100 项与 Nature SRL 相关的临床结果
0 项与 Nature SRL 相关的专利(医药)
在这硕果累累的金秋时节
备受瞩目的2024年
“院士奖学金、校长奖学金”(科学探索类)
答辩展评会将于10月22日(周二)18:30
在江宁校区会议中心二楼报告厅举行
让我们预先走进候选人的成长历程
一睹他们的奋进轨迹和卓越风采!
院士奖学金候选人
点击图片走进他们的故事▼
心有高山,步履不止
药学院 魏崴
魏崴,女,中共党员,药学院2021级药物代谢动力学专业博士研究生。
多次获得博士研究生学业奖学金,“香港澳美奖学金”三等奖、 “博士生优秀奖学金”、热心肠论坛“热心肠 × iMeta奖学金”三等奖等荣誉。
科研成绩突出,主要从事慢性精神应激诱导肠上皮细胞损伤易感性的脑-肠信号传递与代谢调控机制研究。目前以共同第一作者(排名第一)在代谢领域国际顶级期刊 Cell Metabolism (IF:27.7,一流期刊)发表封面文章。目前该文章被 Nature 主页以 NEWs 的形式进行同步报道,同时中国科学技术大学第一附属医院的学者依据该文章在 Cell Stem Cell 的 Spotlight发表了聚焦评论文章。除此之外,还以第二作者在国际权威期刊 Nature Communications(IF:14.7,权威期刊)发表研究成果,该论文被 Nature Microbiology Community 同期报道。
乘风破浪,勇往直前
中药学院 刘任萌
刘任萌,女,中共预备党员,中药学院2021级中药学专业本科生。曾任班级学习委员一职。
获得2021-2022学年度本科生国家奖学金、2022-2023学年“优秀学生奖学金”一等奖学金,连续两年获得校“三好学生标兵”称号,连续三年获得“外教社·词达人杯”全国大学生英语词汇能力大赛 江苏赛区 本科非英语专业组二等奖。
学习成绩突出,前六学期GPA达到4.32,排名专业第一,认真履行学习委员应有职责,为同学答疑解惑,开展学业帮扶。注重科研实践,共参加一项校级大创、九项开放性实验。不断发展兴趣爱好,曾作为校凌霄合唱团的一员,用心感受“药乐相融”。积极投身公益,自入校以来参加志愿服务多项,累计志愿时长百余小时。
兴药为民 明志笃行
中药学院 潘兴明
潘兴明,男,中共党员,中药学院2020级中药学专业博士研究生。获2023及2022年博士生学业奖学金、2022年优秀博士生奖学金。荣获2023年“三好学生”称号。在2023年国际药学研究生学术论坛获优秀摘要三等奖。
科研成绩突出,作为负责人承担江苏省研究生科研创新计划;作为主要参与者参加国家或江苏省等4项科研项目。申请专利1项。以共同第一(排一)在权威期刊《Journal of the American Chemical Society》发表研究成果,以独立一作在学科顶尖期刊《Natural Product Reports》发表综述,《Methods in Enzymology》撰写重要章节,以合作作者发表3篇论文,包括两篇权威期刊《Angewandte Chemie International Edition》。获得CATTI三级笔译,AI药物设计中级工程师证书。积极参与科普工作,开办学术科普公众号,五个月内发表原创内容100余篇,吸引5400余名关注者。
勇于探索,感受成长
生命科学与技术学院 袁康
袁康,男,中共预备党员,生命科学与技术学院2021级药学(生化与药理方向)本科生,曾担任中国药科大学学生会执行主席,黄山市大学生兼职基层团组织副书记、校学业支持中心讲师,生科院学业发展中心主席等职。作为负责人为学校夺得首枚中国国际大学生创新大赛金奖,曾作为第一发明人申请发明专利5项、实用新型专利1项,参与发表SCI论文两篇(IF=10.6、4.0),曾前往剑桥大学、清华大学、西湖大学等高校进行科研实习和学术交流,获评江苏省三好学生、江苏省三下乡社会实践先进个人、中国药科大学校长奖学金、大学生年度人物等荣誉。
勤研致诚,修行致远
生命科学与技术学院 钱斌
钱斌,男,群众,生命科学与技术学院2021级生物学博士研究生,曾获2021年“中国药科大学博士生国家奖学金”、2022年江苏省优秀硕士学位论文,在生命科学和医学领域取得了显著成果,作为第一作者在顶尖期刊《Cell Reports》(IF=7.5)和一流期刊《Diabetologia》(IF=8.4)发表论文,并以共同第一作者在顶尖期刊《Diabetes》(IF=6.2)发表文章,以第二作者在《Current Medical Science》(IF=2.1)上发表研究成果。此外,他还积极参加学术会议,包括中国病理生理学会肾脏专业委员会年会等,成果被第十六届全国免疫学大会论文汇编收录。
从巴山药乡出发
做勇敢追梦的富硒少年
工学院 汤奇锰
汤奇锰,男,共青团员,工学院2021级食品质量与安全专业本科生,现任2111202班班长,曾担任校大艺团红叶舞蹈团常务副团长、2112006班团支部书记等职。
获得国家励志奖学金、优秀学生奖学金二等奖学金,曾获江苏省“优秀学生干部”、校“优秀共青团员”、校“学雷锋先进个人”、校“社会实践优秀个人”、校“宣传积极分子”等荣誉称号。获得江苏省第七届大学生艺术展演舞蹈展演群舞项目甲组一等奖、“21世纪杯”全国英语演讲比赛校赛一等奖。
主持“针对IBS人群的诊疗一体化服务平台构建”项目并入围“科创江苏”创新创业大赛决赛;主持省级大创项目,利用来自镇坪黄连基地的主要副产物黄连花及三种当地常见中药材为原料进行抑菌口腔喷雾的研究与开发。
承兵团根脉,写奋斗青春
基础医学与临床药学学院 李忠华
李忠华,男,汉族,中共党员,基础医学与临床药学学院临床药学专业2020级本科生,现任班级团支部书记。
2023-2024学年综合成绩排名专业第一,以第一作者在Clinical Immunology期刊发表研究性论文,现已推免至我校直接攻读博士学位。荣获国家奖学金、江苏省“三好学生”、校长奖学金、校“瑞华杯大学生年度人物”、校“优秀共青团干部-十佳团支部书记”等荣誉称号,带领班(团支部)级获评江苏省“先进班集体”、校“五四红旗团支部”。在2022年江苏高校百校万名团干部思政技能大比武中获基层团支部书记专项赛二等奖,主讲的信仰公开课“接续兵团魂,奋进新征程”入选2023年共青团江苏省委“信仰公开课”省级精品课,在第二届长三角高校本科生临床药学技能邀请赛中获一等奖。
路漫漫其修远兮
吾将上下而求索
多靶标天然药物全国重点实验室 李锦然
李锦然,女,汉族,中共党员,多靶标天然药物全国重点实验室药学(新药临床前评价)专业2022级硕士研究生。荣获国家奖学金、特等学业奖学金和社会奖学金等多项荣誉。专注于抗阿尔茨海默病新药开发,作为主要学生参与人,协助导师完成多靶标新模型的建立和新药候选分子筛选,成功获得一个全新结构类型的候选化合物,该项目荣获江苏省十大科技成果之一,且候选药物目前正在完成科技成果转化。以第一作者和第二作者于SCI期刊cells、Frontiers in Immunology和Advanced science发表论文三篇,作为共同作者发表论文三篇。
志在云霄,星光璀璨
理学院 钱韫韬
钱韫韬,男,中共党员,理学院2021级信息管理与信息系统专业本科生,现担任2105103班班长。连续2年获得校一等奖学金,多次获得校优秀共青团员,校优秀学生干部、校优秀共青团干部、校三好学生标兵等荣誉称号;曾获“外教社·词达人杯”江苏省三等奖、蓝桥杯艺术设计赛江苏省三等奖等;获阿里云大数据专项技能认证、工信部计算机视觉架构师初级等专业素养认证。主持一项国家级大创、一项校级大创,作为核心成员参与一项国家级大创,参与一项开放性实验。参与2篇在投论文的撰写,申请软件著作权7项(1项申请中)、参与发明专利2项(1项申请中)。协助其他项目组完成多个软件开发,并完成药物发现平台的搭建。目前已推免至浙江大学。
校长奖学金
(科学探索类)
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勇攀高峰
做“敢闯会创”的药大青年
药学院 王京虹
王京虹,女,共青团员,药学院2021级药学(诊断试剂方向)本科生,现任2101601班心理委员。
曾获国家励志奖学金、优秀学生奖学金,本科前三年综合成绩排名专业第一。荣获校“三好学生”“学雷锋先进个人”“优秀心理委员”“优秀青年志愿者”等荣誉。现已推免为清华大学直博生。
以第一负责人或核心成员,带领团队参加“互联网+”“挑战杯”等学科竞赛,斩获国家级奖项1项、省级奖项5项以及校级奖项3项。其中,所获的第九届全国大学生生命科学竞赛全国一等奖、中国国际大学生创新大赛(原“互联网+”)江苏省二等奖,分别是我校唯一进入决赛的队伍和我校本科生组的最好成绩。
同时,积极投身于社会实践和公益活动,累计志愿服务时长133小时。
逐梦新药,精勤笃行
药学院 李叶红
李叶红,女,中共党员,药学院2021级药理学专业博士研究生,现任药学院药理博士党支部纪检委员,曾但任药学院药理博士党支部书记。
多次获得研究生一等学业奖学金、优秀博士奖学金、澳美制药奖学金三等奖、2024年第三届北大医学-全国心血管代谢优秀博士论坛口头汇报三等奖、2023 ASRMU Pharmacy Graduate Innovation Forum IV Sino-Russian Forum of young scientist等。获得中国药科大学“三好学生”荣誉。
科研成绩突出,作为项目负责人承担江苏省科研与创新实践计划项目1项;作为主要参与者参加国家自然科学基金面上项目、国家重点研发计划、江苏省自然科学基金项目和横向课题等12项科研项目;发表论文5篇,包括一篇权威期刊(IF = 37.6,共一排一),另有3篇研究性论文处于投稿阶段。多次参加国内大型研究生学术论坛并进行口头汇报。
壮志凌云,烽火不息
药学院 张凌烽
张凌烽,男,共青团员,药学院2023级药剂学专业博士研究生。
曾获研究生国家奖学金、圣和研究生创新成果奖、优秀博士奖学金、研究生一等入学奖学金、一等学业奖学金、校三好学生、优秀共青团员等荣誉。
主要研究方向为肝纤维化治疗与高端制剂研发,发表SCI论文6篇,累计影响因子98.627,其中以第一作者在权威期刊《Advanced Materials》(IF = 27.400)、学科顶尖期刊《ACS Nano》(IF = 18.027)与学科顶尖期刊《Advanced Science》(IF = 14.300)发表SCI论文3篇,获授权专利1项,公开专利1项。2024年赴韩国参加第12届世界生物材料大会进行学术交流。作为主要参与者参加国家自然科学基金重点国际(地区)合作研究项目、面上项目、科技部高端外国专家引进计划等多项科研工作。
把“冷板凳”坐热
为“中国药”奉献青春力量
药学院 金熠
金熠,女,中共党员,药学院2021级药剂学专业博士研究生。
曾获圣和研究生创新成果奖一等奖、香港澳美奖学金、卡乐康奖学金、校三好学生、国际药学研究生学术论坛优秀口头报告与优秀摘要奖、江苏省普通高等学校本科优秀毕业论文等荣誉。
聚焦中枢重大疾病调控与创新干细胞制剂开发,以第一作者在权威期刊《Advanced Materials》(IF=27.4)、学科顶尖期刊《Journal of Controlled Release》(2篇)、学科一流期刊《Biomaterials》(IF=15.304)发表SCI论文4篇,累积影响因子64.67,参与发表SCI论文7篇,他引次数累计140次,授权专利1项;主持江苏省研究生科研创新计划项目并顺利结题,参与国家自然科学基金面上项目等多个科研项目;分别入选首届国际药学研究生学术论坛与第十七届中国药物制剂大会作口头报告。
功不唐捐,玉汝于成
药学院 唐诚
唐诚,男,中共预备党员,药学院药学专业本科生。现任2201204班班长,曾任药学院团委素质拓展部总负责人、第七届学生校长助理等职
作为班长带领班级获校“先进班集体”等荣誉;获评校“优秀共青团干部”等、“江苏省优秀学生干部”。获省、市、区级优秀志愿者11次,组建团省委立项等暑社团队3支,受国家环境保护部直属新闻机构采访。
多次获优秀学生奖学金。结题省级大创等项目5项,成果获专利一项,两篇文章发表于中科院一区TOP期刊;作为负责人参加中国国际创新大赛获江苏省银奖。作为负责人参加“泰格杯”医药创新创业大赛获特等奖。
一路向阳待花期
工学院 朱尚坤
朱尚坤,男,中共党员,工学院2022级生物与医药专业硕士研究生。曾于本科期间担任团支部书记、院学生会主席等职务。
在校期间多次获得硕士研究生学业奖学金,曾获第十八届全国环境友好科技竞赛三等奖、第九届全国青年科普创新实验暨作品大赛(江苏赛区)一等奖。
科研成绩突出。主要研究方向是中药渣等制药废物的资源化利用策略研究,期望助力制药等行业的绿色发展;作为主要参与者参加江苏省研究生科研创新计划、国家自然科学基金等多项科研项目;研究生阶段在《Green Chemistry》《Chemical Engineer Journal》等国际、国内高水平专业期刊上以第一作者身份发表论文多篇,多次参加国内大型学术会议。
追光逐梦赤子心
科研报国正青春
生命科学与技术学院 吴羚锐
吴羚锐,男,共青团员,生命科学与技术学院2021级生物制药专业本科生。51门课程成绩90+,前六学期加权学业成绩和综合素质测评成绩均位列专业第一,保研至北京大学前沿交叉学科研究院生命科学联合中心CLS项目(直博)。获评国家奖学金(2次)、苏州工业园区奖学金、校“优秀学生奖学金”一等奖学金、校三好学生标兵等10余项荣誉。获第八届全国大学生生命科学竞赛国家二等奖、第九届全国大学生生命科学竞赛国家三等奖、第二届“外教社“词达人杯”全国大学生英语词汇能力大赛省级三等奖。
作为负责人主持一项国家级大创、两项省级大创项目。以第一发明人申请一项发明专利,以第三发明人申请一项发明专利(已获得授权)。以第一、三作者身份在国内核心期刊上发表新型抗菌化合物挖掘相关内容的论文两篇。参与发表天然化合物生物合成中的糖基化修饰机制相关论文至SCI期刊《Microbial Biotechnology》(Q1,IF=5.7)两篇。曾先后前往药企、浙江大学和西湖大学开展4段生产和科研实习。作为大创项目优秀团队负责人,分享大创和科研经验。积极参加国际互联网+专题培训、江苏省高等医药院校大学生医药融合高峰论坛等学术交流活动。
以热爱为名
在理性与感性之间找到锚点
国际医药商学院 吴志强
吴志强,男,群众,国际医药商学院2022级药事管理专业本科生,抚州市作家协会会员,现担任校学促会学生讲师、国际医药商学院学生讲师,曾担任校新媒体中心微信部干事。获中国药科大学单项奖学金、四川科伦药业奖学金,美国大学生数学建模竞赛一等奖、江苏省高等数学竞赛本科一级一等奖、全国大学生高等数学竞赛二等奖。参与开放性实验一项,校级大创一项(已结题)。担任学生讲师期间,线下授课50h+,所带学生全部通过高数考试,有学生拿到满分。自制高数教学视频上传网站,收获5.1万粉丝、24.1万点赞,视频总播放量接近400万。在十几种国家级、省级刊物发表文学作品三万字,有小说入围全国文学大奖、被选为山东省济宁市中考二模语文阅读理解考试题。
行而不辍,屡践致远
基础医学与临床药学学院 张丁鉴
张丁鉴,男,共青团员,基础医学与临床药学学院2021级临床药学专业本科生。
广泛参与学科专业竞赛,作为第一贡献者参与2023年国际基因工程机器大赛(iGEM),负责学术组、数模组、美工组核心工作,荣获国际“金奖”“最佳新型基础元件单项奖”提名(世界六强)。参加2023年第二届合成生物学竞赛,荣获创新赛金奖,2024年参加第三届合成生物学竞赛,荣获蛋白质设计赛金奖。
积极参与科研工作,分别于2023年与2024年参与和负责校级创新训练项目;参加SBC、CCTB、第八届华西药物经济学与药物政策学术年会,并在第十届中国地区iGEMer交流会(CCiC)作口头学术汇报;专研Rosetta与Alphafold2技术,与多个高校、企业、医院进行技术合作。以共同第一作者、第三作者在投SCI论文两篇。
志之所趋,无远弗届
基础医学与临床药学学院 黄毅哲
黄毅哲,男,共青团员,基础医学与临床药学学院22级药理学专业博士研究生。
曾获得苏州工业园区奖学金和一等学业奖学金,2024年6月,他以第一作者在权威期刊——Neuron杂志(IF 14.7)上发表了研究性论文,该论文也被选为当期的featured article。同时,领域内专家也在Neuron上发表了对该研究的评述对我们这项研究的意义给予高度评价。实验之余,他积极参加各项学术交流活动,在学校承办的第九届国际离子通道大会中担任志愿者并且参与设计了会议logo及文创用品。作为校羽毛球队的一员,积极参加校内羽毛球活动,定期与其他学校交流,参加省市各类比赛为校争光。
奋楫扬帆不止步
履践致远勇向前
理学院 陈子慧
陈子慧,女,共青团员,理学院2022级化学专业硕士研究生,荣获研究生学业特等奖学金、一等奖学金及“三好学生”等荣誉。在硕士期间,科研成绩突出,共发表9篇SCI论文,分别刊登于《Chemical Engineering Journal》《ACS Applied Materials & Interfaces》《Talanta》等国际知名期刊,累计影响因子达66分,其中4篇为第一作者,5篇为第二作者。
积极开展创新实践,联合创办阿赛普特生物科技有限公司,担任技术指导和财务管理负责人,致力于推动生物医药技术咨询、推广与合作;合作搭建了“BioMimics医工进展”学术公众号,服务同领域的8500余名科研人员,在运营期间,撰写了超过50篇原创学术推文,累计阅读量突破10万次;作为新晋小红书科普博主,粉丝近500人,致力于汇总并分享纳米科技前沿知识,推动科学普及。
2024年院士奖学金、校长奖学金
(科学探索类)将花落谁家?
期待您的到来
让我们共同见证!
来源|药大学工
编辑|杨书惠 杨悦 龙彦妤
审核|张学林 卢献锁
OTC2024类器官前沿应用与3D细胞培养论坛圆满落幕,点击图片可查看会后报告,咨询OTC2025类器官论坛请联系:王晨 180 1628 8769
文章来源:新智元 编辑:编辑部
谁能想到,昨天的故事又重演了。2024诺贝尔化学奖,颁给了DeepMind的Demis Hassabis和John M. Jumper和华盛顿大学的David Baker。就在2023年,Hassabis和Jumper获得了「诺奖风向标」拉斯克大奖,今天果然灵验了。
就在刚刚,2024诺贝尔化学奖揭晓。
今年的奖项,一半授予美国华盛顿大学的David Baker,以表彰其在计算蛋白质设计方面的贡献。
另一半则授予DeppMind的Demis Hassabis和John M. Jumper,以表彰其在蛋白质结构预测方面的贡献。
他们三位都致力于AI蛋白质的研究。
没错,万物皆可AI,今年的诺奖是妥妥的AI年
根据委员会的官方公告,今年的诺贝尔化学奖聚焦蛋白质。
David Baker成功完成了几乎不可能的惊人成就:构建全新种类的蛋白质。
而Demis Hassabis和John Jumper则在2020年开发了AlphaFold 2,解决了人类50年来的梦想:预测蛋白质的复杂结构。
我们现在能够预测蛋白质结构并设计自己的蛋白质,这一突破为人类带来了巨大的益处,开启了无限可能。
没想到,我们曾经的预言成真了。
补充阅读:预定诺奖?DeepMind创始人斩获「诺奖风向标」拉斯克奖,AlphaFold成「AI for Science」标杆
拉斯克大奖再次证明了自己「获奖风向标」的地位。
Hassabis也度过了传奇的一天:白天祝福好朋友得诺奖,晚上自己亲自得诺奖。
纽约大学助理教授谢赛宁回忆称,在DeepMind实习期间,Hassabis被问及公司目标时,便提到了获得多个诺贝尔奖。
而如今,这个使命已经实现了一部分。
Demis Hassabis
Demis Hassabis 1976年出生于英国。
4岁起,他就是国际象棋神通,在13岁时达到了大师标准。
1997年,他以双第一的成绩毕业于剑桥大学,在伦敦大学学院完成了认知神经科学博士学位,又在MIT和哈佛攻读博士后。
2010年,他和Shane Legg共同创办DeepMind,担任CEO。
2023年,DeepMind和谷歌大脑合并后,Hassabis担任谷歌DeepMind团队CEO。
关于DeepMind的诞生还有一段传奇故事:作为14岁以下世界上排名第二的象棋选手,Hassabis在一次聚会上成功征服了Peter Thiel,获得了225万美元风投,成立了DeepMind。
补充阅读:OpenAI工程师曝出开发ChatGPT只用8天!长文揭秘谷歌DeepMind等硅谷顶流如何诞生
John M. Jumper
John Jumper是DeepMind的美国高级研究科学家。
2017年,他在芝加哥大学获得博士学位。
作为一作,他和同事共同创建了AlphaFold。
2021年,他被Nature列为年度榜单十大「重要人物」之一。
David Baker
David Baker 1962年出生于华盛顿州西雅图。
1984年获得哈佛学士学位,1989年获得UC伯克利生物化学博士学位。
他是蛋白质设计领域的「鼻祖级」人物,设计出了比AlphaFold更早的蛋白质结构设计算法RoseTTAFold,时间上比DeepMind更早。
作为美国国家科学院院士、华盛顿大学蛋白质设计研究所所长,他联合创办了十几家生物技术公司,并入选《时代》 2024年首届100名最具影响力的健康人物名单。
他们通过计算和AI揭示了蛋白质的秘密
支撑生命体各种活动的,是体内旺盛且多样的化学反应,而蛋白质发挥了关键作用。
蛋白质通常由20种氨基酸构成,理论上,这些氨基酸可以以无限多种方式组合。以存储在DNA中的信息作为蓝图,这些氨基酸在我们的细胞中被连接在一起形成长链。
接下来,蛋白质的奇妙之处就体现出来了:氨基酸链会扭曲并折叠成一个独特的,有时甚至是独一无二的三维结构,正是这种结构赋予了蛋白质的生物功能。
蛋白质可由十几个到几千个氨基酸组成,氨基酸链会折叠成特定的三维结构,而这种结构决定了蛋白质的功能
有些蛋白质成为生命体的基本单元,可以构建肌肉、角或羽毛,而其他的则可能成为激素或抗体。
其中许多蛋白质会形成酶,以惊人的精确度驱动生命的各种化学反应。位于细胞表面的蛋白质同样重要,它们充当细胞与其周围环境之间的信号传递通道。蛋白质的首批图像
自19世纪以来,化学家们就知道蛋白质对生命过程至关重要,但直到20世纪50年代,化学工具才足够精确,研究人员才能开始更详细地探索蛋白质。
剑桥研究人员John Kendrew和Max Perutz在50年代末取得了突破性发现,他们成功使用一种叫做X射线晶体学(X-ray crystallography)的方法首次呈现出蛋白质的三维模型。
因为这一发现,他们于1962年获得了诺贝尔化学奖。
此后,研究人员主要使用X射线晶体成像技术,加上付出了大量努力,成功绘制出约20万种不同蛋白质的图像,才为今年的诺贝尔化学奖奠定了基础。蛋白质折叠之谜:一个50年的挑战
美国科学家Christian Anfinsen做出了另一项早期重要发现。
通过各种化学技巧,他成功地使一个现有蛋白质展开,然后再次折叠起来。有趣的是,蛋白质每次都呈现出完全相同的形状。
1961年,他得出结论,蛋白质的三维结构完全由氨基酸序列决定,这项发现使他在1972年获得了诺贝尔化学奖。
然而,Anfinsen的逻辑中包含一个悖论,另一位美国科学家Cyrus Levinthal在1969年指出了这一点。
Levinthal计算出,即使一个蛋白质只由100个氨基酸组成,理论上该蛋白质也可以呈现出至少10^47种不同的三维结构。
如果氨基酸链是随机折叠的,那么找到正确的蛋白质结构所需的时间将比宇宙的年龄还要长。然而在细胞中,这个过程只需要几毫秒。那么,氨基酸链究竟是如何折叠的?
Anfinsen的发现和Levinthal的质疑共同指向了一个事实:氨基酸折叠是一个预定的过程。更重要的是,关于蛋白质如何折叠的所有信息都必须存在于氨基酸序列中。生物化学领域新圣杯
上述见解导致了另一个决定性的认识——如果化学家得知了蛋白质的氨基酸序列,他们就应该能够预测蛋白质的三维结构。
这是一个令人兴奋的想法。如果成功,他们将不再需要使用复杂的X射线晶体学技术,并且可以大大节省时间;此外,还能够为所有X射线晶体学不适用的蛋白质生成结构。
这些逻辑和结论引出了生物化学领域的新圣杯:预测问题。
为了促进该领域的快速发展,1994年研究人员启动了一个名为「蛋白质结构预测关键评估」(CASP)的项目,之后发展成为一项竞赛,每两年举办一次。
在CASP竞赛中,来自世界各地的研究人员都可以拿到刚刚一批蛋白质的氨基酸序列。这些蛋白质的结构刚刚被测定出来,但对参赛者严格保密。他们需要根据已知的氨基酸序列来预测蛋白质结构。
CASP吸引了许多研究人员,但事实证明,蛋白质结构预测是相当困难的,多年来进展十分缓慢,预测结构和真实结构之间的异质性几乎没有任何改善。
直到2018年,突破才终于出现,一位集国际象棋大师、神经科学专家和人工智能先驱于一身的人物进入了这个领域,为这个长期存在的难题带来了全新的视角。
这个人,就是DeepMind联合创始人Demis Hassabis。AlphaGo大师挑战蛋白质奥林匹克
Demis Hassabis无愧于当今AI深度学习的一大元老了。
他从4岁开始下国际象棋,13岁就达到了大师水平。在青少年时期,他便开始了程序员和游戏开发者的职业生涯。
随后,Hassabis开始探索AI,并涉足神经科学,做出了几项革命性的发现。
他坚定地认为,人工智能神经网络与人脑密不可分。因此,他决定利用自己所学的大脑知识,来开发AI神经网络。
2010年,Hassabis与儿时的好友Mustafa Suleyman、以及研究同僚Shane Legg共同在英国创立了DeepMind。
当时,他们创造了一个以类人方式学习玩棋盘游戏AI神经网络,一举成名。
这个神经网络可以接入一个外部的存储器,就像一个传统的图灵机一样,使得一台电脑可以模拟人类的短期记忆。
2014年,DeepMind被谷歌正式收购。
就在同年,Hassabis带领团队拿下了被许多人视为AI领域的圣杯。
他们开发出的AlphaGo算法击败了世界围棋冠军。最为人熟知的是,2016年AlphaGo在与著名棋手李世石交手中,拔得头筹。
随之,进化版的AlphaGo再次战胜了人类选手。
然而,对Hassabis来说,围棋并不是终极目标,而是开发出更好的AI的手段。
在这场胜利之后,他们准备去迎接对人类更为重要的挑战——
因此,在2018年,Hassabis和团队报名参加了第十三届蛋白质结构预测关键评估(CASP)竞赛。Hassabis的AI模型意外获胜
过去几年里,CASP参赛的研究者在蛋白结构预测上,最多能实现40%的准确率。
Hassabis团队拿着AlphaFold去参赛后,竟达到了60%准确率。
因此,在CASP竞赛首次亮相的AlphaFold,拿下了2018年的冠军。
初代AlphaFold为43个建模领域中的24个创建了高精度结构。这一结果,足以让许多人为之震惊。
但对于他们来说,AlphaFold的潜力还远远没有被开发。
若要真正取得成功,蛋白质预测结构必须达到90%准确率。
由此,Hassabis和团队一起继续埋头深耕。
但是,无论他们如何努力,都无法突破技术瓶颈。
彼时的团队成员,早已疲惫不堪。
惊喜的是,一位刚刚入职的员工John Jumper提出了对AlphaFold改进的突破性想法。John Jumper:迎接生物化学的「重大挑战」
作为AlphaFold的第一作者,DeepMind的高级研究科学家John Jumper曾在2021年被评为Nature年度十大人物。
曾经,对宇宙的着迷促使他开始学习物理学和数学。
但2008年,当他开始在一家利用超算模拟蛋白质及其动力学的公司工作时,开始意识到物理学知识可以帮助解决医学问题。
2011年,攻读理论物理学博士学位时,为了节省算力,他开始开发更简单、巧妙的方法,来模拟蛋白质动力学。
2017年,他完成了博士学位,听说谷歌DeepMind在秘密开发预测蛋白质的技术后,他发送了求职申请。
因为在蛋白质模拟方面的经验,他对如何改进AlphaFold有着创新性的想法,所以在团队遇到瓶颈后,他获得了晋升。
随后,他和Hassabis共同领导了开发AlphaFold 2的工作。革新后的AI模型取得惊人结果
新版本的AlphaFold2,融入了Jumper对蛋白质的深入认知。
团队还开始使用Transformer,因而比以前更灵活地在海量数据中找到模式,有效地确定为了特定目标应该关注什么。
训练AlphaFold 2时,他们用了所有已知蛋白质结构和氨基酸序列数据库中的大量信息,而AlphaFold 2在第十四届CASP竞赛中表现优异。
当CASP的组织者在2020年评估结果时,他们意识到:生物化学50年来的挑战已经结束。
在大多数情况下,AlphaFold2的表现几乎与X射线晶体学一样好,这实在令人惊叹。
AlphaFold2的工作原理一本关于细胞的教科书改变了David Baker的人生轨迹
David Baker最初进入哈佛大学时,选择了哲学和社会科学。
然而,在一门进化生物学课程中,他偶然接触到了经典教科书《Molecular Biology of the Cell》的第一版。正是
这本书,彻底改变了他的人生方向。
自此,他开始探索细胞生物学,最终对蛋白质结构产生了浓厚兴趣。
1993年,Baker进入华盛顿大学担任研究组长,开始直面生物化学领域的这个「重大挑战」。
通过一系列巧妙的实验,他开始探索蛋白质如何折叠。90年代末,他试着开发一款能预测蛋白质结构的软件,由此Rosetta诞生。
在1998年,Bake使用Rosetta首次参加CASP竞赛,表现异常出色。
这也启发了他的创新性想法:反向使用这个软件。
如果能输入所需的蛋白质结构,获得氨基酸序列的建议,就能创造全新的蛋白质,而非仅仅将氨基酸序列输入Rosetta,得到蛋白质结构。Baker:从头设计蛋白质的先驱
20世纪90年代末,蛋白质设计领域开始蓬勃发展。
在许多情况下,研究人员对现有蛋白质进行定向改造,使它们能够执行新的功能,比如降解环境污染物或在化学制造业中充当催化剂。
然而,天然蛋白质的功能范围毕竟是有限的。为了突破这一局限性,增加蛋白质的潜力,Baker的研究小组提出了一个大胆的想法:从头设计全新的蛋白质。
这种想法从何而来?Baker曾经有一个形象的比喻:
「如果你想造一架飞机,你不会从改造一只鸟开始;相反,你会深入理解空气动力学的基本原理,然后基于这些原理构建全新的飞行器。」
Baker的这种从零开始的蛋白质设计方法,开创了蛋白质工程领域的新纪元,为未来的生物技术和医学应用提供了无限可能。独特蛋白质的诞生:从头设计的突破
构建全新蛋白质,被称为「从头设计」(de novo design)。
Baker团队首先绘制了一种全新结构的蛋白质,然后利用名为Rosetta的软件计算出能够产生所需蛋白质的氨基酸序列。
Rosetta先搜索数据库中所有已知的蛋白质结构,寻找与目标结构相似的短蛋白质片段;随后,软件利用蛋白质能量图的基本知识,优化这些片段,并提出了最终的氨基酸序列。
为了验证软件的效果,Baker的研究小组将设计的氨基酸序列对应的基因引入到细菌中,使其产生目标蛋白质。随后,他们使用X射线晶体学技术确定了蛋白质的实际结构。
结果令人振奋:Rosetta确实成功构建了预期的蛋白质。这个观察到的名为Top7的蛋白质结构几乎完全符合他们的设计,标志着蛋白质工程领域的重大突破。
Top7——第一个与所有已知现有蛋白质完全不同的蛋白质Baker实验室的惊人创造
对于蛋白质设计领域的研究人员来说,Top7的出现无疑是一个里程碑。
此前,从头设计蛋白质的尝试仅限于模仿自然界已存在的结构。而Top7的独特结构在自然界中前所未见。
更令人惊叹的是,它由93个氨基酸组成,比之前使用从头设计方法生产的任何蛋白质都要大得多,这相当于在分子尺度上构建了一个微型的「蛋白质大厦」。
Baker于2003年发表了这一开创性发现,并慷慨地公开了Rosetta的源代码,这一举动极大地推动了全球研究社区对该软件的持续开发和创新应用,为蛋白质设计领域注入了新的活力。
随着这些突破性成果的涌现,2024年诺贝尔化学奖的轮廓已经初现。曾经需要数年的工作现在只需几分钟
当Demis Hassabis和John Jumper确认AI蛋白质结构预测工具AlphaFold2真的有效时,便开始了所有人类蛋白质结构的计算。
随后,他们预测了研究人员在探索地球生物多样性过程中,发现的几乎所有2亿种蛋白质的结构。
不仅如此,谷歌DeepMind还公开了AlphaFold2的代码,任何人都可以访问。
如今,这个AI模型已成为研究人员的宝贵资源。截至2024年10月,已有来自190个国家的超过200万名用户使用了AlphaFold2。
以前,获得一个蛋白质结构通常需要数年时间,而且并不总是能成功。现在只需几分钟就能完成。
虽然这个AI模型并非完美,但它能估计所产生结构的正确性,因此研究人员能够了解预测结果的可靠程度。
利用AlphaFold2预测的蛋白质结构
在2020年CASP竞赛之后,David Baker意识到了基于Transformer的AI模型的潜力。
随后,他便将其添加到Rosetta软件中,从而促进了蛋白质设计的发展。
近年来,一个又一个令人惊叹的人工设计蛋白质从Baker的实验室涌现。
利用Rosetta软件设计的人工蛋白质
AI的影响力,已经渗透进了诺贝尔奖的各个领域,不知接下来是否还会有惊喜。
参考资料:
https://www.nobelprize.org/prizes/chemistry/2024/press-release/
https://www.nobelprize.org/prizes/chemistry/2024/popular-information/
END
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近日,礼来在Clinicaltrials.gov注册了LY3537031治疗减重的一期临床试验。
该研究由3部分组成,A部分将研究LY3537031在超重和肥胖受试者中的安全性和耐受性;B部分和C部分将研究LY3537031在健康受试者中的安全性和耐受性;C部分将只包括日本和中国的健康受试者。研究将对受试者进行血液学检查,旨在测量LY3537031的血药浓度及半衰期;此外,受试者的体重将被监测。该研究将持续开展约20周,不包括筛选期。
一
关于LY3537031
LY3537031是一款胰高血糖素样肽1(GLP-1)/葡萄糖依赖性促胰岛素多肽(GIP)双靶点受体协同激动剂。GLP-1是当下最火的降糖减重明星靶点,GIP是一种肠促胰岛素,由小肠上部的K细胞分泌,正常生理条件下,餐后GIP水平大约是GLP-1的四倍。与GLP-1不同的是,GIP具有糖依赖的促胰高血糖素性和促胰岛素性,即低血糖条件下刺激胰高血糖素分泌,高血糖条件下刺激胰岛素分泌。与单一胰高糖素样肽-1受体激动剂(GLP-1RA)相比,多靶点药物的开发将提供更大的治疗潜力。
二
关于礼来在GLP-1领域的布局
据不完全统计,目前礼来在GLP-1领域共布局10余款药物;
除早期布局的单靶点GLP-1RA药物艾塞那肽、度拉糖肽以外,GLP-1/GIP双重激动剂替尔泊肽自2022年5月首次获美国食品药品监督管理局(FDA)批准上市后,一跃成为礼来的新王牌。2023年,替尔泊肽降糖版Mounjaro和减重版Zepbound累计贡献超53亿美元的销量。除替尔泊肽和本次进入I期临床的LY3537031外,在GLP-1/GIP双重激动剂布局的药物还包括另外一款药物LY3493269,未来期待企业披露更多关于上述药物的研究数据。
此外,公司与信达生物合作开发的胰高血糖素样肽-1受体(GLP-1R)/胰高血糖素受体(GCGR)双重激动剂玛仕度肽(IBI362),在今年2月和8月向国家药品监督管理局(NMPA)药品审评中心(CDE)分别提交减重和降糖适应症的上市申请获受理。作为一种胃泌酸调节素创新化合物(OXM3),玛仕度肽利用脂肪酰基侧链延长作用时间,允许每周给药一次。玛仕度肽是国内研发进度最快的双靶点GLP-1RA;除了GLP-1R激动剂具有的促进胰岛素分泌、降低血糖和减轻体重等作用外,玛仕度肽还可能通过GCGR的激活具有增加能量消耗和改善肝脏脂肪代谢等效应。胰高血糖素(GCG)由胰腺α-细胞在低水平血糖时分泌,通过刺激糖原分解和糖异生来提高血糖浓度,从而改善低血糖状态,将GLP-1R激动剂的厌食和降糖作用以及GCGR介导的能量消耗增加作用相结合,具有较大应用前景。
除双靶点抑制剂外,公司还有一款三重激素受体激动剂retatrutide(LY3437943),能够同时激活GLP-1、GIP和GCGR,具有改善代谢功能和促进体重减轻的潜力。2024年6月,公司在Nature
Medicin杂志上发表了retatrutide治疗代谢功能障碍相关脂肪肝病(MASLD)的IIa期临床数据,显示该药物能够显著减少MASLD患者的肝脏脂肪含量,且存在剂量依赖性,最高降幅可达86%,并与体重减轻、腹内脂肪减少和代谢指标改善相关。
另外,礼来还有一款药物orforglipron,是小分子GLP-1领域进展最快的产品,处于临床3期研究阶段。相对于其他口服肽类,orforglipron在服用过程不受食物或水的限制,具有一定的优势。II期临床显示,在至少有一种体重相关合并症(不包括2型糖尿病)的肥胖或者超重成年患者中,Orforglipron显示出显著的体重减轻;在26周时,Orforglipron组Hb1Ac降低2.1%,而安慰剂和度拉糖肽组分别为0.4%和1.1%,达到了主要和次要治疗终点。
三
关于GLP-1药物市场
除礼来的替尔泊肽外,诺和诺德的司美格鲁肽是全球GLP-1药物中的销量最高的药物,最早于2021年在中国获批用于糖尿病的治疗,2023年全球销售额达212亿美元;据悉,司美格鲁肽原研药专利在中国的有效期截止至2026年,目前国内企业齐鲁、九源基因、丽珠等多家企业正在布局司美格鲁肽相关业务。除此以外,国内企业仁会生物开发的贝那鲁肽、翰森制药开发的洛塞那肽、以及华东医药、通化东宝/科兴、正大天晴开发的GLP-1药物均已在国内陆续获批。
国内获批的GLP-1药物
根据灼识咨询数据,2022年全球GLP-1市场规模约为198.5亿美元,预计2030年将快速增长至552亿美元,占全球整体糖尿病药物市场57%。根据IQVIA抽样统计估测数据,2023年GLP-1激动剂药物国内终端销售金额为人民币60.58亿元;有分析师预测,2030年我国GLP-1的市场规模将超600亿元。
参考资料
1、Clinicaltrials网站
2、医药笔记、Hanson临床科研、猎药人俱乐部、澎湃新闻、人民日报
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