Yunnan Meina Biotechnology Co., Ltd.

本文转自测序中国公众号2025年美国医学遗传学与基因组学学会年会（ACMG）本月在洛杉矶举行，来自世界各地的医学遗传学与基因组学领域顶级专家、业内相关公司等汇聚于此，分享最新研究成果，促进临床遗传学和基因组学的科学和实践。罕见病虽然发病率低，但全球累计影响了超3亿患者，其误诊率高达40%，通常会造成治疗延误并给患者及家庭带来沉重医疗负担。传统外显子测序因无法检测非编码区突变、结构变异等，漏诊率高达80%。近期研究显示，通过将全基因组测序（WGS）和生信分析技术相结合可全面检测基因组变异，提高诊断率。在2025年ACMG年会上，因美纳展示了WGS以及改进后的生物信息学如何成功解决罕见遗传病案例，凸显了临床全基因组测序（cGS）和先进生物信息学软件在诊断罕见遗传病方面的强大能力。据悉，这些研究成果来自因美纳实验室服务（ILS），ILS是因美纳公司旗下经CLIA及CAP认证且获得纽约州批准的临床实验室，通过将因美纳的产品转化应用于临床检测，推动基因组学解决方案的普及。基因组测序在两例诊断困难的病例中检测到转座子(Transposable Element, TE)插入在全基因组范围内，部分区域因重复序列、染色体缺失或核苷酸重复等问题，难以进行精准测序，进而干扰了对人类发育和功能至关重要的基因检测。因美纳联合华盛顿大学、桑福德儿童专科诊所和Le Bonheur儿童医院开展的研究中，针对两个病例，外部实验室虽检测到一种基因变异，但鉴于患者疑似患有常染色体隐性遗传病，理论上应存在两种致病变异。该研究基于ILS技术，借助全基因组测序（WGS），成功发现了第二种致病变异。该研究综合运用了cGS、光学基因组图谱以及先进的生物信息学分析等技术手段。在病例1中，不仅确认了既往发现的AGL基因变异，还发现了新的Alu元件插入变异，该变异引发了外显子跳跃和移码突变；在病例2中，除确认POMT1基因变异外，还发现了新的转座子元件插入变异，导致移码突变及蛋白质功能丧失。该研究表明，检测转座子元件（TEs）能够显著提高诊断率。作为一线检测方法，cGS能够发现多种类型的基因变异，对于疑似遗传病患者具有重要意义。它不仅能够缩短诊断时间，减少侵入性检测，还能为遗传咨询提供关键信息，从而改善患者的诊疗过程。因美纳实验室服务的临床实验室主任Akanchha Kesari博士表示：“借助先进的生物信息学和有针对性的解读，这种类型的变异可以通过短读长技术轻松检测到。这将有助于我们为更多仍在寻求答案的患者提供诊断。”全基因组测序识别单亲二体(Uniparental Hetero and Isodisomy)人类正常情况下拥有23对染色体，每对同源染色体中一条来自父亲，另一条来自母亲。然而，单亲二体（Uniparental Disomy, UPD）是一种特殊的遗传异常现象，指的是某对同源染色体完全或部分仅来自父母一方。其中，单亲异二体（Uniparental Heterodisomy, UPhD）是指一对染色体均来自父母一方的两条同源染色体，而单亲同二体（Uniparental Isodisomy, UPiD）则是指一对染色体来自父母一方的同一条染色体。这两种情况均可能导致染色体上某些基因无法正常发挥作用。在与华盛顿大学医学院合作的另一项研究中，报道了一例因单亲异二体和单亲同二体导致的非典型1b型假性甲状旁腺功能减退症（PHP1b）病例。该病例中，通过对一名自幼出现骨骼异常等症状的27岁男性及其父母进行三人临床全基因组测序（Trio cGS）及分析，发现患者20号染色体存在单亲异二体和单亲同二体，且与GNAS基因相关的母源性印迹缺失，为诊断提供了有力证据。外部实验室通过其他检测方式进一步证实了这一结果，从而为患者做出了可靠的分子诊断。该研究显示，Trio cGS可用于检测单亲二体，有助于诊断印记疾病，即使临床表现复杂或不典型，这种方法也具有重要的应用价值。临床基因组测序数据进行重分析可提高诊断率尽管cGS在诊断儿科急性护理及门诊罕见遗传病方面已显示出一定作用，但仍有部分病例未能确诊。在因美纳的这一项研究中，研究人员对美国新生儿重症监护病房（NICU）的351例新生儿的cGS数据进行了回顾性重新分析。他们从存档的FASTQ文件出发，利用DRAGEN DNA分析流程（v4.0）和Emedgene（v32）进行变异检测、注释、分析和优先级排序。结果显示，重新分析使诊断率提高了4%。该研究证明，对历史病例进行系统重新分析是可行且有效的。因美纳医学基因组学实验室服务高级总监Denise Perry是一位经过专业认证且持有执照的遗传咨询师，她在10年前加入因美纳。她指出：“我们使用更新后的DRAGEN分析流程和Emedgene软件对整个队列进行重新分析，不仅找到了之前相同的诊断变异，还因技术进步和信息更新，为14名患者额外找到了准确的诊断结果。”同时强调技术进步和信息更新对提高诊断率的重要性，这不仅体现了因美纳对产品和解决方案持续改进的承诺，也反映了整个领域在罕见病诊断方面的巨大进步。全外显子组测序实现高度同源HBA和SMN基因精准分型HBA1/2基因中的有害拷贝数变异（CNVs）可导致α-地中海贫血症，而SMN1/2基因中的CNVs则是脊髓性肌萎缩症（SMA）的致病因素。这两种疾病均为常染色体隐性遗传病，携带者频率较高，因此对HBA和SMN基因进行筛查是评估携带者状态的重要手段。然而，由于HBA和SMN基因与旁系同源基因具有高度同源性，常规测序和生物信息学分析难以准确分型。为解决这一难题，因美纳开发了DRAGEN SMN和DRAGEN HBA靶向检测程序，作为DRAGEN v4.0的一部分。此外，还设计了一种可添加到外显子组中的spike-in panel，结合使用可在外显子组测序数据中对HBA和SMN基因进行准确分型。该方法经验证具有高精度，其检测结果与正交方法（如全基因组测序，WGS）高度一致。同时，它解决了富集检测中探针捕获偏差的标准化问题，spike-in panel确保了对用于区分旁系同源基因拷贝数的内含子和基因间区域的覆盖。结  语因美纳在临床全基因组测序（cGS）领域的创新成果通过四张海报得以呈现，充分展现了公司在提升cGS检测诊断率方面的持续努力。Perry参与了海报内容的撰写，她指出：“cGS在罕见遗传病诊断中具有显著价值，能够高效覆盖基因组中与医学相关的区域，寻找潜在的致病DNA变异。为此，我们必须借助先进的生物信息学软件和工具，精准定位致病位点。” 前两张海报展示了因美纳在基因组中检测到的复杂DNA变异类型，这些变异不仅证实了患者的临床表型，还涵盖了以往常规cGS数据中难以测序和解读的变异。Perry总结道：“我们始终致力于改进产品和解决方案，为患者明确罕见病病因，并为医生提供精准的诊断信息，助力其制定最佳治疗方案。”.

美国加利福尼亚州圣迭戈——近日，因美纳公司（纳斯达克股票代码：ILMN）（以下简称 “因美纳”或 “公司”）就中国商务部于2025年3月4日发布的禁止公司向中国出口基因测序仪的公告进行了回应。因美纳充分尊重中国商务部的决定，并将继续遵循市场化、法制化原则开展全球运营，严格遵守包括中国在内的各市场所在国家或地区的法律法规。自进入中国市场以来，因美纳长期服务于本地区临床与科研客户。 因美纳首席执行官Jacob Thaysen表示，“我们持续专注于到2027年实现高个位数的营收增长，同时提升利润率。我们对公司的解决方案在全球市场面临的巨大机遇、公司的业务实力，以及持续引领基因组学和多组学创新以支持客户的公司战略充满信心”。 正如公司近期所强调的，因美纳将继续扩展其多组学产品组合，推出涵盖基因组学、空间组学、单细胞和甲基化的全新技术路线图，以及全新多模态数据分析平台。这些解决方案充分结合了因美纳领先NovaSeq X产品系列的强大性能，将帮助研究人员获得关于疾病驱动因素的突破性洞察。此外，公司还将继续投资于支持其核心测序和多组学业务的服务、数据和软件产品。上述每项投入均致力于为因美纳客户的重要工作提供支持，也是公司在2024年8月发布的战略更新落地的重要支撑。 因美纳还宣布，预计2025财年因美纳核心业务非GAAP摊薄后每股收益约为4.50美元。同时，公司正在为2025财年制定一项约1亿美元的增量成本削减计划。这些节余将帮助缓解有关大中华区业务营收和相关运营收入减少等多种潜在情景带来的影响。成本削减计划包括优化股票薪酬和非劳动力支出，以及加速部分生产力措施。 因美纳首席财务官 Ankur Dhingra 表示，“我们的2025财年新指导方针认为，来自中国的营收贡献将相对有限，且预计当前的宏观趋势会持续下去。公司将继续投资于我们的增长战略，同时采取措施以实现2025财年每股收益约4.50美元，并在此基础上继续增长。” 财务预期和指导 公司按非美国通用会计准则（Non-GAAP）提供前瞻性指导。公司无法提供前瞻性Non-GAAP财务指标与最直接可比的美国通用会计准则（GAAP）报告财务指标之间的对账，因为公司无法合理确定地预测以下项目的影响：收购相关费用、战略投资损益、或有对价的公允价值调整、未来潜在的资产减值、重组活动以及未决诉讼的最终结果。这些项目具有不确定性，本质上难以预测，取决于各种因素，并可能对指导期内的 GAAP 报告结果产生重大影响。出于同样的原因，公司无法解释无法获得的信息的重要性，这些信息可能对未来的业绩产生重大影响。 关于使用Non-GAAP财务指标的声明 公司报告的Non-GAAP业绩包括摊薄后每股收益、净收入、毛利率、运营费用，包括研发费用、销售及行政费用、法律突发事件及和解、商誉和无形资产减值、运营收入、运营利润率、毛利润、其他收入（费用）、税收准备金、固定汇率收入增长和自由现金流（按合并报表和适用的细分领域报表），这些业绩是对按照GAAP计算的财务指标的补充，而不是替代或优先于这些财务指标。公司按照GAAP计算的财务指标包括大量费用，如收购的无形资产摊销等，以及货币换算的影响。管理层在Non-GAAP衡量标准中排除了这些项目的影响，以帮助投资者分析和评估过去和未来的经营业绩。Non-GAAP净利润、摊薄后每股收益和营业利润率是公司董事会用来衡量管理层业绩和确定管理层薪酬重要内容的财务指标的关键组成部分。 公司鼓励投资者仔细考虑其按照公认会计原则计算的结果以及补充性非公认会计原则信息，以便更全面地了解公司业务。 前瞻性声明 本新闻稿可能包含涉及风险和不确定性的前瞻性声明。我们的业务会受到以下重要因素的影响，这些因素可能导致实际结果与任何前瞻性声明中的结果存在实质性差异：(i) 我们所服务市场的增长率变化；(ii) 我们产品和服务的客户订单数量、时间和组合；(iii) 我们调整运营支出以适应收入预期的能力；(iv) 中国商务部近期宣布将因美纳公司列入“不可靠实体清单”，中国商务部决定不允许因美纳向中国出口测序仪，以及美国政府及其贸易伙伴最近征收或威胁征收的关税，以及其他可能的关税或贸易保护措施；(v) 我们制造坚固耐用的仪器和耗材的能力；(vi) 与我们竞争的产品和服务的成功；(vii) 开发、制造和推出新产品和服务的固有挑战，包括扩大或修改制造业务，以及关键部件对第三方供应商的依赖；(viii) 最近推出或预先宣布的产品和服务对现有产品和服务的影响；(ix) 我们修订业务战略以实现预期运营目标的能力；(x) 我们从之前或未来精简和改进研发流程、降低运营成本以及最大化收入增长的行动中实现预期收益的能力；(xi) 我们进一步开发仪器、耗材和产品并将其商业化的能力；(xii) 部署新产品、服务和应用，以及为我们的技术平台拓展市场的能力；(xiii) 与收购 GRAIL相关的对我们产生额外诉讼的风险；(xiv) 我们获得第三方支付机构批准向患者报销产品费用的能力；(xv) 我们从政府机构获得产品监管许可的能力；(xvi) 我们与其他公司和组织成功合作开发新产品、拓展市场和发展业务的能力；(xvii) 不确定性或不利的经济和商业条件，包括经济增长放缓或不确定或武装冲突造成的不确定性或不利的经济和商业条件；(xviii) 公认会计原则的应用，这些原则非常复杂，涉及许多主观假设、估计和判断；以及 (xix) 立法、监管和经济发展，以及我们向美国证券交易委员会提交的文件中详述的其他因素，包括我们最近提交的 10-K 和 10-Q 表，或公开电话会议中披露的信息，电话会议的日期和时间已事先公布。我们没有义务，也不打算更新这些前瞻性声明，审查或确认分析师的预期，或提供有关本季度进展的中期报告或更新。 因美纳公司致力于推动和激发基因组学的发展而不断改善人类健康。专注创新使我们成为全球基因测序和芯片技术的领导者，并为全球范围的科研、临床和应用市场客户提供专业服务。我们的产品广泛应用于生命科学、肿瘤学、生殖保健、农业及其他新兴领域。欲了解更多信息，请访问www.illumina.com.cn或关注因美纳微信公众号。 联系方式   投资者关系： Salli Schwartz 858-291-6421 IR@illumina.com 媒体关系: Bonny Fowler +1.740.641.5579 pr@illumina.com .

2025年2月4日，中国商务部发布公告，将美国基因测序巨头因美纳公司（Illumina, Inc.）列入不可靠实体清单。这一决定引发了广泛关注，涉及中美经贸关系、中国基因测序行业的发展以及本土企业的机遇与挑战。 因美纳公司成立于1998年，总部位于美国加利福尼亚州，是一家专注于基因测序技术的研发与商业化应用的生物技术公司。其核心产品包括高通量基因测序仪、基因芯片及相关分析软件，广泛应用于医学研究、临床诊断、农业育种等领域。凭借技术垄断优势，因美纳长期占据全球基因测序市场约 80% 的份额，被誉为基因科技行业的 “谷歌”。自2005年进入中国市场以来，因美纳凭借其先进的测序平台和全面的服务，迅速赢得了众多学术界、医疗界和生物技术客户的青睐，其产品在中国市场占据主导地位，国内多家顶尖医疗机构、科研院所及生物医药企业均依赖其设备和技术。一、因美纳公司被列清单的原因 因美纳公司被列清单的主要原因是其违反正常的市场交易原则，中断与中国企业的正常交易，并对中国企业采取歧视性措施，严重损害了中国企业的合法权益。具体表现为： 中断交易与歧视性措施：因美纳公司在中国市场长期占据主导地位，但近年来却中断了与中国部分企业的正常交易，对中国企业采取了明显的歧视性措施，导致中国企业的合法权益受到严重损害。 技术垄断与市场霸权：因美纳凭借其在基因测序领域的技术垄断优势，长期占据全球约80%的市场份额。在中国市场，其设备和技术被广泛应用于医学研究、临床诊断、农业育种等领域，但近年来却通过技术封锁和市场限制手段，试图进一步巩固其垄断地位，对中国企业的正常发展构成阻碍。 数据安全与合规问题：基因测序涉及大量敏感数据，包括个人健康信息和国家生物安全数据。因美纳公司未能充分保障这些数据的安全与合规，存在数据外流和被滥用的风险，这对中国国家安全和公民隐私构成了潜在威胁。二、对因美纳公司的影响 产品和技术供应受限：因美纳公司在中国市场的业务将受到严格限制，其基因测序仪、试剂盒等关键设备和技术的供应可能会被切断或大幅减少。这将直接影响其在中国市场的销售收入和市场份额。 合作项目中断：因美纳与中国企业和科研机构的多项合作项目可能会被迫中断，尤其是那些依赖其技术和设备的科研项目。这不仅会影响项目的进度，还可能导致部分科研成果的延迟发布。 市场竞争力下降：随着中国本土基因测序企业的崛起，因美纳的技术垄断优势将逐渐被削弱。被列入不可靠实体清单后，其在中国市场的品牌声誉和市场竞争力将进一步下降，未来可能面临更大的市场份额流失风险。 2025年2月5日8时34分，微信公众号“Illumina因美纳”对该事件进行了声明回应。面对被列入不可靠实体清单的严峻形势，Illumina方面发表了公开声明，公司正对相关事情的影响进行详细评估，并积极寻求解决方案。 三、对中国基因测序行业的影响 短期挑战：因美纳的技术和设备在中国基因测序行业中占据重要地位，短期内其供应受限可能会导致部分科研机构和企业的项目进展受阻，特别是在高通量基因测序、精准医疗等领域。此外，寻找替代供应商可能会增加采购成本和技术转移的难度。 长期机遇：这一事件将促使中国基因测序行业加快自主创新和国产化进程。本土企业有望在政策支持下，加大研发投入，提升技术水平，逐步打破因美纳的技术垄断，实现从“跟跑”到“领跑”的跨越。例如，华大基因、华大智造等企业已经在测序设备和技术上取得了显著进展，未来有望进一步提升市场份额。 政策支持与市场重塑：政府可能会通过采购倾斜、税收优惠、研发专项资金等方式支持本土企业，推动全产业链的国产化。这将有助于提升中国基因测序产业的自主创新能力和市场竞争力，形成从设备到服务的完整产业链，增强行业的整体抗风险能力。四、对中美经贸关系的影响 加剧经贸摩擦：此次将因美纳列入不可靠实体清单，可能会进一步加剧中美之间的经济和技术摩擦，特别是在高科技领域。美国政府可能会采取反制措施，导致两国经贸关系更加复杂和紧张。 推动中国自主可控：从长远来看，这一事件将促使中国加快关键核心技术的自主可控进程，减少对国外技术的依赖。这不仅有助于提升中国在全球科技竞争中的地位，还将增强中国在国际经贸规则制定中的话语权。五、总结 因美纳公司被中国列入不可靠实体清单，是对其违反市场交易原则和损害中国企业权益行为的必要回应。这一决定虽然在短期内可能会给中国基因测序行业带来一定的挑战，但从长期来看，将为中国本土企业的崛起和行业的自主创新提供重要契机。同时，这也再次凸显了国际技术合作中的复杂性和技术“脱钩”的潜在风险。未来，中国应继续加强自主创新能力建设，推动基因测序行业的高质量发展，同时积极寻求与国际伙伴的平等互利合作，共同推动全球基因科技的进步。 参考资料：[1]Illumina被列入中国不可靠实体清单：挑战与机遇并存.抗体圈.2025年02月04日.[2]因美娜公司列入不可靠实体清单，影响几何？.狗哥聊IVD.2025年02月04日.[3]刚刚，中国将全球最大基因测序公司Illumina列入不可靠实体清单，可能带来哪些影响？.细胞自然科学.2025年02月04日. [4]Illumina发声明回应.医药财经.2025年02月05日. 识别微信二维码，可添加药时空小编 请注明：姓名+研究方向！