后生元，昼夜节律，生命早期，早产儿，肠脑轴，母乳喂养，嗜酸性胃肠道疾病，环保胃肠病学，EnteroBiotix，嘉亨医药，菊乐股份，Onego Bio，盒马该篇日报由R·AI辅助创作生成，人工审核校对。中农Cell子刊：后生元在人类与动物营养和健康中的作用机制（综述） Cell Metabolism——[29] ① 中国农业大学曹志军及团队在Cell Metabolism发表最新综述，从宿主抗氧化活性调节、免疫调控、肠道微生物群修饰和增强上皮屏障功能等方面总结了后生元对机体健康发育的影响；② 提出三种新型后生元制剂的研发思路，包括利用非细菌微生物，识别并区分健康与患病个体肠道菌群的差异性和评估不同生产工艺对后生元制剂功效的影响；③ 后生元制剂在宿主体内潜在的作用机制包括提高抗氧化性能、免疫反应调节、菌群调节和增强肠上皮屏障功能等；④ 后生元制剂对宿主的各种作用是相互联系并达到帮助宿主维持体内稳态的最终结果。【原文信息】 Unlocking the power of postbiotics: A revolutionary approach to nutrition for humans and animals 2024-04-02 , doi: 10.1016/j.cmet.2024.03.004 Cell子刊：肠道菌群的节律性在生命早期就开始发展 Cell Host and Microbe——[30.3] ① 本研究通过随机对照干预试验，探讨了婴儿配方奶与母乳喂养对婴儿肠道微生物群落发展的影响；② 在婴儿出生后的第一年纵向采集婴儿的粪便样本，发现配方奶和母乳喂养的婴儿之间的粪便细菌群落相似，但随着年龄的增长有所不同，但配方奶和母乳喂养的婴儿的代谢物组成有很大差异；③ 与含有B. longum和B. breve或安慰剂的配方奶相比，含有低聚半乳糖（GOS）的婴儿配方奶可以维持高水平的双歧杆菌；④ 婴儿肠道中存在细菌节律性，且细菌多样性、特定菌群和功能通路的节律性随年龄增加而增强，并在母乳喂养和添加GOS的配方奶喂养后最强，即微生物群落的节律性在生命早期就开始发展，并受饮食影响；⑤ 实验还证实了肠道主要菌群的昼夜节律可以在体外连续培养模型中得以维持。【原文信息】 Diurnal rhythmicity of infant fecal microbiota and metabolites: A randomized controlled interventional trial with infant formula 2024-04-02 , doi: 10.1016/j.chom.2024.02.015 Cell子刊：早产儿肠穿孔或与脑损伤相关 Cell Stem Cell——[23.9] ① 研究基于回顾性人群阵列发现早产儿中次脑室区回声性增强（SVE）与肠穿孔相关，肠穿孔后出现的SVE与2岁时认知或运动障碍显著相关；② 构建的新生鼠肠穿孔模型中，小鼠也表现出SVE类似症状；③ 肠穿孔会介导小鼠多纤毛FoxJ1+室管膜细胞中NLRP3炎症体的激活以及室管膜边界的丧失；④ 基于体内冠状脑组织空间转录组测序和体外LPS刺激室管膜细胞模拟肠穿孔，发现炎症环境导致室管膜NF-κB信号传导和与睫状体维持相关的基因表达丢失；⑤ 组装的炎症小体被激活，导致IL-1β的成熟和细胞焦亡发生，最终导致乳酸脱氢酶LDH释放和细胞死亡。【原文信息】 Subventricular zone stem cell niche injury is associated with intestinal perforation in preterm infants and predicts future motor impairment 2024-03-26 , doi: 10.1016/j.stem.2024.03.001 母亲患牙周病，胎儿早产的机率较高 Microbiome——[15.5] ① 研究发现口腔菌群通过血清转移到胎盘，并通过激活免疫信号通路诱导胎盘血管病理，从而解释了患有牙周病女性出现妊娠并发症的风险较高；② 对130例足月分娩、早产（PT）和并发子痫前期（PTPE）分娩期间的唾液、菌斑、血清和胎盘样本进行全基因组测序，在胎盘发现420种微生物类群；③ 胎盘微生物是妊娠并发症最大的鉴别因素，超过高血压、BMI、吸烟和孕妇年龄；④ 使用机器学习算法基于微生物数据集预测PTPE和PT的误差率分别为4.05%和8.6%（分类学）以及6.21%和7.38%（功能）；⑤ PTPE和PT组TLR9显著上调，TLR7下调，并且胎盘微生物基因与这些TLR之间存在密集的相关网络；⑥ 70-82%的胎盘微生物可追溯至血清，进而追溯至唾液和龈下微生物群，而PTPE和PT组的口腔和血清微生物组在编码铁运输、外泌体、粘附、群体感应、脂多糖、生物膜和类固醇降解的基因显著富集。【原文信息】 Placental TLR recognition of salivary and subgingival microbiota is associated with pregnancy complications 2024-03-26 , doi: 10.1186/s40168-024-01761-9 早期生活压力与肠道菌群：童年经历对健康的影响 Brain Behavior and Immunity——[15.1] ① 本研究在广泛的人群基础上探讨了早期生活压力（ELS）与儿童肠道菌群之间的关系，发现ELS中的社会经济压力与肠道菌群多样性降低有关；② 纳入2004名儿童中从出生到10岁进行了前瞻性测量，研究了整体ELS，以及五种不同ELS领域的独特影响，包括生活事件、环境风险、父母风险、人际风险和直接受害；③ 尽管整体ELS与肠道菌群之间未发现显著关联，但与社会经济压力相关的环境风险（包括金融困难和母亲教育水平低）与α多样性降低、β多样性以及色氨酸生物合成等功能途径的变化显著相关；④ 这些关联在一定程度上受整体饮食质量、促炎饮食、纤维摄入和身体质量指数的影响；⑤ 综上，社会经济压力与一般人群中菌群多样性低相关，并且这种关联部分地可以通过较差的饮食和较高的BMI来解释，改变饮食或能减轻社会经济逆境对菌群及相关健康后果的负面影响。【原文信息】  Early-life stress and the gut microbiome: A comprehensive population-based investigation 2024-02-23 , doi: 10.1016/j.bbi.2024.02.024 极早产儿喂养中添加人乳基营养强化剂是否有效？ EClinicalMedicine——[15.1] ① 本研究旨在探讨对极低出生体重婴儿纯母乳喂养时添加人乳基营养强化剂（HMBF）相比牛乳基营养强化剂（BMBF）是否能降低坏死性小肠结肠炎（NEC）、败血症和死亡率的综合结果；② 在瑞典24个新生儿中心进行的多中心随机对照试验中，228名极早产婴儿被随机分配到HMBF组和BMBF组；③ HMBF组中有41名（35.7%）婴儿出现NEC、败血症或死亡，而BMBF组有39名（34.5%）；④ 两组之间的不良事件发生率没有显著差异；⑤ 研究结果表明，与BMBF相比，HMBF的补充并未降低NEC、败血症或死亡的综合发生率，因此不支持将HMBF作为一种预防极早产儿仅喂人乳时发生NEC、败血症或死亡的营养策略进行常规补充。【原文信息】 Effect of human milk-based fortification in extremely preterm infants fed exclusively with breast milk: a randomised controlled trial 2024-01-02 , doi: 10.1016/j.eclinm.2023.102375 JAMA子刊：纯母乳喂养3个月或能降低儿童白血病风险 JAMA Network Open——[13.8] ① 一项基于人口的队列研究发现，较长时间的纯母乳喂养与儿童期B细胞前体急性淋巴细胞性白血病（BCP-ALL）的风险降低有关，与病例对照研究结论一致，建议未来研究应关注潜在的生物机制；② 纳入309,473名儿童，在1,679,635人年的随访中，332名儿童（0.1%）在1至14岁时被诊断出患有癌症其中124名（37.3%）被诊断为血液肿瘤（81名为ALL，其中74名为B细胞前体ALL)，44名（13.3%）为中枢神经系统肿瘤，80名（24.1%）为实体肿瘤，84名（25.3%）为其他和未特指的恶性肿瘤；③ 与纯母乳喂养少于3个月相比，纯母乳喂养3个月以上或更长时间的儿童，其血液癌症的风险显著降低（AHR为0.66），尤其是BCP-ALL（AHR为0.62）；④ 纯母乳喂养对中枢神经系统肿瘤（AHR为0.96）和实体瘤（AHR为0.87）的风险并无显著影响。【原文信息】 Exclusive Breastfeeding Duration and Risk of Childhood Cancers 2024-03-26 , doi: 10.1001/jamanetworkopen.2024.3115 JAMA子刊：为什么与家人一起吃饭很重要？ JAMA Pediatrics——[26.1] ① 本文强调了家庭共餐的重要性，发现每周至少3-4次与家人共餐对父母和孩子都有益处；② 家庭共餐可以降低孩子超重、肥胖、饮食失调、药物滥用、青少年怀孕、抑郁的风险，同时提高自尊和学业表现；③ 家庭共餐有助于家庭成员摄入更多水果和蔬菜，减少油炸食品和含糖饮料的摄入；④ 共餐时应避免手机、电视和电脑等干扰，促进交流，增强家庭凝聚力和孩子的安全感；⑤ 父母应决定用餐时间和食物种类，而孩子决定吃什么和吃多少，避免以食物作为奖励或惩罚；⑥ 饭菜不必花哨，提供至少1种水果和蔬菜，并让孩子参与食物的计划、准备和清理，形式不必拘泥于晚餐，最重要的是要享受和家人在一起的时光！【原文信息】 Eating Family Meals Together at Home 2024-03-25 , doi: 10.1001/jamapediatrics.2023.6669 JAMA：嗜酸性粒细胞性胃肠道疾病临床现状（观点） JAMA——[120.7] ① 本文介绍了嗜酸性粒细胞性胃肠道疾病（EGIDs），揭示了其患病率、临床特征、诊断标准及治疗方法；② 嗜酸细胞性食管炎（EoE）是EGIDs中最常见的类型，北美和欧洲患病率约为0.0344%，婴幼儿常表现出呕吐、腹痛和喂食困难等非特异性反应，青年和成年患者常表现为吞咽困难和胃灼热，其与食物暴露、过敏性疾病以及遗传因素相关，可通过饮食调整和药物治疗（布地奈德或dupilumab单抗）缓解症状；③ 非EoE的EGIDs较少见，临床需使用肠镜进行多次活检确认，其临床表现多样，目前尚无FDA批准的药物，治疗主要依赖于饮食调整和局部皮质类固醇或质子泵抑制剂；④ 近期的一项临床试验显示氨基酸要素膳饮食干预能可使所有入组患者达到完全组织学缓解，但其长期影响仍需进一步研究；⑤ 针对EGIDs的未来研究方向包括dupilumab临床试验、长期要素膳效果、针对炎症级联和细胞信号通路的新药物临床试验等。【原文信息】 Eosinophilic Gastrointestinal Disease 2024-03-25 , doi: 10.1001/jama.2024.2143 Lancet子刊：胃肠健康与环境保护：如何实现可持续发展？（综述） Lancet Gastroenterology & Hepatology——[35.7] ① 通过探讨胃肠病学实践中如何在保证临床效果的同时，减少对环境的影响，提出了一系列可持续的策略；② 避免不必要的内镜检查是减少内镜手术碳足迹的最有效方法，并对于一次性使用的内镜及其配件的使用提出了改革建议；③ 研究还涵盖了胃肠病学实践的其他方面，如诊所管理、虚拟护理和会议等，强调了数字化医疗在环保方面的潜力；④ 通过深入分析，提出了一条实现胃肠科医疗可持续发展的道路，强调了患者护理与环境管理并重的综合策略。【原文信息】 Ecogastroenterology: cultivating sustainable clinical excellence in an environmentally conscious landscape 2024-03-27 , doi: 10.1016/S2468-1253(23)00414-4 EnteroBiotix启动活菌药EBX-102-02治疗IBS 2期临床研究 ① 4月3日，EnteroBiotix公司宣布，启动在研管线EBX-102-02治疗肠易激综合征（IBS）的2期临床试验TrIuMPH研究；② TrIuMPH研究是一项多中心、随机、双盲、安慰剂对照试验，将在英国招募60名便秘型IBS患者；③ TrIuMPH研究主要评价终点为评估EBX-102-02的安全性和耐受性，次要和探索性终点包括评估其初步疗效和潜在生物标志物；④ 在研管线EBX-102-02是一种含有高丰度菌群的活菌药，据信可以重塑肠道菌群，未来将以白色无味的胶囊形式供患者使用。【原文信息】 EnteroBiotix Initiates Phase 2 Study of EBX-102-02 in Patients with Irritable Bowel Syndrome (IBS) 2024-04-03 , Enterobiotix 嘉亨医药「二甲双胍恩格列净片(I)」上市许可申请获受理 ① 4月3日，嘉亨医药二甲双胍恩格列净片（I）提交的上市许可申请，获得国家药品监督管理局受理；② 二甲双胍恩格列净片（I）适用于2型糖尿病成人患者，用于改善血糖控制，该药物由盐酸二甲双胍和恩格列净复配而成；③ 二甲双胍恩格列净片（I）具有良好的降糖效果，无严重不良反应，且与原研参比制剂生物等效性一致；④ 二甲双胍恩格列净片（I）为医保乙类品种，将进一步丰富嘉亨医药在糖尿病治疗领域的产品管线，产品上市后将会为广大糖尿病患者提供更多的治疗选择。【原文信息】喜讯丨二甲双胍恩格列净片(Ⅰ)提交上市许可申请并获得受理 2024-04-03 , 嘉亨医药「菊乐股份」第四次冲击IPO审核中止 ① 近日，菊乐股份首次公开发行股票（IPO）审核因财务资料过期再次中止；② 这是自2023年3月以来菊乐股份第三次因同样原因中止上市审核；③ 菊乐股份成立于1985年，是西南地区龙头乳企，入选农业产业化国家重点龙头企业；④ 菊乐股份此次IPO计划募资13.63亿元，此前，菊乐股份曾于2017年12月、2019年8月、2020年6月三次披露招股书，并在2017年、2019年提交上市申请后撤回，本次为菊乐股份第四次冲击IPO。【原文信息】菊乐食品IPO审核再中止 2024-04-03 , FoodTalks食品资讯精准发酵蛋白开发商Onego Bio获得3700万欧元融资 ① 4月2日，芬兰生物技术公司Onego Bio宣布完成了3700万欧元（约合人民币2.88亿元）的A轮融资，投资方包括NordicNinja VC领投和芬兰政府基金等；② Onego Bio公司计划利用这笔资金继续扩大和优化生产工艺，以及为产品向FDA提交上市申请做准备；③ Onego Bio公司利用精密发酵技术生产鸡蛋蛋白质，其表达系统采用的是一株从芬兰VTT研究机构授权获得的里氏木霉；④ 未来，Onego Bio公司将首先在北美市场推出产品，随后在欧洲、南美和亚洲进行布局。【原文信息】 Onego Bio raises €37m for precision-fermented egg proteins 2024-04-02 , FoodBev 盒马上线宠物系列食品 ① 4月1日，盒马官方宣布上线宠物系列商品；② 此次新增商品包括40余款，涵盖主食、零食、营养补剂及洗护用品等；③ 此举是继上海推出“洗猫洗狗”服务后，盒马进一步拓展宠物市场的行动；④ 此外，盒马还一并推出“不爱吃包退”服务，若宠物对特定商品口味或口感不满意，用户可通过盒马App退货退款。【原文信息】盒马加码宠物商品，上线“不爱吃包退”服务 2024-04-02 , FoodDaily 感谢本期日报的审核者：九卿臣，章台柳，Johnson，RZN，Richard 点击阅读过去10天的日报： 0404 | 顶刊双发：肠菌相关神经发育和肠道免疫研究均有新发现 0403 | 今日Cell肠道研究双发：代谢胆固醇的肠菌+肠炎细胞图谱 0402 | 保肠护关节：高分研究揭示抵御关节炎的肠道因子 0401 | 3月，最值得关注的35篇肠道健康要闻！ 0331 | 聚焦特殊人群：老年人和孕妈妈的饮食新知 0330 | Akk菌或是免疫性肾病帮凶？Science子刊揭示机制 0329 | 33页综述纵论：超加工食品健康转型的新策略 0328 | Science子刊：锁定肠道中让病毒逃脱免疫的"避风港" 0327 | 10文聚焦菌群-肠-脑轴研究新进展 0326 | 100分综述详解：IBD细胞因子疗法最前沿

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