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2024年6月,在生物医药领域,3家公司采取IPO形式上市,1家公司SPAC合并上市,1家公司反向并购上市,1家公司进行分拆上市。
IPO上市
6月,有3家医药公司采用IPO形式上市,融资规模为7.57亿美元。
今年以来,生物医药领域已经有14家公司IPO上市,累计融资规模超22亿美元,其中不乏CG Oncology、Kyverna Therapeutics等IPO规模超3亿美元的公司。
IPO存在严重分化现象,在近两个月公开递交上市的医药公司有Artiva Biotherapeutics、Actuate Therapeutics等十余家,最终上市的仅有3家,甚至还出现了核药巨头Telix Pharmaceuticals撤销IPO的现象。
1、Rapport(NASDAQ:RAPP)
6月7日,Rapport Therapeutics在纳斯达克交易所上市,发行价为美股17美元,发行800万股,IPO规模达1.36亿美元,是今年第七家IPO规模超过1亿美元的创新药公司。
Rapport Therapeutics由著名生物医药投资机构Third Rock Ventures 和强生的投资部门JJDC联合成立于2022年,是一家专注于开发治疗神经系统疾病的精准靶向小分子药物公司,曾入选BioSpace评出的NextGen Class of 2024。
Rapport利用基因组学、蛋白质科学和大脑成像技术来识别用于神经药物的受体相关蛋白(RAP)。与传统疗法不同的是,Rapport利用RAP来发现选择性作用于基因和临床验证靶点的小分子疗法,以前所未有的精度靶向神经系统疾病病理生理学特定神经解剖区域的受体。
Rapport的创始人兼首席科学官David Bredt博士是受体相关蛋白(RAP)生物和治疗应用的开拓者,在20多年前就发现了RAP及其在调节受体表达和功能中的作用,并提出利用RAP来靶向特定神经元回路的设想,有潜力减少不需要的药物与靶标的相互作用,最终实现以更大的功效和更少的副作用来调节神经递质受体。
目前,Rapport仅有一款药物RAP-219,用于治疗耐药性癫痫症,处于临床一期研发阶段。
Rapport的管理团队经验丰富,创始人兼首席科学官David Bredt博士拥有20多年的神经科学药物研发经验,曾担任礼来公司神经科学副总裁和Janssen Neuroscience神经科学研发全球主管;首席执行官Abraham N.Ceesay博士曾担任Cerevel(被艾伯维收购)总裁、Tiburio Therapeutics首席执行官等职务。
Rapport亦有名声卓著的科学顾问委员会,包括诺奖得主、美国国家医学院和美国国家科学院的院士David Julius博士、诺奖得主、英国皇家科学学会院士David MacMillan博士、美国国家科学院院士Allan Basbaum博士、美国癫痫协会的前任主席Jeffrey L.Noebels博士等专家。
在一级市场,Rapport受到资本的追捧,进行了两轮融资:
2023年3月,公司完成了1亿美元的A轮融资。本轮融资由Third Rock Ventures、ARCH Venture和JJDC领投;
2023年8月,公司宣布完成1.5亿美元B轮融资。本轮融资由Cormorant Asset领投,富达、高盛、Third Rock Ventures、ARCH Venture、JJDC等机构跟投。
2、Alumis(NASDAQ:ALMS)
6月28日,Alumis(NASDAQ:ALMS)在美国纳斯达克交易所上市,发行价为每股16美元,发行1312.5万股,IPO规模达2.1亿美元,是今年以来,IPO发行规模第三大的创新药公司。
Alumis成立于2021年,由Foresite Capital旗下的Forsite Labs孵化设立,是一家专注于TYK2抑制剂在自体免疫性疾病领域运用的生物医药公司。
目前,Alumis有两款在研药物,其中进度最快的是ESK-001。该药物源自海思科旗下的子公司FT集团。
2021年,FT集团以6000万美元首付款,以及1.2亿美元里程碑的价格将TYK2项目转让给FL2021-001公司(Alumis的前身)。
ESK-001是一款高选择性且有Best-in-Class潜力的TYK2抑制剂,研发进度处于全球第三,仅次于BMS和武田。
ESK-001在其选择性、优化的分子性质/药代动力学、最大化靶点抑制效应、更好的耐受性等方面均具有差异化的优势。在不久前发布的治疗中重度斑块状银屑病的临床二期STRIDE试验中,ESK001的数据优异:
有效性方面,228例银屑病患者随机接受5种剂量ESK-001或安慰剂治疗12周后,治疗组均达到了PASI 75的主要终点与关键的次要疗效终点,并且展现出明显的剂量依赖性;
安全性方面,治疗组没有出现与治疗相关的严重不良事件,AE发生率与安慰剂组相近。
Alumis计划在2024年下半年推进ESK-001用于治疗中重度斑块状银屑病的3期试验,同时开展两项治疗系统性红斑狼疮和非传染性葡萄膜炎的2期临床试验。随着今年下半年ESK-001的三期临床启动,海思科预计将收到第二个里程碑付款(约1284.32万美元)。
Alumis的另一款药物A-005是一种中枢神经系统渗透性变构TYK2抑制剂,用于治疗神经炎症和神经退行性疾病,2024年4月在健康志愿者中启动了A-005的临床一期试验,测试其在健康志愿者中的安全性和耐受性,预计在今年年底前发布初步结果。
公司CEO Martin Babler于曾担任Principia Biopharma的总裁兼CEO(被赛诺菲收购)与Talima Therapeutics的总裁兼CEO。在此之前,他曾在Genentech、礼来担任免疫学副总裁等多个职位。
在一级市场,Alumis在3年时间累计融资5.29亿美元(不含IPO融资),从金额上来看,Alumis凭借ESK-001获得的融资金额已经远超引进资产的潜在总成本(为什么license-out的中国药物常被赚取差价?):
2021年5月,Alumis完成的7000万美元A轮融资,由创始股东Foresite Capital投资;
2022年1月,Alumis完成2亿美元的B轮融资。本轮融资投资方有Matrix Capital、Baker Brothers、Foresite Capital等机构;
2024年3月,Alumis完成2.59亿美元的C轮融资。本轮融资由Foresite Capital、Samsara、venBio Partners共同领投,Cormorant Asset、SR One、礼来亚洲、Nextech、Ally Bridge 、HBM Healthcare、Omega Funds、Piper Heartland Healthcare、AyurMaya等机构跟投。
TYK2赛道属于biotech领域的热点之一,多家TYK2药企获得融资或合作:
2022年12月,武田与Nimbus Therapeutics就TYK2抑制剂TAK-279(此前名为NDI-034858)达成了总额60亿美元的合作;
2023年1月,TYK2药物公司Myrobalan获得2400万美元的A轮融资;
2024年1月,TYK2药物公司Sudo Bio完成1.47亿美元的B轮融资。
3、Tempus AI(NASDAQ:TEM)
6月14日,Tempus AI在美国纳斯达克交易所上市,发行价为每股37美元,发行1110万股,IPO规模达4.1亿美元。
Tempus AI成立于2015年,是一家人工智能驱动的精准医疗公司。公司的创始人是知名创业者Eric Lefkofsky,他曾创立多家互联网企业,包括礼品网站Starbelly、打印采购服务公司InnerWorkings、货运物流公司Echo Global Logistics和广告分析公司MediaBank。
其中最为知名的是团购网站Groupon,该公司在2011年在纳斯达克上市,市值一度超过177亿美元,Lefkofsky财富也达到了数十亿美元。
Tempus开发了一个数据网络,包括专有软件和专用数据管道,以提供低价测序服务为切口,自建了CLIA认证的自动化实验室,覆盖了2000多个医疗机构的约450个独特数据库,已经积累了超过9亿份文档,560万份匿名患者记录,其中包括约13亿页丰富的临床文档、100万条带有图像数据的记录、超过90万条带有与基因组信息相关的匹配临床记录,以及超过22万条带有完整转录组谱的记录。
目前,基于庞大的数据库,Tempus提供三项产品:
基因组学产品线:利用tempus的实验室为医疗保健服务提供商、生命科学公司、研究人员和其他第三方提供NGS诊断、分子基因分型及解剖和分子病理学测试;
数据和服务产品线:主要有两个产品,一是Insights产品,tempus授权相关的临床、分子和成像去识别数据库,并为制药和生物技术公司提供一套分析和云计算工具。二是试验服务,利用公司在肿瘤学领域合作的医生网络,为制药公司提供临床试验支持,让制药公司有机会接触到难以找到和服务不足的患者群体。
人工智能平台Next:利用机器学习主动识别和减少肿瘤和心脏病患者的护理差距,亦计划利用大语言模型、生成式人工智能和临床数据库来开发算法诊断。
根据2023年的收入,Tempus的产品已被约95%的制药公司采用,客户包括葛兰素史克、辉瑞、阿斯利康等。
Tempus在上市之前已经累计获得九轮总计13亿美元的融资,其中不乏软银、普信集团、诺德诺德、富兰克林邓普顿基金、谷歌等知名机构。
2023年,Tempus收入达5.32亿美元,同比增长65.73%,2024年Q1,公司实现了1.46亿美元的收入,不过公司尚未盈利,2022年和2023年分别亏损2.9亿美元和2.14亿美元。
Tempus未来的战略重点是将其产品服务扩展到肿瘤学以外的其他疾病类别,例如癌症、心脏病学、神经心理学和放射学的人工智能诊断和个性化医疗。
SPAC上市
6月,生物医药领域仅有1家公司完成与SPAC公司的合并,但公司质量较为一般。
反向并购上市(Reverse Merger)
5-6月,共有1家生物医药公司宣布了反向并购上市。
1、Reneo(NASDAQ:RPHM)
5月13日,Reneo(NASDAQ:RPHM)宣布与OnKure合并,合并后的实体将作为OnKure运营,将继续在纳斯达克交易所以OKUR的代码上市。
在宣布合并的同时,Reneo(NASDAQ:RPHM)获得6500万美元的PIPE融资,投资方有Acorn Bioventures, Cormorant Asset, Deep Track, Perceptive Advisors, Samsara bioccapital, Surveyor Capital (Citadel旗下公司)和Vestal Point Capital,预计合并完成后的公司拥有1.2亿美元的现金。
OnKure总成立于2011年,是一家表观遗传疗法研发公司,旨在延迟对药物靶向治疗的耐药性和利用合成致死性来治疗患者。
OnKure的研发管线主要是选择性P13Kα H1047R抑制剂。PI3Kα是癌症中最常见的突变癌基因,而PI3Kα h1047r是该基因中最常见的突变,在15%的乳腺癌和4%的癌症中都有发现。虽然靶向PI3Kα的新型药物已被批准,但这些治疗方法缺乏突变选择性,通过抑制各种组织中该蛋白的正常版本,导致相当大的靶毒性。
OnKure的药物OKI-219是一款潜在best in class的高选择性PI3Kα H1047R口服抑制剂,于2024年2月进入临床一期阶段,旨在评估OKI-219作为晚期实体瘤患者的单药治疗和晚期乳腺癌患者的内分泌治疗或HER-2靶向治疗的安全性、耐受性、药代动力学、药效学和疗效。
OnKure的两项临床前药物也属于P13Ka靶点领域,一款药物针对H1047X突变,另一款药物则针对E542K和E545K突变。
其他公司也在开发对PI3Kα突变的疗法,包括Relay Therapeutics正在研究一种泛选择性抑制剂、Scorpion Therapeutics也有自己的小分子突变选择性阻滞剂,同样处于1期研究中,而礼来公司也有一种PI3Kα抑制剂。
OnKure成立至今一共完成了8轮,共计约1.198亿美元的融资,其中不乏贝莱德、Perceptive Advisors、Acorn Bioventures等知名机构,以及德联资本、龙磐资本等中资机构。
分拆上市(Spin-Off)
6月,有1家公司以分拆的方式在纳斯达克交易所上市。
1、Grail(NASDAQ:GRAL)
6月25日,Grail从母公司Illumina(NASDAQ:ILMN)分拆,在纳斯达克交易所上市。
Grail成立于2016年,是一家癌症早筛公司,由全球基因测序巨头Illumina投资1亿美元设立,此后获得了强生、亚马逊、麦肯锡、工商银行、高瓴资本、红杉资本、通和毓承等多家知名机构的投资。
成立四年内,Grail累计融资约9亿美元,2017年,以2.78亿美元的价格从Illumina手中赎回了股份。在CCGA(循环游离基因组图谱)计划一期完成后,Grail身价暴涨,成为炙手可热的明星独角兽公司,并于2020年9月申请在纳斯达克交易所上市。担心失去机会的Illumina迅速以80亿美元的价格收购了Grail。
自2021年起,这起并购就受到美国联邦贸易委员会(FTC)和欧盟监管机构的起诉,在经历三年的拉锯战之后,最终Illumina决定放弃并购Grail,并担负4.76亿美元的创纪录罚单,仅保留Grail公司14.5%的股权,剩余85.5%的股权将全部无偿分配给Illumina的股东。在此期间,Illumina的市值也从750亿美元,暴跌至150亿美元,跌幅达80%。
Grail的泛癌早筛采用的是ctDNA检测路线,只需要抽取受试者的外周血液,对血液中的游离DNA(cell-free DNA,cfDNA)进行检测,通过分析cfDNA中的ctDNA含量及其特征,即可判断该受试者是否罹患癌症以及癌症的类型。
Grail的核心产品Galleri已经于2021年6月在美国上市,是全球首款泛癌种血检产品,可筛选覆盖50多个癌种的超过10万个甲基化区域的超过100万个CpG位点,作为处方检测用于对癌症高危人群进行早期筛查。
不过,自Galleri上市后,Grail的业绩表现差强人意,2022年收入仅为0.55亿美元,亏损6.26亿美元,于2023年实现9300万美元的总营收,同比增长68%,但同期营业亏损高达15亿美元。今年Q1季度,Grail营收再度同比增长36%达到2700万美元,但营业亏损依旧有2.27亿美元。
Grail持续亏损的原因主要是样本需求量大、随访时间长,导致研发费用高。据Grail预测,Galleri拿证和进医保的时间点大概在2026年下半年,期间仍需要近10亿美元的投入,而公司目前仅有2亿美元的现金储备,在失去Illumina的支持后,能否度过下一个冬天仍存在不确定性。
Grail缘起于全球癌症早筛先驱Exact Sciences的示范,后者以10年市值增长近50倍,而受到资本市场的追捧,在Exact Sciences的成功激励下,众多企业也想通过布局癌症早筛后来居上,Grail也是其中之一。
在Grail申请上市的2020年,来自中国的癌症早筛公司泛生子和燃石医学先后登陆纳斯达克,市值分别高达14.14亿美元和16.8亿美元。如今,泛生子已经完成私有化退市,估值仅为1.26亿美元,燃石医学的市值不足0.8亿美元。
而曾经的行业先驱Exact Sciences的股价也已经跌去近70%,在同行纷纷遇阻的情况下,Grail的发展之路或许并不平坦。
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解密生命运作的本质一直是全球科学家的目标。
生物学研究的复杂性要求研究人员不仅需要考虑单个基因或遗传模式,还要考虑生物体的全部遗传信息(基因组)及其更多的功能,由此对基因测序技术也提出了越来越多的要求。
上世纪70年代出现的一代测序技术虽然准确度高,且在构建载体、基因敲除等实验中得以广泛应用,但其在通量、成本、读长、速度等方面均存在劣势。随后出现的二代测序技术(NGS)能够同时对上百万甚至数十亿个DNA分子进行测序,实现了大规模、高通量的测序,但在读长与速度方面依旧没有明显提升。
在计算机学、生物学和化学等多个学科领域的结合发展下,出现了三代测序技术(SMRT)。该技术的测序读长可以达到几十kb级别,解决了一、二代测序技术短读长的问题。
长读长测序由于读长超长,能够对短读长测序无法处理的区域进行测序:如端粒,高重复区域以及复杂的结构变异,照亮了此前基因组中的暗区域。长读长测序能够检测长度为1000到20000个碱基或更长的DNA(或RNA)片段。这些片段通常来自于“原生”分子,这些分子是直接从生物样本中提取出来进行分析的。相比之下,大多数短读长测序技术只能检测50-300个碱基长度的片段。
2022年,长读长测序被《Nature Methods》评为年度技术,开始越来越多地应用于各类重要的研究项目中,尤其是在处理基因组中复杂且具有挑战性的区域时展现出极大的潜力。
2022年3月,Science首次公布人类基因组完整测序结构。在这项研究中,T2T联盟利用长读长测序PacBio Hifi及ONT,完成了人类基因组中最后8%剩余区域的测序。该区域正是此前20年来,短读长测序始终无法解决的区域。
2023年5月,首个人类泛基因组草图于Nature公布。其中,PacBio HiFi和ONT的长读长测序数据,使得新的基因组参考图谱能够更清楚地发现结构变化。
目前,长读长测序主要以PacBio公司的HiFi测序和Oxford公司的Nanopore Technologies(ONT)为代表。
基于读长和准确性的需求,
HiFi测序优势显著
三代测序最早是2000年代初由PacBio公司提出来的。
当时,Stephen Turner博士和Jonas Korlach博士在康奈尔大学进行研究,他们意识到现有基因测序技术的局限性,并决心开发一种新型的测序技术。这一愿景促使他们在2004年共同创立了Pacific Biosciences。
2005年,PacBio开发出了基于零模式波导(ZMW)阵列的SMRT测序技术,实现了长达数万个碱基的DNA分子实时测序。与传统的短读长测序技术相比,SMRT技术能够一次性读取单个DNA分子的完整序列,从而提供更长的读长和更高的准确性。这一技术的关键在于其独特的纳米流体芯片,能够在单个分子层面上实时观察DNA聚合酶的活动,从而实现对DNA序列的直接读取。
2010年,PacBio完成了首次公开募股,成功在纳斯达克上市,股票代码为PACB。这标志着公司正式进入公众视野,并获得了更广泛的资金支持。
经过数年研发和技术创新,PacBio在2011年推出了其首款商业化测序系统——PacBio RS。这一系统的推出标志着长读长测序技术正式进入市场,为基因组学研究和应用开辟了新的可能性。PacBio RS的推出不仅巩固了公司在基因测序领域的领导地位,也吸引了众多投资者的关注。
随着技术的不断进步,PacBio继续扩大其产品线。2016年,PacBio推出了Sequel系统,这是对前一代RS系统的显著提升,在读长、吞吐量和效率方面都有了显著提升。
此后,PacBio又在2019年和2020年分别推出了Sequel II和Sequel IIe高通量测序仪,进一步提高了测序精确度,并且与多个项目和公司展开合作,如SolveRD项目、All Of Us项目等。
HiFi测序是所有PacBio长读测序仪器上运行的核心化学技术,是PacBio的科学家基于基因组分析中对长度和准确性的双重需求所开发,为基因组学研究提供了前所未有的深度和精度。
基于该技术的成功,2021年PacBio从软银获得了9亿美元的投资,也为公司未来几年扩展运营规模和新产品开发注入了新鲜血液。截至2023年,PacBio的财务报告显示公司收入显著增长,年度收入同比增长56%,表明公司的市场认可度和产品需求持续上升。
测序读长最高达25000个碱基,
准确性达99.9%
HiFi测序是一种单分子、长读长度的测序技术,能够生成长且准确的读取序列。
目前,PacBio的HiFi测序读长最高可达25000个碱基,而短读长测序技术通常在500个碱基以内。在实现读长超长的基础上,HiFi测序还能使准确性达到99.9%。综合读长和准确性指标,使得HiFi测序能够在基因组学中极具技术挑战的领域大放异彩。
同其它高通量测序类似,HiFi测序同样是边合成边测序,但HiFi测序无需进行PCR扩增,而是对提取出来的原生分子的DNA片段直接进行测序,因此被称为“高保真测序”(HiFi即High-Fidelity的缩写)。
至于为什么HiFi测序无需进行PCR扩增,并且能够兼顾长读长与准确性,还要从它的技术原理说起。
首先,HiFi的测序文库十分特别,在线状的DNA片段两端,插入发夹型衔接子,形成一个环状的模板。其次,将引物和聚合酶添加到这个模板上,形成DNA复合物。这样建库的好处是,由于DNA片段形成了一个完整的圆环,就能够对其进行周而复始的滚换复制、滚环测序,从而提高测序的准确度。
SMRTcell芯片是HiFi测序的核心,用于在PacBio长读长测序仪器上进行HiFi测序的化学反应过程。SMRTcell芯片的内部表面包含几百万个纳米级小孔,称为ZMW(零模波导)孔。文库构建完成后,这些经过处理的DNA分子会被随机铺撒到ZMW中。
玻璃底板预先标有链酶亲合素,DNA分子上的聚合酶标有生物素,利用生物素合酶亲合素的亲合力,DNA分子就能通过分子上的聚合酶被固定在ZMW小孔的玻璃底板上。
测序的聚合反应就在这些小孔中进行,并产生相应的DNA序列数据,但并不是所有小孔都能输出有效数据。
这是因为,DNA分子是被随机撒入小孔,但只有固定了单个DNA分子的小孔,才能输出有效数据。若小孔是空的,则不能产生信号。若小孔中撒入了多个DNA分子,则会产生杂乱的信号,在后期的数据分析中,将会被去除。
由此可见,HiFi的测序通量受到ZMWs的限制。在SMRTcell芯片内,密集排列的ZMWs越多,一次可以测序的分子数量就越多,测序通量也就越高。
SMRTcell芯片再升级,
测序通量飞跃式提高
近年来,PacBio对SMRTcell芯片进行了升级,使其测序通量有了飞跃式提高。目前,PacBio系列中最强大的芯片是Revio SMRTcell芯片,芯片内集成有2500万个ZMWs。根据官方数据,在特定条件下,一张Revio SMRTcell芯片24小时可生成高达90GB的HiFi序数据。
当DNA分子被铺入SMRTcell芯片后,就会加入带有荧光标记的dNTP底物。这些dNTP底物在其磷酸基团上被标记四种不同颜色的荧光基团,分别代表四种碱基。
反应时,当一种与正要合成的碱基一致的dNTP经过时,就会被酶较长时间地抓住。激发光从小孔的底部照进来,打在被抓住的dNTP上,就会发出荧光,仪器根据拍到的荧光颜色,就可以判断是哪种碱基了。
由于测序小孔直径很小,激发光的穿透能力会逐渐衰减,只能在小孔中传输很短的距离,所以只有当dNTP足够靠近底部,荧光基团才会被激发光照到,发出荧光。而其它游离的dNTP因为停留短暂,发出的噪音就会被抑制到很低的水平。
在一个聚合反应结束后,焦磷酸基团连通带着的荧光基团一起从原来的dNTP上掉下来,并被溶液带走,然后开始下一个聚合反应。
HiFi测序对单个碱基的判读并没有非常高的准确率,但好在它的错误都是随机的,不存在偏向性,因此,可以通过增加对同一个序列的重复检测,来提升数据的准确性。
此外,前文提到HiFi的测序文库中,DNA分子复合物是环状模型。测序时,DNA聚合酶在样品DNA分子的环状结构周围工作多次,类似于赛车在环形赛道上重复绕圈。由于聚合酶在ZMW孔中产生了DNA分子的多个副本,因此PacBio长读长测序系统可以通过交叉参照每个分子的副本来确定样品DNA的正确序列,从而提高准确性。这一优化方式就是循环一致性测序(CCS)。
兼具长读长与准确性,
但面临成本挑战
综上所述,HiFi测序的优势可以总结为五个方面。首先HiFi是基于单分子测序,测序模板为单独的DNA链,因此可以用来区分相似序列之间的区别。
其次是长读长,HiFi测序能够提供15,000-20,000个碱基对或更长的读长,能够让基因组组装变得更加准确、高效。此外,超长的读长使其可以对完整的mRNA直接进行从头测序,获得全长转录本序列。
同时,HiFi测序具备高准确性,通过循环一致性测序,HiFi测序能够生成>99.9%准确性的reads。
此外,HiFi测序无需PCR扩增,通过消除PCR扩增所带来的偏差,HiFi测序能够分析其它技术通常难以获取的基因组区域,如AT和GC富含区域、高度重复区域、长同源聚合物和回文序列。
最后,HiFi测序可直接检测到碱基的被修饰状态。在测序中,遇到甲基化的碱基,聚合反应速度将明显放慢,且光谱特性也会发生改变,从而可以直接检测到碱基的甲基化状态。
HiFi测序的技术特性决定了其在一些复杂基因组研究中具有独特优势,为一些使用其它技术手段无法解决的问题提供了新的解决途径。
目前,PacBio HiFi测序具有显著优势的应用场景分别为单倍型分型、基因组组装、变异检测以及表观遗传学研究等。
其中,在单倍型分型方面,HiFi测序长读长、高准确度的特性使之能够用来帮助研究者区分每个染色体的拷贝或单倍型(例如母系或父系遗传)之间的差异,生成完全定相的二倍体基因组组装(而非忽略同源染色体之间差异的折叠基因组组装)。
在基因组组装领域,HiFi测序能够帮助研究人员高效、准确地进行高质量的基因组组装,相较于其它测序技术有着明显的优势。在高重复基因组、大型复杂基因组、异源多倍体基因组甚至同源多倍体基因组组装中都能获得更高质量和连续性的基因组。
在变异检测领域,HiFi测序能够检测从单核苷酸到结构变异等所有类型的变异,包括一些基因组中十分难以检测的区域,如串联重复和高度重复序列区域。
在表观遗传学研究方面,HiFi测序能够在测序中直接获取碱基修饰信息(如甲基化)及传统的碱基识别数据,为研究人员在人类和其他生物的基因表达遗传性变化方面提供了新的可能性。
此外,由于甲基化数据与其他HiFi应用程序同时生成,研究人员可以在单倍型分区和变异调用的基因组上准确定位和研究表观遗传效应。
当然,该测序技术也存在一定缺点。比如原始错误率较高,需要通过重复检测来提升准确性;价格昂贵,测序成本高;以及测序读长及准确性受DNA聚合酶活性影响,而DNA聚合酶活性会受到检测激光的影响等等。
8亿美元并购,
长读平台与短读市场并行
2024年2月,PacBio公布2023年财报。2023年全年,PacBio的收入为2.006亿美元,比2022年的1.283亿美元增长了56%。
2023年公司在产品营收从上年的1.087亿美元跃升69%,至1.839亿美元,服务和其他营收从1960万美元下降15%,至1660万美元。仪器收入为1.205亿美元,比2022年的4870万美元增长了一倍多;耗材收入为6340万美元,比前一年的6000万美元增长了6%。
其中,2023年第四季度产品收入总计5400万美元,比2022年第四季度的2280万美元增长了137%;服务和其他收入从460万美元下降了4%至440万美元;仪器收入总计3510万美元,比2022年第二季度的610万美元增长了五倍多,主要是由于Revio平台的持续采用;消耗品收入为1890万美元,比1670万美元增长了13%,创下了该公司的纪录。
PacBio在2023年的收入增长了 56%,之前三年的总收入增长了 154%,令人印象深刻,行业也对其未来三年的增长预期较高。此前PacBio还曾预测2024年全年收入将在2.3至2.5亿美元之间,比2023年2亿美元多点的收入增长15%至25%。
然而根据公司最新预测,预计2024年收入将在1.7亿美元至2亿美元之间。公司财报发布之后,当日股价下跌13.94%。尽管试剂耗材业务增长,但毛利率腰斩至16%,增收不增利问题未解决。投资者对PacBio的成功持怀疑态度。
这同样也基于PacBio新的战略选择。此前,PacBio在长度长测序领域做的很好,发展目标也很明确,通过不断提升测序的通量、以此来降低长读的成本。通过发布Revio,Pacbio HiFi长读已经开始在大人群研究中发挥作用。
在长读长测序市场之外,PacBio也涉足短读市场。2021年7月,PacBio花费8亿美元并购Omniome。然而由于短读市场现在已经变得十分拥挤,超过 Q50 的准确性似乎并不能真正带来商业化的成功。PacBio还没有公布过Onso短读测序平台的真正销量,过去的很长时间似乎都在围绕着构建产能展开。
同时支持两个技术路线多个平台的持续开发和商业化,或许会放慢其前进的脚步。截至目前,公司所有的收入都来自于长读测序平台。
PacBio称将“继续开发我们的台式长读和高通量短读平台”,似乎已经不再讲之前路线图上提及的超高通量长读平台。很多人都在疑问,为什么还要加倍投入高通量短读,而不是超高通量的长读?短读市场虽然大得多,但高通量短读到时是否会有竞争力?
但这一战略选择,事实上也是由于PacBio在长读测序上面临两个大的挑战:一是成本特别是前置仪器成本太高;二是应用及市场空间有限。
此外,在制定2024年的目标时,该公司也考虑了几个影响设备采购的宏观经济因素,包括中国的融资环境,这也影响了该公司进一步扩大在中国的Revio安装基地的能力。
测序成本低于1美元/Gb,
国内打造超低成本测序平台
众所周知,技术与性能发展到一定程度时,“成本”始终是广泛应用的决定因素。而根据AlbertVilella的统计,在仪器部署成本10万美金以内、单位数据产出成本1美金以内的消费范维,是目前测序领域的“无人区”。
目前,二、三代测序技术均是基于光信号的测序技术,都需要昂贵的光学监测系统,并依赖DNA聚合酶读取碱基序列,大大地増加了测序的成本。因此,在保证高通量、高精度的情况下,开发“低成本长读长测序”产品是行业亟需的发展方向。
基因测序技术是我国目前鲜有能够参与国际化竞争的创新技术。2023年6月,中国人群泛基因组联盟(CPC)利用PacBio HiFi测序,组装构建了首个高精度中国人泛基因组参考图谱。
国内企业聚焦成本挑战,开发了具有成本优势的测序仪。比如,安序源利用多交叉学科先进技术路线的天然优势,已经布局了纳米孔测序仪及配套方案、微阵列芯片检测仪及检测试剂盒、POCT检测产品等完善的产品矩阵方案,并在中美多地建立研发中心,并广泛吸纳全球不同专业范畴人才,不断获取全球产业资源,推进自身产业研发进程。
较高的仪器部署成本使得基层仪器部署数量难以提升,大规模普及困难,仅能通过“中心化检测”使用,但又徒生出样本运输、患者异地就医等隐形成本。其次,较高的单位数据产出成本使得在终端应用场景下的消费价格较高,可支付人群较少,且数据积累较少、较慢,不利于技术升级、产品迭代。同时,对于测序企业而言,较高的单次开机成本使得需要通过凑样来分摊成本,而凑样时间的不确定性也让测序企业在检测周期降低方面始终处于被动。
安序源发布了AXP100-RS基因测序仪,集成低成本、长读长、高精度、体积小、检测快的核心优势,对于国内基因测序仪的良性发展具有显著的行业价值。
据了解,该测序系统背后联动的是第四代纳米孔基因测序平台,涵盖测序全流程的产品体系,从样本处理、核酸提取,到文库制备试剂Xprep kit 100,再到长读长测序涉及的测序仪AXP100-RS、测序芯片XPU100、测序试剂Xseq kit 100,以及Xconsole 100操作运行与数据分析系统。安序源为其领先的基因测序技术配套了完整的软硬件支持,确保了测序水平的稳定性,实现了低成本测序。
其测序仪核心零部件XPU100测序芯片传承了Bio-CMOS芯片AC阻抗检测灵敏度高、测序快、通量灵活的优点,同时提升了抗干扰能力与搭载通量,并在保证最大数据产出可达100Gb的情况下,测序成本远低于1美金/Gb。
也就是说,安序源采用全球最先进的半导体技术,打造出了最低成本的测序平台,让基因测序看到了“随开随测”的可能。
当前,长读长测序的发展已经到了一个非常关键的时候。如果能够解决成本问题,并且这些配套的技术,相关的领域能够跟上的话,或许可以找到很多新的应用场景,帮助这个技术领域更快推向市场。
*封面图片来源:壹图网
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各位亲爱的股东,大过节的,没什么特别的事情分享。
我们来看一个我们此前报道过公司的后续。
这家融资到G-5轮的NGS+A.I.公司准备IPO了
2024年5月22日,我们刚聊过Tempus,这家融资到G-5轮的“奇葩”准备上市了。
但是具体的时间、定价并不清楚,这次,我们蹲到了后续。
据报道,本次将发行1110万股,定价35-37美元/股,募集约4亿美元。
上市后,Tempus将以TEM为交易代码。
而我们,则又多了一个观察的标的。
大家都这道,这货融到G-5轮了。
那么,这G-5轮的融资是谁投的呢。
正是“大善人”软银,融了2亿美元。
不知道为啥,总让我想起了Wework,希望这是我的错觉。
好啦,今天就到这里吧。
安心过节安心过节~心里过不去的可以留言:博主好短。
END
啊对对对对,扫描这货
能联系到我
至此,各位股东星标了么?点赞了么?转发了么?在看了么?谢谢!
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这次,他们不装了
注1:https://www.renaissancecapital.com/IPO-Center/News/105026/Precision-medicine-company-Tempus-AI-sets-terms-for-$400-million-IPO
100 项与 Qingdao Softbank Urban Construction Co., Ltd. 相关的药物交易
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